Obiba×Opal Administration機能
Opalの管理機能の概要を簡単にお伝えいたします。 ここでのOpalのバージョンは3.02となります。 まず、Opalにアドミニストレータでサインインします。 右上のAdministrationをクリックします。 表示さ … 続きを読む
R×ggplot2 階層的クラスタリングの結果を可視化する方法
R言語のggplot2パッケージを用いて階層的クラスタリングの結果を可視化する方法についてお伝えいたします。 一般に、階層的クラスタリングの結果は、デンドログラムまたは樹形図として可視化されます。ggplot2パッケージ … 続きを読む
Obiba×Ubuntu20.04 Opalのインストール後に行う設定
Opalのインストールが完了しても、ただちに使える状態にはなりません。 使える状態にするためには、データベースの登録およびR言語の設定が必要になります。 Opalは、データベースのバックエンドとして、MongoDBおよび … 続きを読む
Obiba×Ubuntu20.04 Opalをインストールする方法
Ubuntu Server 20.04にOpalをインストールする方法をお伝えします。 Opalは、OBiBaのコアデータウェアハウスで、データのインポートおよびエクスポート、変換などをWEBインターフェイスを用いて管理 … 続きを読む
R×Ubuntu20.04 R4.1のインストール手順
Ubuntu 20.04 LTSにRをインストールする方法についてお伝えします。 作業は端末上で行うため、端末を起動しておきます（ショートカットキー：Ctrl+Alt+t）。 Ubuntuのバージョンを確認 Ubuntu … 続きを読む
さくらVPSのUbuntuでラピッドSSLの期限を更新する手順
当サイトはさくらVPS上のUbuntu 18.04LTSでWordPressを構築して運用しております。 以前、当サイトをHTTPからHTTPSへ移行する手順（さくらVPSのUbuntuでWordPressをHTTPから … 続きを読む
Ubuntu18.04 GENEONTOLOGYのgo.oboをjson形式に変換する方法
title: UbuntuでGENEONTOLOGYのgo.oboをjson形式に変換する方法 url: how-to-convert-geneontology-obo-to-json-on-ubuntu GENEONT … 続きを読む
R言語 CRAN Task View：追跡データの処理と分析
CRAN Task View: Processing and Analysis of Tracking Dataについて、機械翻訳を交えて日本語化し掲載しております。 概要 Maintainer: Rocío Joo, … 続きを読む
Ubuntu18.04 任意のバージョンのNode.jsをインストールする方法
Ubuntu18.04で、任意のバージョンのNode.js環境を構築する方法をお伝えいたします。 aptコマンドによりNode.jsをインストールしようとすると、かなり古いバージョンがインストールされます。 そのため、最 … 続きを読む
R×ggparty 決定木の可視化
決定木の可視化において、とても柔軟性が高いggpartyパッケージをご紹介します。 ggpartyパッケージは、ggplot2の機能をpartykitに拡張し、partyクラスのツリーオブジェクトのために明瞭に構造化され … 続きを読む