BioconductorのExperimentDataパッケージの一覧をご紹介します。英語での説明文をgoogle翻訳を使用させていただき機械的に翻訳したものを掲載しました。パッケージを探す参考にしていただければ幸いです。
パッケージ確認日：2023/12/01
パッケージ数：429
1. ALL
A data package
データパッケージ
2. TCGAbiolinksGUI.data
Data for the TCGAbiolinksGUI package
TCGAbiolinksGUIパッケージのデータ
3. celldex
Reference Index for Cell Types
セルタイプの参照インデックス
4. HSMMSingleCell
Single-cell RNA-Seq for differentiating human skeletal muscle myoblasts (HSMM)
ヒト骨格筋筋芽細胞（HSMM）を区別するための単一細胞RNA-Seq
5. airway
RangedSummarizedExperiment for RNA-Seq in airway smooth muscle cells, by Himes et al PLoS One 2014
気道平滑筋細胞におけるRNA-SeqのRangedSummarizedExperiment、Himes et alによるPLoS One 2014
6. scRNAseq
A Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
公共のシングルセルRNAシーケンスデータセットのコレクション
7. geneLenDataBase
Lengths of mRNA transcripts for a number of genomes
いくつかのゲノムのmRNA転写産物の長さ
8. pasilla
Data package with per-exon and per-gene read counts of RNA-seq samples of Pasilla knock-down by Brooks et al., Genome Research 2011.
Brooksら、Genome Research 2011によるPasillaノックダウンのRNA配列サンプルのエクソン単位および遺伝子単位の読み取りカウントを含むデータパッケージ。
9. tximportData
tximportData
tximportData
10. bladderbatch
Bladder gene expression data illustrating batch effects
バッチ効果を説明する膀胱遺伝子発現データ
11. ChAMPdata
Data Packages for ChAMP package
ChAMPパッケージ用データパッケージ
12. sesameData
Supporting Data for SeSAMe Package
SeSAMeパッケージのサポートデータ
13. Illumina450ProbeVariants.db
Annotation Package combining variant data from 1000 Genomes Project for Illumina HumanMethylation450 Bead Chip probes
イルミナのための1000のゲノムプロジェクトからの変形データを結合している注釈パッケージヒトメチル化450ビーズチッププローブ
14. GSVAdata
Data employed in the vignette of the GSVA package
GSVAパッケージのビネットで採用されているデータ
15. TENxPBMCData
PBMC data from 10X Genomics
10X GenomicsのPBMCデータ
16. bcellViper
Human B-cell transcriptional interactome and normal human B-cell expression data
ヒトB細胞転写インタラクトームと正常ヒトB細胞発現データ
17. msdata
Various Mass Spectrometry raw data example files
各種質量分析生データサンプルファイル
18. depmap
Cancer Dependency Map Data Package
がん依存マップデータパッケージ
19. dorothea
Collection Of Human And Mouse TF Regulons
ヒトおよびマウスTFレギュロンのコレクション
20. minfiData
Example data for the Illumina Methylation 450k array
Illumina Methylation 450kアレイのデータ例
21. affydata
Affymetrix Data for Demonstration Purpose
デモ目的のAffymetrixデータ
22. msigdb
An ExperimentHub Package for the Molecular Signatures Database (MSigDB)
Molecular Signatures Database (MSigDB)のExperimentHubパッケージ
23. gageData
Auxillary data for gage package
ゲージパッケージの補助データ
24. RTCGA.clinical
Clinical datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectの臨床データセット
25. RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
Aligned reads from RNAseq experiment: Transcription profiling by high throughput sequencing of HNRNPC knockdown and control HeLa cells
RNAseq実験からの整列リード：HNRNPCノックダウンおよび対照HeLa細胞のハイスループットシークエンシングによる転写プロファイリング
26. curatedMetagenomicData
Curated Metagenomic Data of the Human Microbiome
ヒトミクロバイオームの管理メタゲノムデータ
27. curatedTCGAData
Curated Data From The Cancer Genome Atlas (TCGA) as MultiAssayExperiment Objects
MultiAssayExperimentオブジェクトとしての癌ゲノムアトラス（TCGA）からのキュレーションデータ
28. pasillaBamSubset
Subset of BAM files from “Pasilla” experiment
「Pasilla」実験からのBAMファイルのサブセット
29. FlowSorted.Blood.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted blood cell populations
選別された血球集団に関するIllumina HumanMethilationデータ
30. fission
RangedSummarizedExperiment for time course RNA-Seq of fission yeast in response to stress, by Leong et al., Nat Commun 2014.
ストレスに応じた分裂酵母の経時的RNA-Seqの範囲拡大実験、Leong et al。、Nat Commun 2014による。
31. golubEsets
exprSets for golub leukemia data
ゴルブ白血病データのexprSet
32. DropletTestFiles
Test Files for Single-Cell Droplet Utilities
シングルセル液滴ユーティリティ用テストファイル
33. faahKO
Saghatelian et al. (2004) FAAH knockout LC/MS data
サガテリアン他（2004）FAAHノックアウトLC / MSデータ
34. systemPipeRdata
systemPipeRdata: NGS workflow templates and sample data
systemPipeRdata：NGSワークフローテンプレートとサンプルデータ
35. CLL
A Package for CLL Gene Expression Data
CLL遺伝子発現データのためのパッケージ
36. parathyroidSE
RangedSummarizedExperiment for RNA-Seq of primary cultures of parathyroid tumors by Haglund et al., J Clin Endocrinol Metab 2012.
Haglundら、J Clin Endocrinol Metab 2012による、副甲状腺腫瘍の初代培養物のRNA-SeqについてのRangedSummarizedExperiment。
37. DMRcatedata
Data Package for DMRcate package
DMRcateパッケージ用データパッケージ
38. ELMER.data
Data for the ELMER package
ELMERパッケージのデータ
39. pRolocdata
Data accompanying the pRoloc package
pRolocパッケージに付随するデータ
40. KEGGdzPathwaysGEO
KEGG Disease Datasets from GEO
GEOのKEGG病データセット
41. macrophage
Human macrophage immune response
ヒトマクロファージ免疫応答
42. FlowSorted.DLPFC.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted frontal cortex cell populations
分類された前頭皮質細胞集団に関するイルミナのヒトメチル化データ
43. FlowSorted.Blood.EPIC
Illumina EPIC data on immunomagnetic sorted peripheral adult blood cells
免疫磁気選別末梢成人血液細胞に関するIllumina EPICデータ
44. RTCGA.mRNA
mRNA datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのmRNAデータセット
45. spatialLIBD
LIBD Visium spatial transcriptomics human pilot data inspector
LIBD Visium 空間トランスクリプトノミクスヒトパイロットデータインスペクター
46. zebrafishRNASeq
Zebrafish RNA-Seq Experimental Data from Ferreira et al. (2014)
FerreiraらからのゼブラフィッシュRNA-Seq実験データ。 （2014年）
47. EGSEAdata
Gene set collections for the EGSEA package
EGSEAパッケージの遺伝子セットコレクション
48. RTCGA.rnaseq
Rna-seq datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのRna-seqデータセット
49. MouseGastrulationData
Single-Cell Transcriptomics Data across Mouse Gastrulation and Early Organogenesis
マウスの原腸形成と初期器官形成における単一細胞のトランスクリプトミクスデータ
50. muscData
Multi-sample multi-group scRNA-seq data
マルチサンプルマルチグループscRNA-seqデータ
51. flowWorkspaceData
A data package containing two flowJo, one diva xml workspace and the associated fcs files as well as three GatingSets for testing the flowWorkspace, openCyto and CytoML packages.
flowWorkspace、openCytoおよびCytoMLパッケージをテストするための2つのflowJo、1つのdiva xmlワークスペース、および関連するfcsファイル、ならびに3つのGatingSetを含むデータパッケージ。
52. HDCytoData
Collection of high-dimensional cytometry benchmark datasets in Bioconductor object formats
Bioconductorオブジェクトフォーマットでの高次元サイトメトリーベンチマークデータセットの収集
53. QDNAseq.hg19
QDNAseq bin annotation for hg19
hg19のQDNAseq binアノテーション
54. JASPAR2016
Data package for JASPAR 2016
JASPAR 2016用データパッケージ
55. ewceData
The ewceData package provides reference data required for ewce
ewceData パッケージは、ewce に必要なリファレンスデータを提供します。
56. RnBeads.hg19
RnBeads.hg19
RnBeads.hg19
57. tweeDEseqCountData
RNA-seq count data employed in the vignette of the tweeDEseq package
tweeDEseqパッケージのビネットで採用されているRNA-seqカウントデータ
58. ALLMLL
A subset of arrays from a large acute lymphoblastic leukemia (ALL) study
大急性リンパ芽球性白血病（ALL）研究からのアレイのサブセット
59. RforProteomics
Companion package to the ‘Using R and Bioconductor for proteomics data analysis’ publication
「プロテオミクスデータ分析のためのRおよびバイオコンダクターの使用」出版物へのコンパニオンパッケージ
60. breastCancerVDX
Gene expression datasets published by Wang et al. [2005] and Minn et al. [2007] (VDX).
Wangらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2005]およびMinn et al。 [2007]（VDX）。
61. SpikeInSubset
Part of Affymetrix’s Spike-In Experiment Data
Affymetrixのスパイクイン実験データの一部
62. leukemiasEset
Leukemia’s microarray gene expression data (expressionSet).
白血病のマイクロアレイ遺伝子発現データ（expressionSet）。
63. microbiomeDataSets
Experiment Hub based microbiome datasets
Experiment Hubベースのマイクロバイオームデータセット
64. breakpointRdata
Strand-seq data for demonstration purposes
デモンストレーション用のストランドシーケンスデータ
65. methylclockData
Data for methylclock package
Methylclockパッケージ用データ
66. DAPARdata
Data accompanying the DAPAR and Prostar packages
DAPARおよびProstarパッケージに付随するデータ
67. MOFAdata
Data package for Multi-Omics Factor Analysis (MOFA)
マルチオミクス因子分析（MOFA）用データパッケージ
68. RTCGA.miRNASeq
miRNASeq datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのmiRNASeqデータセット
69. DLBCL
Diffuse large B-cell lymphoma expression data
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫の発現データ
70. Hiiragi2013
Cell-to-cell expression variability followed by signal reinforcement progressively segregates early mouse lineages
細胞間発現変動とそれに続くシグナル強化は初期マウス系統を漸進的に分離する
71. HiContactsData
HiContacts companion data package
HiContactsコンパニオンデータパッケージ
72. easierData
easier internal data and exemplary dataset from IMvigor210CoreBiologies package
IMvigor210CoreBiologiesパッケージの内部データと例示データセットをより簡単にする
73. crisprScoreData
Pre-trained models for the crisprScore package
crisprScoreパッケージのための事前学習済みモデル
74. humanStemCell
Human Stem Cells time course experiment
ヒト幹細胞タイムコース実験
75. breastCancerMAINZ
Gene expression dataset published by Schmidt et al. [2008] (MAINZ).
Schmidtらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2008]（MAINZ）。
76. STexampleData
Collection of spatially resolved transcriptomics datasets in SpatialExperiment Bioconductor format
SpatialExperiment Bioconductorフォーマットの空間的に分解されたトランスクリプトームデータセットのコレクション
77. RnBeads.hg38
RnBeads.hg38
RnBeads.hg38
78. TENxBrainData
Data from the 10X 1.3 Million Brain Cell Study
10×130万の脳細胞研究からのデータ
79. SBGNview.data
Demo gene expression datasets for SBGNview package
SBGNviewパッケージの遺伝子発現データセットのデモ
80. SFEData
Example SpatialFeatureExperiment datasets
SpatialFeatureExperimentのデータセット例
81. RTCGA.mutations
Mutations datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectの突然変異データセット
82. chipenrich.data
Companion package to chipenrich
chipenrichのコンパニオンパッケージ
83. AffymetrixDataTestFiles
Affymetrix data files (CEL, CDF, CHP, EXP, PGF, PSI) for testing
テスト用Affymetrixデータファイル（CEL、CDF、CHP、EXP、PGF、PSI）
84. mosaicsExample
Example data for the mosaics package, which implements MOSAiCS and MOSAiCS-HMM, a statistical framework to analyze one-sample or two-sample ChIP-seq data for transcription factor binding and histone modification
MOSAiCSおよびMOSAiCS-HMMを実装するモザイクパッケージのデータ例、転写因子結合およびヒストン修飾について1サンプルまたは2サンプルのChIP-seqデータを分析するための統計的フレームワーク
85. TCGAWorkflowData
Data for TCGA Workflow
TCGAワークフローのデータ
86. h5vcData
Example data for the h5vc package
h5vcパッケージのデータ例
87. RnaSeqSampleSizeData
RnaSeqSampleSizeData
RnaSeqSampleSizeData
88. HCAData
Accessing The Datasets Of The Human Cell Atlas in R/Bioconductor
R / Bioconductorでのヒト細胞アトラスのデータセットへのアクセス
89. IlluminaDataTestFiles
Illumina microarray files (IDAT) for testing
テスト用のIlluminaマイクロアレイファイル（IDAT）
90. minfiDataEPIC
Example data for the Illumina Methylation EPIC array
Illumina Methylation EPICアレイのデータ例
91. yeastExpData
Yeast Experimental Data
酵母実験データ
92. breastCancerNKI
Genexpression dataset published by van’t Veer et al. [2002] and van de Vijver et al. [2002] (NKI).
van’t Veerらによって発表された遺伝子発現データセット。 [2002]およびvan de Vijver et al。 [2002]（NKI）。
93. chromstaRData
ChIP-seq data for Demonstration Purposes
デモンストレーション目的のChIP-seqデータ
94. GWASdata
Data used in the examples and vignettes of the GWASTools package
GWASToolsパッケージの例とビネットで使用されているデータ
95. AneuFinderData
WGSCS Data for Demonstration Purposes
デモンストレーション目的のWGSCSデータ
96. estrogen
Microarray dataset that can be used as example for 2×2 factorial designs
2×2の要因計画の例として使用できるマイクロアレイデータセット
97. NxtIRFdata
Data for NxtIRF
NxtIRFのデータ
98. ReactomeGSA.data
Companion data package for the ReactomeGSA package
ReactomeGSAパッケージのコンパニオンデータパッケージ
99. breastCancerUPP
Gene expression dataset published by Miller et al. [2005] (UPP).
Millerらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2005]（UPP）。
100. DuoClustering2018
Data, Clustering Results and Visualization Functions From Duò et al (2018)
Duòet al（2018）のデータ、クラスタリング結果および可視化関数
101. fibroEset
exprSet for Karaman et al. (2003) fibroblasts data
KaramanらのexprSet。 （2003）線維芽細胞データ
102. RnBeads.mm10
RnBeads.mm10
RnBeads.mm10
103. bsseqData
Example whole genome bisulfite data for the bsseq package
bsseqパッケージの全ゲノム亜硫酸水素塩データの例
104. ccdata
Data for Combination Connectivity Mapping (ccmap) Package
組み合わせ接続マッピング（ccmap）パッケージのデータ
105. mCSEAdata
Data package for mCSEA package
mCSEAパッケージ用データパッケージ
106. nullrangesData
ExperimentHub datasets for the nullranges package
nullrangesパッケージのExperimentHubデータセット
107. RnBeads.mm9
RnBeads.mm9
RnBeads.mm9
108. antiProfilesData
Normal colon and cancer preprocessed affy data for antiProfile building.
通常の結腸癌および癌は抗プロファイル構築のための前処理されたアフィニティーデータです。
109. breastCancerTRANSBIG
Gene expression dataset published by Desmedt et al. [2007] (TRANSBIG).
Desmedtらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2007]（TRANSBIG）
110. RTCGA.methylation
Methylation datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectのメチル化データセット
111. yeastNagalakshmi
Yeast genome RNA sequencing data based on Nagalakshmi et. al.
Nagalakshmiらに基づく酵母ゲノムRNA配列決定データ。 al。
112. MSMB
Data sets for the book ‘Modern Statistics for Biology’
本「生物学のための現代統計学」のためのデータセット
113. plotgardenerData
Datasets and test data files for the plotgardener package
plotgardenerパッケージのデータセットとテストデータファイル
114. signatureSearchData
Datasets for signatureSearch package
signatureSearchパッケージのデータセット
115. RegParallel
Standard regression functions in R enabled for parallel processing over large data-frames
大きなデータフレームでの並列処理を可能にするRの標準回帰関数
116. RTCGA.CNV
CNV (Copy-number variation) datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのCNV（コピー数変動）データセット
117. SingleCellMultiModal
Integrating Multi-modal Single Cell Experiment datasets
マルチモーダル単細胞実験データセットの統合
118. TabulaMurisSenisData
Bulk and single-cell RNA-seq data from the Tabula Muris Senis project
Tabula Muris SenisプロジェクトのバルクおよびシングルセルのRNA-seqデータ
119. genomationData
Experimental data for showing functionalities of the genomation package
genomationパッケージの機能を示すための実験データ
120. simpIntLists
The package contains BioGRID interactions for various organisms in a simple format
このパッケージには、さまざまな生物に対するBioGRIDインタラクションが単純な形式で含まれています
121. TENxVisiumData
Visium spatial gene expression data by 10X Genomics
10X Genomics社のVisium空間遺伝子発現データ
122. NanoporeRNASeq
Nanopore RNA-Seq Example data
ナノポアRNA-Seq例データ
123. TabulaMurisData
10x And SmartSeq2 Data From The Tabula Muris Consortium
Tabula Murisコンソーシアムの10倍およびSmartSeq 2データ
124. yeastRNASeq
Yeast RNA-Seq Experimental Data from Lee et al. 2008
Leeらの酵母RNA-Seq実験データ。 2008年
125. mtbls2
MetaboLights MTBLS2: Comparative LC/MS-based profiling of silver nitrate-treated Arabidopsis thaliana leaves of wild-type and cyp79B2 cyp79B3 double knockout plants. Böttcher et al. (2004)
MetaboLights MTBLS2野生型およびcyp79B2 cyp79B3二重ノックアウト植物の硝酸銀処理Arabidopsis thaliana葉のLC / MSに基づく比較プロファイリングベッチャー等。 （2004年）
126. curatedOvarianData
Clinically Annotated Data for the Ovarian Cancer Transcriptome
卵巣癌トランスクリプトームの臨床的注釈付きデータ
127. Fletcher2013a
Gene expression data from breast cancer cells under FGFR2 signalling perturbation
FGFR2シグナリング摂動下の乳癌細胞からの遺伝子発現データ
128. RTCGA.RPPA
RPPA datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのRPPAデータセット
129. MouseThymusAgeing
Single-cell Transcriptomics Data of the Ageing Mouse Thymus
加齢マウス胸腺のシングルセル・トランスクリプトミクスデータ
130. SomaticCancerAlterations
Somatic Cancer Alterations
体細胞がんの変化
131. beadarrayExampleData
Example data for the beadarray package
beadarrayパッケージのデータ例
132. COHCAPanno
Annotations for City of Hope CpG Island Analysis Pipeline
希望都市CpGアイランド分析パイプラインのアノテーション
133. hapmapsnp6
Sample data – Hapmap SNP 6.0 Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap SNP 6.0 Affymetrix
134. CopyhelpeR
Helper files for CopywriteR
CopywriteRのためのヘルパーファイル
135. FIs
Human Functional Interactions (FIs) for splineTimeR package
splineTimeRパッケージの人間機能的相互作用（FI）
136. GSE62944
GEO accession data GSE62944 as a SummarizedExperiment
要約実験としてのGEO登録データGSE62944
137. breastCancerUNT
Gene expression dataset published by Sotiriou et al. [2007] (UNT).
Sotiriouらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2007]（UNT）。
138. COSMIC.67
COSMIC.67
コスミック67
139. gcspikelite
Spike-in data for GC/MS data and methods within flagme
GC / MSデータのスパイクインデータとflagme内のメソッド
140. M3DExampleData
M3Drop Example Data
M3Dropサンプルデータ
141. QDNAseq.mm10
Bin annotation mm10
ビンアノテーションmm10
142. yeastCC
Spellman et al. (1998) and Pramila/Breeden (2006) yeast cell cycle microarray data
スペルマン等。 （1998）およびPramila / Breeden（2006）酵母細胞周期マイクロアレイデータ
143. JASPAR2014
Data package for JASPAR
JASPAR用データパッケージ
144. metaMSdata
Example CDF data for the metaMS package
metaMSパッケージのCDFデータの例
145. QUBICdata
Data employed in the vignette of the QUBIC package
QUBICパッケージのビネットで採用されているデータ
146. rcellminerData
rcellminerData: Molecular Profiles and Drug Response for the NCI-60 Cell Lines
rcellminerData：NCI-60細胞株の分子プロファイルと薬物応答
147. hapmapsnp5
Sample data – Hapmap SNP 5.0 Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap SNP 5.0 Affymetrix
148. PREDAsampledata
expression and copy number data on clear cell renal carcinoma samples
明細胞腎癌サンプルの発現とコピー数のデータ
149. GenomicDistributionsData
Reference data for GenomicDistributions package
GenomicDistributionsパッケージのリファレンスデータ
150. leeBamViews
leeBamViews — multiple yeast RNAseq samples excerpted from Lee 2009
leeBamViews – Lee 2009から抜粋した複数の酵母RNAseqサンプル
151. PepsNMRData
Datasets for the PepsNMR package
PepsNMRパッケージ用のデータセット
152. RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
RcisTarget motif databases for human (hg19) – Subset of 4.6k motifs
ヒト用RcisTargetモチーフデータベース（hg19） – 4.6kモチーフのサブセット
153. Affyhgu133Plus2Expr
Affyhgu133Plus2Expr (GPL570) Expression Data Package
Affyhgu133Plus2Expr（GPL570）発現データパッケージ
154. lungExpression
ExpressionSets for Parmigiani et al., 2004 Clinical Cancer Research paper
Parmigiani et al。、2004臨床癌研究論文のための発現セット
155. TBX20BamSubset
Subset of BAM files from the “TBX20” experiment
「TBX20」実験からのBAMファイルのサブセット
156. aracne.networks
ARACNe-inferred gene networks from TCGA tumor datasets
TCGA腫瘍データセットからのARACNe推定遺伝子ネットワーク
157. cMap2data
Connectivity Map (version 2) Data
接続マップ（バージョン2）データ
158. derfinderData
Processed BigWigs from BrainSpan for examples
例としてBrainSpanのProcessed BigWigs
159. TargetSearchData
Example GC-MS data for TargetSearch Package
TargetSearchパッケージのGC-MSデータの例
160. timecoursedata
A data package for timecourse RNA-seq and microarray gene expression data sets
タイムコースRNA-seqおよびマイクロアレイ遺伝子発現データセットのためのデータパッケージ
161. ARRmData
Example dataset for normalization of Illumina 450k Methylation data
Illumina 450kメチル化データの正規化のためのサンプルデータセット
162. KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO
Disease Datasets from GEO
GEOの疾病データセット
163. lydata
Example Dataset for crossmeta Package
crossmetaパッケージのデータセット例
164. ChIPXpressData
ChIPXpress Pre-built Databases
ChIPXpressの構築済みデータベース
165. colonCA
exprSet for Alon et al. (1999) colon cancer data
AlonらのexprSet。 （1999）大腸がんデータ
166. DrugVsDiseasedata
Drug versus Disease Data
薬物対疾病データ
167. Fletcher2013b
Master regulators of FGFR2 signalling and breast cancer risk
FGFR2シグナル伝達と乳がんリスクの主な調節因子
168. imcdatasets
Collection of publicly available imaging mass cytometry (IMC) datasets
公開されているイメージングマスサイトメトリー（IMC）データセットのコレクション
169. PCHiCdata
Promoter Capture Hi-C data
プロモーターキャプチャーHi-Cデータ
170. tartare
Raw ground spectra recorded on Thermo Fisher Scientific mass spectrometers
Thermo Fisher Scientific質量分析計で記録された生の地上スペクトル
171. brgedata
Exposures, Gene Expression and Methylation data for ilustration purpouses
小話パープルハウスの曝露、遺伝子発現およびメチル化データ
172. epimutacionsData
Data for epimutacions package
epimutacionsパッケージのデータ
173. RTCGA.PANCAN12
PanCan 12 from Genome Cancer Browser
ゲノムがんブラウザからPanCan 12
174. SNAGEEdata
SNAGEE data
SNAGEEデータ
175. CardinalWorkflows
Datasets and workflows for the Cardinal mass spectrometry imaging package
Cardinal質量分析イメージングパッケージのデータセットとワークフロー
176. COPDSexualDimorphism.data
Data to support sexually dimorphic and COPD differential analysis for gene expression and methylation.
遺伝子発現およびメチル化についての性的二型およびCOPD示差分析を裏付けるデータ。
177. RNAmodR.Data
Example data for the RNAmodR package
RNAmodRパッケージのデータ例
178. biscuiteerData
Data Package for Biscuiteer
Biscuiteerのデータパッケージ
179. HarmanData
Data for the Harman package
Harmanパッケージのデータ
180. HelloRangesData
Data for the HelloRanges tutorial vignette
HelloRangesチュートリアルビネットのデータ
181. TCGAMethylation450k
The Cancer Genome Atlas Illumina 450k methylation example data
Cancer Genome Atlas Illumina 450kメチル化データの例
182. adductData
Data from untargeted MS of modifications to Cys34 of serum albumin
血清アルブミンのCys34に対する修飾の非標的MSからのデータ
183. CCl4
Carbon Tetrachloride (CCl4) treated hepatocytes
四塩化炭素（CCl 4）処理肝細胞
184. FlowSorted.CordBloodCombined.450k
Illumina 450k/EPIC data on FACS and MACS umbilical blood cells
FACSおよびMACS臍帯血細胞に関するIllumina 450k / EPICデータ
185. LungCancerLines
Reads from Two Lung Cancer Cell Lines
2つの肺がん細胞株から読み取る
186. seqCNA.annot
Annotation for the copy number analysis of deep sequencing cancer data with seqCNA
seqCNAを用いたディープシーケンシング癌データのコピー数分析のための注釈
187. KOdata
LINCS Knock-Out Data Package
LINCSノックアウトデータパッケージ
188. MEDIPSData
Example data for MEDIPS and QSEA packages
MEDIPSおよびQSEAパッケージのデータ例
189. PathNetData
Experimental data for the PathNet package
PathNetパッケージの実験データ
190. RUVnormalizeData
Gender data for the RUVnormalize package
RUVnormalizeパッケージの性別データ
191. SCATEData
Data for SCATE (Single-cell ATAC-seq Signal Extraction and Enhancement)
SCATE (Single-cell ATAC-seq Signal Extraction and Enhancement)のデータ
192. seq2pathway.data
data set for R package seq2pathway
Rパッケージseq2pathwayのデータセット
193. DExMAdata
Data package for DExMA package
DExMAパッケージのデータパッケージ
194. HD2013SGI
Mapping genetic interactions in human cancer cells with RNAi and multiparametric phenotyping
RNAiとマルチパラメトリック表現型を用いたヒト癌細胞における遺伝的相互作用のマッピング
195. HiCDataHumanIMR90
Human IMR90 Fibroblast HiC data from Dixon et al. 2012
ＤｉｘｏｎらからのヒトＩＭＲ９０線維芽細胞ＨｉＣデータ。 2012年
196. pwrEWAS.data
pwrEWAS.data: Reference data accompanying pwrEWAS
pwrEWAS.data：pwrEWASに付随する参照データ
197. TargetScoreData
TargetScoreData
TargetScoreData
198. WES.1KG.WUGSC
Whole Exome Sequencing (WES) of chromosome 22 401st to 500th exon from the 1000 Genomes (1KG) Project by the Washington University Genome Sequencing Center (WUGSC).
ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンター（WUGSC）による1000ゲノム（1KG）プロジェクトからの22番染色体の401番目から500番目のエキソンの全エキソーム配列決定（WES）。
199. biotmleData
Example experimental microarray data set for the “biotmle” R package
「biotmle」Rパッケージ用の実験用マイクロアレイデータセットの例
200. ITALICSData
ITALICSData
ITALICSData
201. BloodCancerMultiOmics2017
“Drug-perturbation-based stratification of blood cancer” by Dietrich S, Oles M, Lu J et al. – experimental data and complete analysis
「薬物摂動に基づく血液癌の層別化」、Ｄｉｅｔｒｉｃｈ Ｓ、Ｏｌｅｓ Ｍ、Ｌｕ Ｊ ｅｔ ａｌ。 – 実験データと完全な解析
202. grndata
Synthetic Expression Data for Gene Regulatory Network Inference
遺伝子調節ネットワーク推論のための合成発現データ
203. MMAPPR2data
Sample Data for MMAPPR2
MMAPPR2のサンプルデータ
204. msPurityData
Fragmentation spectral libraries and data to test the msPurity package
msPurityパッケージをテストするためのフラグメンテーションスペクトルライブラリとデータ
205. stemHypoxia
Differentiation of Human Embryonic Stem Cells under Hypoxia gene expression dataset by Prado-Lopez et al. (2010)
Prado-Lopez等による低酸素遺伝子発現データセットの下でのヒト胚性幹細胞の分化。 （2010年）
206. Affyhgu133aExpr
Affymetrix Human hgu133a Array (GPL96) Expression Data Package
Affymetrix Human hgu133a Array（GPL96）発現データパッケージ
207. gpaExample
Example data for the GPA package (Genetic analysis incorporating Pleiotropy and Annotation)
GPAパッケージ（Pleiotropyとアノテーションを組み込んだ遺伝学的解析）のデータ例
208. LRcellTypeMarkers
Marker gene information for LRcell R Bioconductor package
LRcell R Bioconductorパッケージのマーカー遺伝子情報
209. pcxnData
Correlation coefficients and p values between pre-defined pathway/gene sets
定義済み経路/遺伝子セット間の相関係数とp値
210. FlowSorted.CordBlood.450k
Illumina 450k data on sorted cord blood cells
分類された臍帯血細胞に関するIllumina 450kデータ
211. maqcExpression4plex
Sample Expression Data – MAQC / HG18 – NimbleGen
サンプル発現データ – MAQC / HG18 – NimbleGen
212. scanMiRData
miRNA Affinity models for the scanMiR package
scanMiRパッケージ用miRNAアフィニティモデル
213. CluMSIDdata
Data for the CluMSID package
CluMSIDパッケージのデータ
214. hapmap100kxba
Sample data – Hapmap 100K XBA Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 100K XBA Affymetrix
215. OMICsPCAdata
Supporting data for package OMICsPCA
パッケージOMICsPCAの補助データ
216. PasillaTranscriptExpr
Data package with transcript expression obtained with kallisto from pasilla knock-down RNA-Seq data from Brooks et al.
BrooksらからのpasillaノックダウンRNA-Seqデータからのカリストを用いて得られた転写物発現を有するデータパッケージ。
217. RMassBankData
Test dataset for RMassBank
RMassBank用テストデータセット
218. SpikeIn
Affymetrix Spike-In Experiment Data
Affymetrixスパイクイン実験データ
219. affycompData
affycomp data
affycompデータ
220. Affymoe4302Expr
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array (GPL1261) Expression Data Package
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array（GPL1261）発現データパッケージ
221. cancerdata
Development and validation of diagnostic tests from high-dimensional molecular data: Datasets
高次元分子データからの診断テストの開発と検証：データセット
222. ecoliLeucine
Experimental data with Affymetrix E. coli chips
Affymetrix E. coliチップによる実験データ
223. FANTOM3and4CAGE
CAGE data from FANTOM3 and FANTOM4 projects
FANTOM3とFANTOM4プロジェクトからのケージデータ
224. flowPloidyData
Example Flow Cytometry Data
フローサイトメトリーデータの例
225. frmaExampleData
Frma Example Data
医薬品サンプルデータ
226. HMP16SData
16S rRNA Sequencing Data from the Human Microbiome Project
Human Microbiome Projectの16S rRNAシーケンスデータ
227. lumiBarnes
Barnes Benchmark Illumina Tissues Titration Data
Barnes Benchmark Illuminaが滴定データを組織化
228. minionSummaryData
Summarised MinION sequencing data published by Ashton et al. 2015
Ashtonらによって公表された要約されたMinION配列決定データ。 2015年
229. Affyhgu133A2Expr
Affymetrix Human Genome U133A 2.0 Array (GPL571) Expression Data Package
Affymetrix Human Genome U133A 2.0アレイ（GPL571）発現データパッケージ
230. ASICSdata
Example of 1D NMR spectra data for ASICS package
ASICSパッケージの1次元NMRスペクトルデータの例
231. LungCancerACvsSCCGEO
A lung cancer dataset that can be used with maPredictDSC package for developing outcome prediction models from Affymetrix CEL files.
Affymetrix CELファイルからの転帰予測モデルを開発するためにmaPredictDSCパッケージと共に使用できる肺癌データセット。
232. RITANdata
This package contains the annotation and network data sets
このパッケージはアノテーションとネットワークデータセットを含みます
233. RLHub
An ExperimentHub package for accessing processed RLSuite data sets
RLSuiteで処理されたデータセットにアクセスするためのExperimentHubパッケージ
234. stjudem
Microarray Data from Yeoh et al. in MACAT format
Yeohらからのマイクロアレイデータ。 MACATフォーマットで
235. TENxBUSData
Single cell dataset from 10x in BUS format
BUS形式の10xの単一セルデータセット
236. ChIC.data
ChIC package data
ChICパッケージデータ
237. curatedBreastData
Curated breast cancer gene expression data with survival and treatment information
生存および治療情報を含むキュレーション乳がん遺伝子発現データ
238. MACSdata
Test datasets for the MACSr package
MACSrパッケージのテストデータセット
239. msd16s
Healthy and moderate to severe diarrhea 16S expression data
健康で中等度から重度の下痢16S発現データ
240. prebsdata
Data for ‘prebs’ package
‘prebs’パッケージのデータ
241. PtH2O2lipids
P. tricornutum HPLC-ESI-MS Lipid Data from van Creveld et al. (2015)
Ｐ． （2015年）
242. scpdata
Single-Cell Proteomics Data Package
シングルセルプロテオミクスデータパッケージ
243. shinyMethylData
Example dataset of input data for shinyMethyl
shinyMethylの入力データのサンプルデータセット
244. WGSmapp
Mappability tracks of Whole-genome Sequencing from the ENCODE Project
ENCODEプロジェクトの全ゲノムシークエンシングのマッピングトラック
245. EpiMix.data
Data for the EpiMix package
EpiMixパッケージのデータ
246. GSE103322
GEO accession data GSE103322 as a SingleCellExperiment
GEO accession data GSE103322 as a SingleCellExperiment
247. miRcompData
Data used in the miRcomp package
miRcompパッケージで使用されるデータ
248. NetActivityData
Data required for getting the gene set scores with NetActivity package
NetActivityパッケージで遺伝子セットスコアを取得するために必要なデータ
249. NGScopyData
Subset of BAM files of human tumor and pooled normal sequencing data (Zhao et al. 2014) for the NGScopy package
NGScopyパッケージ用のヒト腫瘍のBAMファイルのサブセットおよびプールされた正常な配列決定データ（Zhao et al。2014）
250. pepDat
Peptide microarray data package
ペプチドマイクロアレイデータパッケージ
251. ptairData
PTR-TOF-MS volatolomics raw datasets from exhaled air and cell culture headspace
呼気および細胞培養ヘッドスペースからのPTR-TOF-MS volatolomics生データセット
252. restfulSEData
Example metadata for the “restfulSE” R package
「restfulSE」Rパッケージのメタデータの例
253. synapterdata
Data accompanying the synapter package
シナプスパッケージに付随するデータ
254. vulcandata
VirtUaL ChIP-Seq data Analysis using Networks, dummy dataset
ネットワークを用いたVirtUaL ChIP-Seqデータ解析、ダミーデータセット
255. curatedBladderData
Bladder Cancer Gene Expression Analysis
膀胱癌遺伝子発現解析
256. GeuvadisTranscriptExpr
Data package with transcript expression and bi-allelic genotypes from the GEUVADIS project
GEUVADISプロジェクトからの転写産物発現および二対立遺伝子型を含むデータパッケージ
257. PWMEnrich.Hsapiens.background
H. sapiens background for PWMEnrich
PWMEnrichのH. sapiens背景
258. SCLCBam
Sequence data from chromosome 4 of a small-cell lung tumor
小細胞肺腫瘍の4番染色体からの配列データ
259. scTHI.data
The package contains examples of single cell data used in vignettes and examples of the scTHI package; data contain both tumor cells and immune cells from public dataset of glioma
このパッケージには、ビネットで使用された単細胞データの例とscTHIパッケージの例が含まれています；データには、グリオーマの公開データセットからの腫瘍細胞と免疫細胞の両方が含まれています
260. spqnData
Data for the spqn package
spqn パッケージのデータ
261. tissueTreg
TWGBS and RNA-seq data from tissue T regulatory cells from mice
マウスの組織T制御細胞からのTWGBSおよびRNA配列データ
262. AssessORFData
Data and Files for the AssessORF Package
AssessORFパッケージのデータとファイル
263. blimaTestingData
Data for testing of the package blima.
パッケージblimaのテストのためのデータ。
264. ChIPexoQualExample
Example data for the ChIPexoQual package, which implements a quality control pipeline for ChIP-exo data
ChIP-exoデータの品質管理パイプラインを実装するChIPexoQualパッケージのデータ例
265. chipseqDBData
Data for the chipseqDB Workflow
chipseqDBワークフローのデータ
266. DmelSGI
Experimental data and documented source code for the paper “A Map of Directional Genetic Interactions in a Metazoan Cell”
論文「後生動物細胞における指向性遺伝的相互作用の地図」の実験データと文書化されたソースコード
267. optimalFlowData
optimalFlowData
最適フローデータ
268. rRDPData
Database for the Default RDP Classifier
デフォルトのRDP分類子用のデータベース
269. topdownrdata
Example Files for the topdownr R Package
topdownr Rパッケージのサンプルファイル
270. WeberDivechaLCdata
Spatially-resolved transcriptomics and single-nucleus RNA-sequencing data from the locus coeruleus (LC) in postmortem human brain samples
ヒト死後脳サンプルにおける青斑核（LC）の空間分解トランスクリプトミクスおよび単一核RNAシーケンスデータ
271. xcoredata
data package for xcore
xcore用データパッケージ
272. bodymapRat
Experimental dataset from the rat BodyMap project
ラットBodyMapプロジェクトからの実験データセット
273. clustifyrdatahub
External data sets for clustifyr in ExperimentHub
ExperimentHubにあるclustifyrの外部データセット
274. GSE13015
GEO accession data GSE13015_GPL6106 as a SummarizedExperiment
GEO accession data GSE13015_GPL6106 as a SummarizedExperiment
275. MethylAidData
MethylAid-summarized data for 2800 Illumina 450k array samples and 2620 EPIC array samples
2800 Illumina 450kアレイサンプルおよび2620 EPICアレイサンプルのメチルエイド要約データ
276. qPLEXdata
Data accompanying qPLEXanalyzer package
qPLEXanalyzerパッケージに付随するデータ
277. RGMQLlib
RGMQLlib, java libraries to run GMQL scala API
RGMQLlib、GMQL scala APIを実行するためのJavaライブラリ
278. SingleMoleculeFootprintingData
Data supporting the SingleMoleculeFootprinting pkg
SingleMoleculeFootprinting pkgのサポートデータ
279. AmpAffyExample
Example of Amplified Data
増幅データの例
280. CellMapperData
Pre-processed data for use with the CellMapper package
CellMapperパッケージで使用するための前処理済みデータ
281. diggitdata
Example data for the diggit package
diggitパッケージのデータ例
282. GSBenchMark
Gene Set Benchmark
遺伝子セットベンチマーク
283. HMP2Data
16s rRNA sequencing data from the Human Microbiome Project 2
Human Microbiome Project 2の16秒rRNAシーケンスデータ
284. octad.db
Open Cancer TherApeutic Discovery (OCTAD) database
Open Cancer TherApeutic Discovery (OCTAD)データベース
285. PWMEnrich.Dmelanogaster.background
D. melanogaster background for PWMEnrich
D. melanogasterのPWMEnrich背景
286. TMExplorer
A Collection of Tumour Microenvironment Single-cell RNA Sequencing Datasets and Correspodnding Metadata
腫瘍微小環境単細胞RNAシークエンシングデータセットと対応するメタデータのコレクション
287. dyebiasexamples
Example data for the dyebias package, which implements the GASSCO method.
GASSCO法を実行するdyebiasパッケージのデータ例。
288. ffpeExampleData
Illumina DASL example microarray data
Illumina DASLサンプルマイクロアレイデータ
289. MAQCsubset
Experimental Data Package: MAQCsubset
実験データパッケージ：MAQCsubset
290. marinerData
ExperimentHub data for the mariner package
マリナーパッケージのExperimentHubデータ
291. MEEBOdata
MEEBO set and MEEBO controls.
MEEBOセットとMEEBOコントロール。
292. MMDiffBamSubset
Example ChIP-Seq data for the MMDiff package
MMDiffパッケージのChIP-Seqデータの例
293. nanotubes
Mouse nanotube CAGE data
マウスナノチューブCAGEデータ
294. sampleClassifierData
Pre-processed data for use with the sampleClassifier package
sampleClassifierパッケージで使用するための前処理済みデータ
295. CONFESSdata
Example dataset for CONFESS package
CONFESSパッケージ用のデータセットの例
296. HEEBOdata
HEEBO set and HEEBO controls.
HEEBOセットとHEEBOコントロール。
297. HiCDataLymphoblast
Human lymphoblastoid HiC data from Lieberman-Aiden et al. 2009
Lieberman-Aidenらからのヒトリンパ芽細胞質HiCデータ。 2009年
298. HumanAffyData
GEO accession GSE64985 and ArrayExpress accession E-MTAB-62 as ExpressionSet objects
ExpressionSetオブジェクトとしてのGEO登録GSE64985およびArrayExpress登録E-MTAB-62
299. miRNATarget
gene target tabale of miRNA for human/mouse used for MiRaGE package
MiRaGEパッケージに使用されるヒト/マウス用のmiRNAの遺伝子標的一覧
300. mvoutData
affy and illumina raw data for assessing outlier detector performance
異常値検出器の性能を評価するためのAffyおよびIlluminaの生データ
301. pumadata
Various data sets for use with the puma package
pumaパッケージで使用するためのさまざまなデータセット
302. BeadArrayUseCases
Analysing Illumina BeadArray expression data using Bioconductor
Bioconductorを使用したIllumina BeadArray発現データの分析
303. celarefData
Processed scRNA data for celaref Vignette – cell labelling by reference
celaref Vignetteのために処理されたscRNAデータ – 参照による細胞標識
304. cnvGSAdata
Data used in the vignette of the cnvGSA package
cnvGSAパッケージのビネットで使用されているデータ
305. ConnectivityMap
Functional connections between drugs, genes and diseases as revealed by common gene-expression changes
一般的な遺伝子発現変化によって明らかにされた薬物、遺伝子および疾患間の機能的関連
306. healthyFlowData
Healthy dataset used by the flowMatch package
flowMatchパッケージで使用される健全なデータセット
307. hgu133plus2CellScore
CellScore Standard Cell Types Expression Dataset [hgu133plus2]
CellScoreスタンダードセルタイプExpression Dataset [hgu133plus2]
308. MIGSAdata
MIGSA vignette data
MIGSAビネットデータ
309. SNPhoodData
Additional and more complex example data for the SNPhood package
SNPhoodパッケージの追加のより複雑な例のデータ
310. MetaGxBreast
Transcriptomic Breast Cancer Datasets
トランスクリプトーム乳がんデータセット
311. PWMEnrich.Mmusculus.background
M. musculus background for PWMEnrich
PWMEnrichのM. musculus背景
312. seqc
RNA-seq data generated from SEQC (MAQC-III) study
SEQC（MAQC-III）試験から得られたRNA-seqデータ
313. BioPlex
R-side access to BioPlex protein-protein interaction data
BioPlexタンパク質相互作用データへのR側からのアクセス
314. curatedCRCData
Colorectal Cancer Gene Expression Analysis
大腸癌遺伝子発現解析
315. etec16s
Individual-specific changes in the human gut microbiota after challenge with enterotoxigenic Escherichia coli and subsequent ciprofloxacin treatment
腸管毒素原性大腸菌による攻撃およびその後のシプロフロキサシン処理後のヒト腸内微生物叢の個体特異的変化
316. FlowSorted.CordBloodNorway.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted cord blood cell populations
選別された臍帯血細胞集団のIllumina Humanメチル化データ
317. HarmonizedTCGAData
Processed Harmonized TCGA Data of Five Selected Cancer Types
選択された5つの癌の種類に関する処理済みの調和TCGAデータ
318. mAPKLData
Gene expression data for testing of the package mAPKL.
パッケージmAPKLのテスト用の遺伝子発現データ。
319. MerfishData
Collection of public MERFISH datasets
公開されているMERFISHデータセットのコレクション
320. diffloopdata
Example ChIA-PET Datasets for the diffloop Package
diffloopパッケージ用のChIA-PETデータセットの例
321. RNAinteractMAPK
Mapping of Signalling Networks through Synthetic Genetic Interaction Analysis by RNAi
RNAiによる合成遺伝的相互作用解析によるシグナリングネットワークのマッピング
322. curatedTBData
Curation of existing 49 tuberculosis transcriptomic studies
既存の49結核トランスクリプトーム研究のキュレーション
323. mammaPrintData
RGLists from the Glas and Buyse breast cancer studies
GlasとBuyseの乳がん研究のRGLists
324. MetaGxOvarian
Transcriptomic Ovarian Cancer Datasets
トランスクリプトーム卵巣癌データセット
325. oct4
Conditional knockdown of OCT4 in mouse ESCs
マウスESCにおけるOCT4の条件付きノックダウン
326. beta7
Rodriguez et al. (2004) Differential Gene Expression by Memory/Effector T Helper Cells Bearing the Gut-Homing Receptor Integrin alpha4 beta7.
ロドリゲス等。 （2004）腸ホーミング受容体インテグリンα4β7を有する記憶/エフェクターTヘルパー細胞による示差的遺伝子発現。
327. BioImageDbs
Bio- and biomedical imaging dataset for machine learning and deep learning (for ExperimentHub)
機械学習や深層学習のためのバイオ・生物医学画像データセット（ExperimentHub用
328. emtdata
An ExperimentHub Package for data sets with an Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT)
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT)を伴うデータセットのためのExperimentHubパッケージ
329. SimBenchData
SimBenchData: a collection of 35 single-cell RNA-seq data covering a wide range of data characteristics
SimBenchData: 幅広いデータ特性を網羅した35個のシングルセルRNA-seqデータのコレクション
330. ccTutorial
Data package for ChIP-chip tutorial
ChIPチップチュートリアルのデータパッケージ
331. ChimpHumanBrainData
Chimp and human brain data package
チンパンジーと人間の脳のデータパッケージ
332. davidTiling
Data and analysis scripts for David, Huber et al. yeast tiling array paper
David、Huber他のためのデータと分析スクリプト。イーストタイリングアレイ紙
333. harbChIP
Experimental Data Package: harbChIP
実験データパッケージ：harbChIP
334. MetaGxPancreas
Transcriptomic Pancreatic Cancer Datasets
トランスクリプトーム膵臓癌データセット
335. pd.atdschip.tiling
Platform Design Info for Affymetrix Atdschip_tiling
Affymetrix Atdschip_tilingのプラットフォーム設計情報
336. scATAC.Explorer
A Collection of Single-cell ATAC Sequencing Datasets and Corresponding Metadata
シングルセルATACシーケンシングデータセットと対応するメタデータのコレクション
337. benchmarkfdrData2019
Data and Benchmarking Results from Korthauer and Kimes et al. (2019)
Korthauer and Kimes et al。からのデータとベンチマーク結果（2019）
338. CopyNeutralIMA
Copy Neutral Illumina Methylation Arrays
中性イルミナメチル化アレイのコピー
339. dressCheck
data and software for checking Dressman JCO 25(5) 2007
Dressman JCO 25（5）2007をチェックするためのデータとソフトウェア
340. EatonEtAlChIPseq
ChIP-seq data of ORC-binding sites in Yeast excerpted from Eaton et al. 2010
酵母のORC結合部位のChIP-seqデータは、Eatonらから引用。 2010年
341. IHWpaper
Reproduce figures in IHW paper
IHW紙に図を再現する
342. MicrobiomeBenchmarkData
Datasets for benchmarking in microbiome research
マイクロバイオーム研究のベンチマーク用データセット
343. microRNAome
SummarizedExperiment for the microRNAome project
microRNAomeプロジェクトの要約実験
344. NestLink
NestLink an R data package to guide through Engineered Peptide Barcodes for In-Depth Analyzes of Binding Protein Ensembles
結合タンパク質アンサンブルの詳細な分析のための人工ペプチドバーコードをガイドするためのRデータパッケージのNestLink
345. OnassisJavaLibs
OnassisJavaLibs, java libraries to run conceptmapper and semantic similarity
OnassisJavaLibs、conceptmapperとセマンティックの類似性を実行するためのJavaライブラリ
346. ProData
SELDI-TOF data of Breast cancer samples
乳がんサンプルのSELDI-TOFデータ
347. prostateCancerCamcap
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
348. rheumaticConditionWOLLBOLD
Normalized gene expression dataset published by Wollbold et al. [2009] (WOLLBOLD).
Wollboldらによって公開された正規化遺伝子発現データセット。 [2009]（WOLLBOLD）
349. seventyGeneData
ExpressionSets from the van’t Veer and Van de Vijver breast cancer studies
van’t VeerとVan de Vijverの乳がん研究のExpressionSets
350. VectraPolarisData
Vectra Polaris and Vectra 3 multiplex single-cell imaging data
Vectra PolarisおよびVectra 3マルチプレックスシングルセルイメージングデータ
351. AshkenazimSonChr21
Annotated variants on the chromosome 21, human genome 19, Ashkenazim Trio son sample
染色体21、ヒトゲノム19、Ashkenazim Trio sonサンプル上の注釈付き変異体
352. BeadSorted.Saliva.EPIC
Illumina EPIC data on BeadSorted adult saliva cells
ビーズソーティングされた成人唾液細胞のIllumina EPICデータ
353. curatedAdipoArray
A Curated Microarrays Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1) Under Genetic and Pharmacological Perturbations
MDI誘導分化脂肪細胞(3T3-L1)の遺伝的および薬理学的摂動下でのキュレーションマイクロアレイデータセット
354. curatedAdipoRNA
A Curated RNA-Seq Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1)
MDI誘導分化脂肪細胞（3T3-L1）のキュレーションRNA-Seqデータセット
355. DeSousa2013
Poor prognosis colon cancer is defined by a molecularly distinct subtype and precursor lesion
予後不良の大腸癌は分子的に異なるサブタイプおよび前駆病変によって定義される
356. DNAZooData
DNA Zoo data package
DNA Zooデータパッケージ
357. fabiaData
Data sets for FABIA (Factor Analysis for Bicluster Acquisition)
FABIA（バイクラスター取得のための因子分析）のデータセット
358. FieldEffectCrc
Tumor, tumor-adjacent normal, and healthy colorectal transcriptomes as SummarizedExperiment objects
SummarizedExperimentオブジェクトとしての腫瘍、腫瘍に隣接した正常な大腸直腸トランスクリプトーム、および健康な大腸直腸トランスクリプトーム
359. fourDNData
4DN data package
4DNデータパッケージ
360. hapmap500ksty
Sample data – Hapmap 500K STY Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 500K STY Affymetrix
361. Neve2006
expression and CGH data on breast cancer cell lines
乳癌細胞株の発現とCGHデータ
362. bronchialIL13
time course experiment involving il13
il13を含む時間経過実験
363. CLLmethylation
Methylation data of primary CLL samples in PACE project
PACEプロジェクトにおける主要CLLサンプルのメチル化データ
364. curatedAdipoChIP
A Curated ChIP-Seq Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1)
MDI誘導分化脂肪細胞（3T3-L1）のキュレーションされたChIP-Seqデータセット
365. DonaPLLP2013
Supplementary data package for Dona et al. (2013) containing example images and tables
Donaらのための補足データパッケージ。画像と表の例を含む（2013）
366. furrowSeg
Furrow Segmentation
溝セグメンテーション
367. gaschYHS
ExpressionSet for response of yeast to heat shock and other environmental stresses
熱ショックおよび他の環境ストレスに対する酵母の応答のためのExpressionSet
368. hapmap100khind
Sample data – Hapmap 100K HIND Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 100K HIND Affymetrix
369. hapmap500knsp
Sample data – Hapmap 500K NSP Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 500K NSP Affymetrix
370. kidpack
DKFZ kidney package
DKFZ腎臓パッケージ
371. ListerEtAlBSseq
BS-seq data of H1 and IMR90 cell line excerpted from Lister et al. 2009
Ｈ１細胞株およびＩＭＲ９０細胞株のＢＳ配列データは、Ｌｉｓｔｅｒ ｅｔ ａｌ。 2009年
372. prostateCancerGrasso
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
373. prostateCancerTaylor
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
374. RnBeads.rn5
RnBeads.rn5
RnBeads.rn5
375. Single.mTEC.Transcriptomes
Single Cell Transcriptome Data and Analysis of Mouse mTEC cells
マウスmTEC細胞の単細胞トランスクリプトームデータおよび分析
376. SNAData
Social Networks Analysis Data Examples
ソーシャルネットワーク分析データの例
377. TCGAcrcmRNA
TCGA CRC 450 mRNA dataset
TCGA CRC 450 mRNAデータセット
378. VariantToolsData
Data for the VariantTools tutorial
VariantToolsチュートリアルのデータ
379. DvDdata
Drug versus Disease Data
薬物対疾病データ
380. hgu133abarcodevecs
hgu133a data for barcode
バーコードのhgu133aデータ
381. HighlyReplicatedRNASeq
Collection of Bulk RNA-Seq Experiments With Many Replicates
多数のレプリケートを用いたバルクRNA-Seq実験集
382. HIVcDNAvantWout03
T cell line infections with HIV-1 LAI (BRU)
HIV-1 LAI（BRU）によるT細胞株感染
383. Iyer517
exprSets for Iyer, Eisen et all 1999 Science paper
Iyer、Eisen、その他1999年版全文
384. LiebermanAidenHiC2009
Selected data from the HiC paper of E. Lieberman-Aiden et al. in Science (2009)
E. Lieberman-AidenらのHiC論文から選択されたデータ。科学の中で（2009）
385. mcsurvdata
Meta cohort survival data
メタコホート生存データ
386. MethylSeqData
Collection of Public DNA Methylation Sequencing Datasets
公的DNAメチル化塩基配列決定データセットの収集
387. MUGAExampleData
Example {M}ouse {U}niversal {G}enotyping {A}rray data for genome reconstruction and quantitative trait locus mapping.
ゲノムの再構築および量的形質遺伝子座マッピングのための{A}配列データ{A}配列解析{M}または{U}ユニバーサル{G}。
388. NCIgraphData
Data for the NCIgraph software package
NCIgraphソフトウェアパッケージのデータ
389. PhyloProfileData
Data package for phylogenetic profile analysis using PhyloProfile tool
PhyloProfileツールを使用した系統プロファイル分析用のデータパッケージ
390. prostateCancerStockholm
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
391. prostateCancerVarambally
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
392. RRBSdata
An RRBS data set with 12 samples and 10,000 simulated DMRs
12個のサンプルと10,000個の模擬DMRを含むRRBSデータセット
393. SVM2CRMdata
An example dataset for use with the SVM2CRM package
SVM2CRMパッケージで使用するサンプルデータセット
394. tinesath1cdf
tinesath1cdf
tinesath1cdf
395. tuberculosis
Tuberculosis Gene Expression Data for Machine Learning
機械学習のための結核遺伝子発現データ
396. CoSIAdata
VST normalized RNA-Sequencing data with annotations for multiple species samples from Bgee
Bgeeの複数種サンプルのアノテーション付きVST正規化RNAシーケンサーデータ
397. CRCL18
CRC cell line dataset
CRC細胞株データセット
398. GIGSEAdata
Gene set collections for the GIGSEA package
GIGSEAパッケージの遺伝子セットコレクション
399. GSE159526
Placental cell DNA methylation data from GEO accession GSE159526
GEOアクセッションGSE159526からの胎盤細胞のDNAメチル化データ
400. healthyControlsPresenceChecker
Dowloads A Gene Expression Dataset From GEO And Checks If It Contains Data Of Healthy Controls Or Not
GEOから遺伝子発現データセットをダウンロードし、健康なコントロールのデータが含まれているかどうかをチェックするツール
401. MAQCsubsetILM
MAQC data subset for the Illumina platform
Illuminaプラットフォーム用のMAQCデータサブセット
402. msqc1
Sigma mix MSQC1 data
シグマミックスMSQC1データ
403. ObMiTi
Ob/ob Mice Data on Normal and High Fat Diet
通常の食事と高脂肪食を摂取したOb/obマウスのデータ
404. preciseTADhub
Pre-trained random forest models obtained using preciseTAD
preciseTADを用いて事前に学習させたランダムフォレストモデル
405. TCGAcrcmiRNA
TCGA CRC 450 miRNA dataset
TCGA CRC 450 miRNAデータセット
406. TimerQuant
Timer Quantification
タイマー定量化
407. tofsimsData
Import, process and analysis of ToF-SIMS imaging data
ToF-SIMSイメージングデータのインポート、処理、分析
408. hgu133plus2barcodevecs
hgu133plus2 data for barcode
バーコードのhgu133plus2データ
409. hgu2beta7
A data package containing annotation data for hgu2beta7
hgu2beta7のアノテーションデータを含むデータパッケージ
410. mouse4302barcodevecs
mouse4302 data for barcode
バーコードのmouse4302データ
411. spatialDmelxsim
Spatial allelic expression counts for fly cross embryo
ハエの交配胚の空間的対立遺伝子発現カウント
412. XhybCasneuf
EBI/PSB cross-hybridisation study package
EBI / PSBクロスハイブリダイゼーション研究パッケージ
413. serumStimulation
serumStimulation is a data package which is used by examples in package pcaGoPromoter
bloodStimulationは、パッケージpcaGoPromoterの例で使用されるデータパッケージです。
414. SomatiCAData
An example cancer whole genome sequencing data for the SomatiCA package
SomatiCAパッケージのための癌全ゲノム配列決定データの例
415. tinesath1probe
Probe sequence data for microarrays of type tinesath1
タイプtinesath1のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
416. yeastGSData
Yeast Gold Standard Data
酵母ゴールドスタンダードデータ
417. MetaScope
Tools and functions for preprocessing 16S and metagenomic sequencing microbiome data
16Sおよびメタゲノム配列のマイクロバイオームデータを前処理するためのツールおよび機能
418. scMultiome
Collection of Public Single-Cell Multiome (scATAC + scRNAseq) Datasets
公開されているシングルセルマルチオーム（scatac + scRNAseq）データセット集
419. gDNAinRNAseqData
RNA-seq data with different levels of gDNA contamination
gDNAコンタミネーションレベルの異なるRNA-seqデータ
420. gDRtestData
gDRtestData – R data package with testing dose reponse data
gDRtestData – 用量反応データをテストするための R データパッケージ
421. orthosData
Data for the orthos package
orthosパッケージのデータ
422. HiBED
HiBED
HiBED
423. smokingMouse
Provides access to smokingMouse project data
smokingMouseプロジェクトデータへのアクセスを提供
424. cfToolsData
ExperimentHub data for the cfTools package
cfToolsパッケージのExperimentHubデータ
425. HCATonsilData
Provide programmatic access to the tonsil cell atlas datasets
扁桃細胞アトラスデータセットへのプログラムによるアクセスを提供
426. multiWGCNAdata
Data Package for multiWGCNA
multiWGCNA用データパッケージ
427. raerdata
A collection of datasets for use with raer package
raerパッケージで使用するためのデータセット集
428. SpatialDatasets
Collection of spatial omics datasets
空間オミックスデータセットのコレクション
429. TumourMethData
A Collection of DNA Methylation Datasets for Human Tumour Samples and Matching Normal Samples
ヒト腫瘍サンプルとそれにマッチする正常サンプルのDNAメチル化データセット集