BioconductorのAnnotationDataパッケージの一覧をご紹介します。英語での説明文をgoogle翻訳を使用させていただき機械的に翻訳したものを掲載しました。パッケージを探す参考にしていただければ幸いです。
パッケージ確認日:2022/05/01
パッケージ数:909
1. GenomeInfoDbData
Species and taxonomy ID look up tables used by GenomeInfoDb
GenomeInfoDbによって使用される種と分類IDのルックアップテーブル
2. GO.db
A set of annotation maps describing the entire Gene Ontology
遺伝子オントロジー全体を記述する注釈マップのセット
3. org.Hs.eg.db
Genome wide annotation for Human
ヒトのための全ゲノムアノテーション
4. DO.db
A set of annotation maps describing the entire Disease Ontology
病気オントロジー全体を記述する注釈マップのセット
5. org.Mm.eg.db
Genome wide annotation for Mouse
マウスのゲノムワイドアノテーション
6. TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
7. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg19)
ホモサピエンスの全ゲノム配列(UCSCバージョンhg19)
8. reactome.db
A set of annotation maps for reactome
リアクトームのアノテーションマップのセット
9. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg38)
ホモサピエンスの全ゲノム配列(UCSCバージョンhg38)
10. TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
11. hgu133plus2.db
Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array annotation data (chip hgu133plus2)
Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0アレイアノテーションデータ(チップhgu133plus2)
12. TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
13. FDb.InfiniumMethylation.hg19
Annotation package for Illumina Infinium DNA methylation probes
Illumina Infinium DNAメチル化プローブ用のアノテーションパッケージ
14. IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
Annotation for Illumina’s 450k methylation arrays
Illuminaの450kメチル化アレイのアノテーション
15. EnsDb.Hsapiens.v86
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
16. org.Rn.eg.db
Genome wide annotation for Rat
ラットのゲノムワイドアノテーション
17. IlluminaHumanMethylation450kmanifest
Annotation for Illumina’s 450k methylation arrays
Illuminaの450kメチル化アレイのアノテーション
18. IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
Manifest for Illumina’s EPIC methylation arrays
IlluminaのEPICメチル化アレイのマニフェスト
19. IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19
Annotation for Illumina’s EPIC methylation arrays
IlluminaのEPICメチル化アレイのアノテーション
20. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
Full genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm10)
Mus musculusの全ゲノム配列(UCSCバージョンmm10)
21. Homo.sapiens
Annotation package for the Homo.sapiens object
Homo.sapiensオブジェクト用のアノテーションパッケージ
22. PFAM.db
A set of protein ID mappings for PFAM
PFAM用の一連のタンパク質IDマッピング
23. hgu95av2.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95av2)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95av2)
24. hgu133plus2cdf
hgu133plus2cdf
hgu133plus2cdf
25. hgu133a.db
Affymetrix Human Genome U133 Set annotation data (chip hgu133a)
Affymetrix Human Genome U133アノテーションデータを設定する(チップhgu133a)
26. EnsDb.Hsapiens.v75
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
27. org.Dm.eg.db
Genome wide annotation for Fly
Flyのゲノムワイドアノテーション
28. hugene10sttranscriptcluster.db
Affymetrix hugene10 annotation data (chip hugene10sttranscriptcluster)
Affymetrix hugene10アノテーションデータ(チップhugene10sttranscriptcluster)
29. TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
30. EnsDb.Mmusculus.v79
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
31. hgu95a.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95a)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95a)
32. org.At.tair.db
Genome wide annotation for Arabidopsis
シロイヌナズナのゲノムワイドアノテーション
33. org.Sc.sgd.db
Genome wide annotation for Yeast
酵母のゲノムワイドアノテーション
34. TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
35. org.Dr.eg.db
Genome wide annotation for Zebrafish
ゼブラフィッシュのゲノムワイドアノテーション
36. Mus.musculus
Annotation package for the Mus.musculus object
Mus.musculusオブジェクト用のアノテーションパッケージ
37. illuminaHumanv4.db
Illumina HumanHT12v4 annotation data (chip illuminaHumanv4)
Illumina HumanHT12v4アノテーションデータ(チップilluminaHumanv4)
38. BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38
Full genome sequences for Homo sapiens (GRCh38)
ホモサピエンスの全ゲノム配列(GRCh38)
39. TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
40. JASPAR2020
Data package for JASPAR database (version 2020)
JASPARデータベース用データパッケージ(バージョン2020
41. BSgenome.Celegans.UCSC.ce2
Full genome sequences for Caenorhabditis elegans (UCSC version ce2)
線虫Caenorhabditis elegans(UCSCバージョンce2)の全ゲノム配列
42. IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19
Annotation for Illumina’s EPIC methylation arrays
IlluminaのEPICメチル化アレイのアノテーション
43. pd.hugene.1.0.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix HuGene-1_0-st-v1
Affymetrix HuGene-1_0-st-v1のプラットフォーム設計情報
44. EnsDb.Hsapiens.v79
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
45. JASPAR2018
Data package for JASPAR 2018
JASPAR 2018用データパッケージ
46. hgu95av2cdf
hgu95av2cdf
hgu95av2cdf
47. hgu133acdf
hgu133acdf
hgu133acdf
48. TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
49. TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
50. illuminaHumanv3.db
Illumina HumanHT12v3 annotation data (chip illuminaHumanv3)
Illumina HumanHT12v3アノテーションデータ(チップilluminaHumanv3)
51. org.Ce.eg.db
Genome wide annotation for Worm
Wormの全ゲノムアノテーション
52. pd.hg.u133.plus.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U133_Plus_2
メーカー名HG-U133_Plus_2のプラットフォームデザイン情報
53. BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5
1000genomes Reference Genome Sequence (hs37d5)
1000ゲノムリファレンスゲノム配列(hs37d5)
54. illuminaMousev2.db
Illumina MouseWG6v2 annotation data (chip illuminaMousev2)
Illumina MouseWG6v2アノテーションデータ(チップilluminaMousev2)
55. org.Bt.eg.db
Genome wide annotation for Bovine
ウシのゲノムワイドアノテーション
56. mouse4302.db
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array annotation data (chip mouse4302)
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0アレイ注釈データ(チップマウス4302)
57. illuminaHumanv2.db
Illumina HumanWG6v2 annotation data (chip illuminaHumanv2)
Illumina HumanWG6v2アノテーションデータ(チップilluminaHumanv2)
58. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3
Full genome sequences for Drosophila melanogaster (UCSC version dm3)
キイロショウジョウバエ(UCSCバージョンdm3)の全ゲノム配列
59. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
Full genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm9)
Mus musculusの全ゲノム配列(UCSCバージョンmm9)
60. org.Ss.eg.db
Genome wide annotation for Pig
ブタのための全ゲノムアノテーション
61. hgu95av2probe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95av2
タイプhgu95av2のマイクロアレイのプローブ配列データ
62. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 144)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 144)
63. org.Gg.eg.db
Genome wide annotation for Chicken
チキンのゲノムワイドアノテーション
64. illuminaHumanv1.db
Illumina HumanWG6v1 annotation data (chip illuminaHumanv1)
Illumina HumanWG6v1アノテーションデータ(チップilluminaHumanv1)
65. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 144)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 144)
66. PANTHER.db
A set of annotation maps describing the entire PANTHER Gene Ontology
PANTHER遺伝子オントロジー全体を記述する注釈マップのセット
67. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg18)
ホモサピエンスの全ゲノム配列(UCSCバージョンhg18)
68. hgu133plus2probe
Probe sequence data for microarrays of type hgu133plus2
タイプhgu133plus2のマイクロアレイのプローブ配列データ
69. BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
Saccharomyces cerevisiae (Yeast) full genome (UCSC version sacCer2)
Saccharomyces cerevisiae(酵母)フルゲノム(UCSC版sacCer2)
70. hgu133a2.db
Affymetrix Human Genome U133A 2.0 Array annotation data (chip hgu133a2)
Affymetrix Human Genome U133A 2.0アレイアノテーションデータ(チップhgu133a2)
71. mirbase.db
miRBase: the microRNA database
miRBase:マイクロRNAデータベース
72. TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
73. TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
74. hugene10stv1cdf
hugene10stv1cdf
hugene10stv1cdf
75. org.Mmu.eg.db
Genome wide annotation for Rhesus
アカゲザルのゲノムワイドアノテーション
76. illuminaMousev1.db
Illumina MouseWG6v1 annotation data (chip illuminaMousev1)
Illumina MouseWG6v1アノテーションデータ(チップilluminaMousev1)
77. illuminaMousev1p1.db
Illumina MouseWG6v1p1 annotation data (chip illuminaMousev1p1)
Illumina MouseWG6v1p1アノテーションデータ(チップilluminaMousev1p1)
78. illuminaRatv1.db
Illumina Ratv1 annotation data (chip illuminaRatv1)
Illumina Ratv1アノテーションデータ(チップilluminaRatv1)
79. BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805
Escherichia coli full genomes
大腸菌の全ゲノム
80. BSgenome.Celegans.UCSC.ce11
Full genome sequences for Caenorhabditis elegans (UCSC version ce11)
Caenorhabditis elegans(UCSCバージョンce11)の全ゲノム配列
81. org.Cf.eg.db
Genome wide annotation for Canine
犬用のゲノムワイドアノテーション
82. hu6800.db
Affymetrix HuGeneFL Genome Array annotation data (chip hu6800)
Affymetrix HuGeneFLゲノムアレイアノテーションデータ(チップhu6800)
83. BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
Saccharomyces cerevisiae (Yeast) full genome (UCSC version sacCer3)
Saccharomyces cerevisiae(酵母)全ゲノム(UCSC版sacCer3)
84. org.EcK12.eg.db
Genome wide annotation for E coli strain K12
大腸菌K12株のゲノムワイドアノテーション
85. miRBaseVersions.db
Collection of mature miRNA names of 22 different miRBase release versions
22の異なるmiRBaseリリースバージョンの成熟したmiRNA名のコレクション
86. mouse4302cdf
mouse4302cdf
mouse4302cdf
87. pd.mogene.1.0.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix MoGene-1_0-st-v1
Affymetrix MoGene-1_0-st-v1のプラットフォーム設計情報
88. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked
Full masked genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg19)
ホモサピエンスの完全マスクゲノム配列(UCSCバージョンhg19)
89. TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
90. pd.clariom.s.human
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Human
Affymetrix Clariom_S_Humanのプラットフォーム設計情報
91. drosophila2probe
Probe sequence data for microarrays of type drosophila2
drosophila 2型マイクロアレイのプローブ配列データ
92. hgu133aprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu133a
タイプhgu133aのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
93. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked
Full masked genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg38)
ホモサピエンスの完全マスクゲノム配列(UCSCバージョンhg38)
94. hgu133a2cdf
hgu133a2cdf
hgu133a2cdf
95. hthgu133a.db
Affymetrix HT Human Genome U133 Array Plate Set annotation data (chip hthgu133a)
Affymetrix HTヒトゲノムU133アレイプレートセットアノテーションデータ(チップhthgu133a)
96. pd.hta.2.0
Platform Design Info for Affymetrix HTA-2_0
Affymetrix HTA-2_0のプラットフォーム設計情報
97. phastCons100way.UCSC.hg19
UCSC phastCons conservation scores for hg19
hg19のUCSC phastCons保存スコア
98. TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.lincRNAsTranscripts
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
99. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm6
Full genome sequences for Drosophila melanogaster (UCSC version dm6)
キイロショウジョウバエ(UCSCバージョンdm6)の全ゲノム配列
100. hgug4112a.db
Agilent “Human Genome, Whole” annotation data (chip hgug4112a)
アジレントの「Human Genome、Whole」アノテーションデータ(チップhgug4112a)
101. pd.hugene.2.0.st
Platform Design Info for Affymetrix HuGene-2_0-st
Affymetrix HuGene-2_0-stのプラットフォーム設計情報
102. mogene10sttranscriptcluster.db
Affymetrix mogene10 annotation data (chip mogene10sttranscriptcluster)
Affymetrix mogene 10アノテーションデータ(チップmogene 10 sttranscriptcluster)
103. PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131
PolyPhen Predictions for Homo sapiens dbSNP build 131
ホモsapiens dbSNPビルド131のPolyPhen予測
104. BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9
Full genome sequences for Arabidopsis thaliana (TAIR9)
シロイヌナズナ(TAIR9)の全ゲノム配列
105. pd.mogene.2.0.st
Platform Design Info for Affymetrix MoGene-2_0-st
Affymetrix MoGene-2_0-stのプラットフォーム設計情報
106. lumiHumanAll.db
Illumina Human Illumina expression annotation data (chip lumiHumanAll)
イルミナヒューマンイルミナ表現アノテーションデータ(chip lumiHumanAll)
107. pd.huex.1.0.st.v2
Platform Design Info for Affymetrix HuEx-1_0-st-v2
Affymetrix HuEx-1_0-st-v2のプラットフォーム設計情報
108. FDb.UCSC.tRNAs
Annotation package for FeatureDb object(s)
FeatureDbオブジェクト用の注釈パッケージ
109. TxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
110. miRNAtap.db
Data for miRNAtap
miRNAtapのデータ
111. primeviewcdf
primeviewcdf
primeviewcdf
112. TxDb.Celegans.UCSC.ce11.ensGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
113. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer10
Full genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer10)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer10)の全ゲノム配列
114. hgu95av2
Affymetrix Human Genome U95 Set Annotation Data (hgu95av2)
Affymetrix Human Genome U95セットアノテーションデータ(hgu95av2)
115. TxDb.Celegans.UCSC.ce11.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
116. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 151)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 151)
117. hgu219.db
Affymetrix Human Genome 219 Plate annotation data (chip hgu219)
Affymetrix Human Genome 219プレートアノテーションデータ(チップhgu219)
118. pd.rat230.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Rat230_2
メーカー名Rat230_2用プラットフォームデザイン情報
119. ath1121501.db
Affymetrix Arabidopsis ATH1 Genome Array annotation data (chip ath1121501)
Affymetrix Arabidopsis ATH1ゲノムアレイアノテーションデータ(チップath1121501)
120. BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3
Full genome sequences for Canis lupus familiaris (UCSC version canFam3)
Canis lupus familiaris(UCSCバージョンcanFam3)の全ゲノム配列
121. hgu95acdf
hgu95acdf
hgu95acdf
122. GenomicState
Build and access GenomicState objects for use with derfinder tools from sources like Gencode
Gencodeなどのソースからderfinderツールで使用するGenomicStateオブジェクトを構築してアクセス
123. pd.hg.u133a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U133A
メーカー名HG-U133Aのプラットフォームデザイン情報
124. hugene20sttranscriptcluster.db
Affymetrix hugene20 annotation data (chip hugene20sttranscriptcluster)
Affymetrix hugene20アノテーションデータ(チップhugene20sttranscriptcluster)
125. TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer3.sgdGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
126. MafDb.ExAC.r1.0.hs37d5
Minor allele frequency data from ExAC release 1.0 for hs37d5
hs37d5のExACリリース1.0からのマイナーアレル頻度データ
127. org.Xl.eg.db
Genome wide annotation for Xenopus
Xenopusのゲノムワイドアノテーション
128. SIFT.Hsapiens.dbSNP137
PROVEAN/SIFT Predictions for Homo sapiens dbSNP build 137
ホモsapiens dbSNPビルド137のための証明/ SIFT予測
129. ath1121501cdf
ath1121501cdf
ath1121501cdf
130. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7
Full genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer7)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer7)の全ゲノム配列
131. hugene11sttranscriptcluster.db
Affymetrix hugene11 annotation data (chip hugene11sttranscriptcluster)
Affymetrix hugene11アノテーションデータ(チップhugene11sttranscriptcluster)
132. lumiHumanIDMapping
Illumina Identifier mapping for Human
人間のためのIllumina識別子マッピング
133. org.Ag.eg.db
Genome wide annotation for Anopheles
ハマダラカの全ゲノムアノテーション
134. BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1
Saccharomyces cerevisiae (Yeast) full genome (UCSC version sacCer1)
Saccharomyces cerevisiae(酵母)フルゲノム(UCSC版sacCer1)
135. phastCons100way.UCSC.hg38
UCSC phastCons conservation scores for hg38
hg38のUCSC phastCons保存スコア
136. rat2302.db
Affymetrix Rat Genome 230 2.0 Array annotation data (chip rat2302)
Affymetrix Rat Genome 230 2.0アレイ注釈データ(チップrat2302)
137. org.Pt.eg.db
Genome wide annotation for Chimp
チンパンジーのゲノムワイドアノテーション
138. pd.clariom.d.human
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_D_Human
Affymetrix Clariom_D_Humanのプラットフォーム設計情報
139. pd.clariom.s.mouse
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Mouse
Affymetrix Clariom_S_Mouseのプラットフォーム設計情報
140. human.db0
Base Level Annotation databases for human
人間のための基本レベル注釈データベース
141. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5
Full genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC version rn5)
Rattus norvegicus(UCSCバージョンrn5)の全ゲノム配列
142. LymphoSeqDB
LymphoSeq annotation databases
LymphoSeqアノテーションデータベース
143. mogene21sttranscriptcluster.db
Affymetrix mogene21 annotation data (chip mogene21sttranscriptcluster)
Affymetrix mogene 21アノテーションデータ(チップmogene 21 sttranscriptcluster)
144. pd.mogene.2.1.st
Platform Design Info for Affymetrix MoGene-2_1-st
Affymetrix MoGene-2_1-stのプラットフォーム設計情報
145. rae230a.db
Affymetrix Rat Expression Set 230 annotation data (chip rae230a)
Affymetrix Rat Expression Set 230アノテーションデータ(チップrae230a)
146. cMAP
A data package containing annotation data for cMAP
cMAP用の注釈データを含むデータパッケージ
147. org.EcSakai.eg.db
Genome wide annotation for E coli strain Sakai
大腸菌株酒井のゲノムワイドアノテーション
148. hgu133b.db
Affymetrix Human Genome U133 Set annotation data (chip hgu133b)
Affymetrix Human Genome U133アノテーションデータを設定する(チップhgu133b)
149. mouse430a2.db
Affymetrix Mouse Genome 430A 2.0 Array annotation data (chip mouse430a2)
Affymetrix Mouse Genome 430A 2.0アレイ注釈データ(チップマウス430a2)
150. pd.hg.u133a.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U133A_2
メーカー名HG-U133A_2のプラットフォームデザイン情報
151. TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart28
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
152. hgu133bcdf
hgu133bcdf
hgu133bcdf
153. LowMACAAnnotation
LowMACAAnnotation
LowMACAAnotation
154. MafDb.1Kgenomes.phase3.hs37d5
Minor allele frequency data from 1000 Genomes Phase 3 for hs37d5
hs37d5の1000ゲノムフェーズ3からのマイナーアレル頻度データ
155. TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
156. XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
Extra SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 144)
ホモサピエンスのための追加のSNPの場所(dbSNP Build 144)
157. celegans.db
Affymetrix celegans annotation data (chip celegans)
Affymetrix celegansアノテーションデータ(chip celegans)
158. hgu219cdf
hgu219cdf
hgu219cdf
159. clariomsmousetranscriptcluster.db
Affymetrix clariomsmouse annotation data (chip clariomsmousetranscriptcluster)
Affymetrix clariomsmouseアノテーションデータ(チップclariomsmousetranscriptcluster)
160. pd.hg.u95av2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95Av2
メーカー名HG_U95Av2のプラットフォームデザイン情報
161. pd.mouse430.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Mouse430_2
メーカー名Mouse430_2のプラットフォーム設計情報
162. rae230aprobe
Probe sequence data for microarrays of type rae230a
タイプrae230aのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
163. XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
Extra SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 144)
ホモサピエンスのための追加のSNPの場所(dbSNP Build 144)
164. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6
Full genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC version rn6)
Rattus norvegicus(UCSCバージョンrn6)の全ゲノム配列
165. HsAgilentDesign026652.db
Agilent Chips that use Agilent design number 026652 annotation data (chip HsAgilentDesign026652)
Agilentの設計番号026652の注釈データを使用するAgilentチップ(チップHsAgilentDesign026652)
166. hthgu133acdf
hthgu133acdf
hthgu133acdf
167. hugene10stprobeset.db
Affymetrix hugene10 annotation data (chip hugene10stprobeset)
Affymetrix hugene10アノテーションデータ(チップhugene10stprobeset)
168. MafDb.gnomADex.r2.1.hs37d5
Minor allele frequency data from gnomAD exomes release 2.1 for hs37d5
gnomADエキソームからのマイナーアレル頻度データはhs37d5のためのリリース2.1です。
169. mogene10stv1cdf
mogene10stv1cdf
mogene10stv1cdf
170. targetscan.Hs.eg.db
TargetScan miRNA target predictions for human
ヒトに対するTargetScan miRNAのターゲット予測
171. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 142)
ホモサピエンスのためのSNPの位置(dbSNP Build 142)
172. pd.mapping50k.xba240
Platform Design Info for Affymetrix Mapping50K_Xba240
Affymetrix Mapping 50K_Xba240のプラットフォーム設計情報
173. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11
Full genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer11)
Danio rerioの全ゲノム配列(UCSCバージョンdanRer11)
174. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked
Full masked genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm10)
Mus musculusのフルマスクゲノム配列(UCSCバージョンmm10)
175. hthgu133pluspmcdf
hthgu133pluspmcdf
hthgu133pluspmcdf
176. huex10sttranscriptcluster.db
Affymetrix huex10 annotation data (chip huex10sttranscriptcluster)
Affymetrix huex10アノテーションデータ(チップhuex10sttranscriptcluster)
177. metaboliteIDmapping
Mapping of Metabolite IDs from Different Sources
異なる情報源からの代謝物IDのマッピング
178. pd.hugene.2.1.st
Platform Design Info for Affymetrix HuGene-2_1-st
Affymetrix HuGene-2_1-stのプラットフォーム設計情報
179. rat2302cdf
rat2302cdf
rat2302cdf
180. RmiR.Hs.miRNA
Various databases of microRNA Targets
マイクロRNAターゲットの様々なデータベース
181. SIFT.Hsapiens.dbSNP132
SIFT Predictions for Homo sapiens dbSNP build 132
ホモsapiensのためのSIFT予測dbSNP build 132
182. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 132)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 132)
183. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 150)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 150)
184. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked
Full masked genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg18)
ホモサピエンスの完全マスクゲノム配列(UCSCバージョンhg18)
185. oligoData
Dataset samples for the oligo package
oligoパッケージ用のデータセットサンプル
186. pd.hugene.1.1.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix HuGene-1_1-st-v1
Affymetrix HuGene-1_1-st-v1のプラットフォーム設計情報
187. ENCODExplorerData
A compilation of ENCODE metadata
ENCODEメタデータの編集
188. TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
189. clariomdhumantranscriptcluster.db
Affymetrix clariomdhuman annotation data (chip clariomdhumantranscriptcluster)
Affymetrix clariomdhumanアノテーションデータ(チップclariomdhumantranscriptcluster)
190. humanCHRLOC
A data package containing annotation data for humanCHRLOC
humanCHRLOCのアノテーションデータを含むデータパッケージ
191. EnsDb.Mmusculus.v75
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
192. EnsDb.Rnorvegicus.v79
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
193. hta20transcriptcluster.db
Affymetrix hta20 annotation data (chip hta20transcriptcluster)
Affymetrix hta20アノテーションデータ(チップhta20transcriptcluster)
194. moe430a.db
Affymetrix Mouse Expression Set 430 annotation data (chip moe430a)
Affymetrix Mouse Expression Set 430アノテーションデータ(チップmoe430a)
195. pd.genomewidesnp.6
Platform Design Info for Affymetrix GenomeWideSNP_6
Affymetrix GenomeWideSNP_6のプラットフォーム設計情報
196. pd.hg.u219
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U219
メーカー名HG-U219用プラットフォームデザイン情報
197. yeast2.db
Affymetrix Yeast Genome 2.0 Array annotation data (chip yeast2)
Affymetrix Yeast Genome 2.0 Arrayアノテーションデータ(チップイースト2)
198. ecolicdf
ecolicdf
ecolicdf
199. hgfocuscdf
hgfocuscdf
hgfocuscdf
200. hgu133a2probe
Probe sequence data for microarrays of type hgu133a2
タイプhgu133a2のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
201. mogene20sttranscriptcluster.db
Affymetrix mogene20 annotation data (chip mogene20sttranscriptcluster)
Affymetrix mogene 20アノテーションデータ(チップmogene 20 sttranscriptcluster)
202. BSgenome.Osativa.MSU.MSU7
Oryza sativa full genome (MSU7)
オリザサティバフルゲノム(MSU7)
203. hgfocus.db
Affymetrix Human Genome Focus Array annotation data (chip hgfocus)
Affymetrix Human Genome Focus Arrayアノテーションデータ(チップhgfocus)
204. TxDb.Mmusculus.UCSC.mm39.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトのアノテーションパッケージ
205. BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr11
Full genome sequences for Sus scrofa (UCSC version susScr11)
Sus scrofaの全ゲノム配列(UCSCバージョンsusScr11)
206. hugene10stv1probe
Probe sequence data for microarrays of type hugene10stv1
タイプhugene10stv1のマイクロアレイのプローブ配列データ
207. MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5
Minor allele frequency data from gnomAD release 2.1 for hs37d5
hs37d5のgnomADリリース2.1からのマイナーアレル頻度データ
208. pd.mirna.4.0
Platform Design Info for Affymetrix miRNA-4_0
Affymetrix miRNA-4_0のプラットフォーム設計情報
209. Rattus.norvegicus
Annotation package for the Rattus.norvegicus object
Rattus.norvegicusオブジェクト用の注釈パッケージ
210. BSgenome.Celegans.UCSC.ce10
Full genome sequences for Caenorhabditis elegans (UCSC version ce10)
線虫Caenorhabditis elegans(UCSCバージョンce10)の全ゲノム配列
211. EpiTxDb.Hs.hg38
Annotation package for EpiTxDb objects
EpiTxDb オブジェクトのアノテーションパッケージ
212. hgu133plus2frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type hgu133plus2
frmaがhgu133plus2型のマイクロアレイに使用するベクトル
213. pd.hg.u95a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95A
メーカー名HG_U95A用プラットフォームデザイン情報
214. clariomshumantranscriptcluster.db
Affymetrix clariomshuman annotation data (chip clariomshumantranscriptcluster)
Affymetrix clariomshumanアノテーションデータ(チップclariomshumant transcriptcluster)
215. IlluminaHumanMethylation27k.db
Illumina Illumina Human Methylation 27k annotation data (chip IlluminaHumanMethylation27k)
Illumina Illuminaヒューマンメチル化27kアノテーションデータ(チップIlluminaHumanMethilation27k)
216. pd.mta.1.0
Platform Design Info for Affymetrix MTA-1_0
Affymetrix MTA-1_0のプラットフォーム設計情報
217. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2
Full genome sequences for Drosophila melanogaster (UCSC version dm2)
キイロショウジョウバエ(UCSCバージョンdm2)の全ゲノム配列
218. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked
Full masked genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm9)
Mus musculusのフルマスクゲノム配列(UCSCバージョンmm9)
219. FDb.InfiniumMethylation.hg18
Annotation package for Illumina Infinium DNA methylation probes
Illumina Infinium DNAメチル化プローブ用のアノテーションパッケージ
220. genomewidesnp6Crlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
221. pd.ht.hg.u133.plus.pm
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HT_HG-U133_Plus_PM
メーカー名用のプラットフォーム設計情報HT_HG-U133_Plus_PM
222. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 137)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 137)
223. MafDb.1Kgenomes.phase3.GRCh38
Minor allele frequency data from 1000 Genomes Phase 3 for GRCh38
GRCh38の1000ゲノムフェーズ3からのマイナーアレル頻度データ
224. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal6
Full genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal6)
Gallus gallusの全ゲノム配列(UCSCバージョンgalGal6)
225. mgu74av2.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74av2)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74av2)
226. pd.genomewidesnp.5
Platform Design Info for Affymetrix GenomeWideSNP_5
Affymetrix GenomeWideSNP_5のプラットフォーム設計情報
227. pd.hg18.60mer.expr
Platform Design Info for NimbleGen hg18_60mer_expr
NimbleGen hg18_60mer_exprのプラットフォーム設計情報
228. pd.mapping250k.nsp
Platform Design Info for Affymetrix Mapping250K_Nsp
Affymetrix Mapping250K_Nspのプラットフォーム設計情報
229. pd.mapping250k.sty
Platform Design Info for Affymetrix Mapping250K_Sty
Affymetrix Mapping250K_Styのプラットフォーム設計情報
230. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9
Full genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau9)
Bos taurusの全ゲノム配列(UCSCバージョンbosTau9)
231. clariomdhumanprobeset.db
Affymetrix clariomdhuman annotation data (chip clariomdhumanprobeset)
Affymetrix clariomdhumanアノテーションデータ(チップclariomdhumanprobeset)
232. hugene21sttranscriptcluster.db
Affymetrix hugene21 annotation data (chip hugene21sttranscriptcluster)
Affymetrix hugene21アノテーションデータ(チップhugene21sttranscriptcluster)
233. IlluminaHumanMethylation27kanno.ilmn12.hg19
Annotation for Illumina’s 27k methylation arrays
Illuminaの27kメチル化アレイのアノテーション
234. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 141)
ホモサピエンスのSNPロケーション(dbSNP Build 141)
235. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3
Full genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal3)
Gallus gallus(UCSCバージョンgalGal3)の全ゲノム配列
236. hgu133afrmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type hgu133a
frmaがhgu133a型のマイクロアレイに使用するベクトル
237. IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b3.hg19
Annotation for Illumina’s EPIC methylation arrays
IlluminaのEPICメチル化アレイのアノテーション
238. illuminaHumanWGDASLv4.db
Illumina HumanWGDASLv4 annotation data (chip illuminaHumanWGDASLv4)
Illumina HumanWGDASLv4アノテーションデータ(チップilluminaHumanWGDASLv4)
239. mouse430a2cdf
mouse430a2cdf
mouse430a2cdf
240. pd.ath1.121501
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name ATH1-121501
メーカー名ATH1-121501のプラットフォーム設計情報
241. TxDb.Sscrofa.UCSC.susScr11.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
242. u133aaofav2cdf
u133aaofav2cdf
u133aaofav2cdf
243. yeast2cdf
yeast2cdf
イースト2cdf
244. adme16cod.db
Codelink ADME Rat 16-Assay Bioarray annotation data (chip adme16cod)
Codelink ADME Rat 16-Assayバイオアレイアノテーションデータ(chip adme16cod)
245. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6
Full genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau6)
Bos taurusの全ゲノム配列(UCSCバージョンbosTau6)
246. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau8
Full genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau8)
Bos taurus(UCSCバージョンbosTau8)の全ゲノム配列
247. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac10
Full genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac10)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac10)の全ゲノム配列
248. celeganscdf
celeganscdf
celeganscdf
249. drosophila2.db
Affymetrix Drosophila Genome 2.0 Array annotation data (chip drosophila2)
Affymetrix Drosophila Genome 2.0アレイ注釈データ(チップdrosophila 2)
250. EuPathDB
Provides access to pathogen annotation resources available on EuPathDB databases
EuPathDBデータベースで利用可能な病原体注釈リソースへのアクセスを提供します
251. MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38
Minor allele frequency data from gnomAD release 2.1 for GRCh38
GRCh38のgnomADリリース2.1からのマイナーアレル頻度データ
252. mgu74av2cdf
mgu74av2cdf
mgu74av2cdf
253. mirna10cdf
mirna10cdf
mirna10cdf
254. pd.moex.1.0.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix MoEx-1_0-st-v1
Affymetrix MoEx-1_0-st-v1のプラットフォーム設計情報
255. rgu34a.db
Affymetrix Rat Genome U34 Set annotation data (chip rgu34a)
Affymetrix Rat Genome U34アノテーションデータの設定(チップrgu34a)
256. RnAgilentDesign028282.db
Agilent Chips that use Agilent design number 028282 annotation data (chip RnAgilentDesign028282)
Agilentの設計番号028282アノテーションデータを使用するAgilentチップ(チップRnAgilentDesign028282)
257. TxDb.Btaurus.UCSC.bosTau9.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
258. TxDb.Drerio.UCSC.danRer11.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
259. TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト(複数)のアノテーションパッケージ
260. u133x3p.db
Affymetrix Human X3P Array annotation data (chip u133x3p)
Affymetrix Human X3P Arrayアノテーションデータ(チップu133x3p)
261. ygs98.db
Affymetrix Yeast Genome S98 Array annotation data (chip ygs98)
Affymetrix Yeast Genome S98アレイアノテーションデータ(チップygs98)
262. zebrafish.db
Affymetrix zebrafish annotation data (chip zebrafish)
Affymetrixゼブラフィッシュアノテーションデータ(チップゼブラフィッシュ)
263. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8
Full genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm8)
Mus musculusの全ゲノム配列(UCSCバージョンmm8)
264. ChemmineDrugs
DrugBank data set
DrugBankデータセット
265. drosgenome1.db
Affymetrix Drosophila Genome Array annotation data (chip drosgenome1)
Affymetrix Drosophila Genome Arrayアノテーションデータ(チップdrosgenome1)
266. geneplast.data.string.v91
Input data for the geneplast package
ジェネプラストパッケージの入力データ
267. grasp2db
grasp2db, sqlite wrap of GRASP 2.0
grasp2db、GRASP 2.0のSQLiteラップ
268. hgug4100a.db
Agilent Human 1 cDNA Microarray Kit annotation data (chip hgug4100a)
Agilent Human 1 cDNAマイクロアレイキットのアノテーションデータ(チップhgug4100a)
269. IlluminaHumanMethylation450kprobe
Probe sequence data for microarrays of type IlluminaHumanMethylation450k
タイプIlluminaHumanMethilation450kのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
270. lumiMouseAll.db
Illumina Mouse Illumina expression annotation data (chip lumiMouseAll)
Illumina Mouse Illumina式注釈データ(chip lumiMouseAll)
271. MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5
Minor allele frequency data from 1000 Genomes Phase 1 for hs37d5
hs37d5の1000ゲノムフェーズ1からのマイナーアレル頻度データ
272. pd.clariom.s.human.ht
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Human_HT
Affymetrix Clariom_S_Human_HTのプラットフォーム設計情報
273. pd.hg.u133b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U133B
メーカー名HG-U133B用プラットフォームデザイン情報
274. pd.ht.hg.u133a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HT_HG-U133A
メーカー名HT_HG-U133Aのプラットフォーム設計情報
275. pd.mapping50k.hind240
Platform Design Info for Affymetrix Mapping50K_Hind240
Affymetrix Mapping 50K_Hind240のプラットフォーム設計情報
276. primeviewprobe
Probe sequence data for microarrays of type primeview
primeviewタイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
277. rgu34acdf
rgu34acdf
rgu34acdf
278. ricecdf
ricecdf
ricecdf
279. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38
SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 149)
ホモサピエンスのSNP位置(dbSNP Build 149)
280. TxDb.Ggallus.UCSC.galGal5.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
281. ath1121501probe
Probe sequence data for microarrays of type ath1121501
タイプath1121501のマイクロアレイのプローブシーケンスデータ
282. BSgenome.Mfascicularis.NCBI.5.0
Full genome sequences for Macaca fascicularis (Macaca_fascicularis_5.0)
Macaca fascicularisの全ゲノム配列(Macaca_fascicularis_5.0)
283. chicken.db
Affymetrix chicken annotation data (chip chicken)
Affymetrixチキンアノテーションデータ(チップチキン)
284. chromhmmData
Chromosome Size, Coordinates and Anchor Files
クロモゾームサイズ、座標、アンカーファイル
285. clariomshumanhttranscriptcluster.db
Affymetrix clariomshumanht annotation data (chip clariomshumanhttranscriptcluster)
Affymetrix clariomshumanhtアノテーションデータ(チップclariomshumanhttranscriptcluster)
286. hgfocusprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgfocus
タイプhgfocusのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
287. hgu95b.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95b)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95b)
288. hgug4110b.db
Agilent Human 1A (V2) annotation data (chip hgug4110b)
Agilentヒューマン1A(V2)アノテーションデータ(チップhgug4110b)
289. hu35ksubb.db
Affymetrix Human Genome HU35K Set annotation data (chip hu35ksubb)
Affymetrix Human Genome HU35Kアノテーションデータを設定(チップhu35ksubb)
290. hu6800cdf
hu6800cdf
hu6800cdf
291. IlluminaHumanMethylation27kmanifest
Annotation for Illumina’s 27k methylation arrays
Illuminaの27kメチル化アレイのアノテーション
292. mgu74a.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74a)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74a)
293. mogene10stprobeset.db
Affymetrix mogene10 annotation data (chip mogene10stprobeset)
Affymetrix mogene 10アノテーションデータ(チップmogene 10 stprobeset)
294. org.Mxanthus.db
Genome wide annotation for Myxococcus xanthus DK 1622
Myxococcus xanthus DK 1622のゲノムワイド注釈
295. pd.u133.x3p
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name U133_X3P
メーカー名U133_X3Pのプラットフォーム設計情報
296. arabidopsis.db0
Base Level Annotation databases for arabidopsis
アラビドプシスのためのベースレベルアノテーションデータベース
297. bovine.db
Affymetrix bovine annotation data (chip bovine)
Affymetrixウシ注釈データ(チップウシ)
298. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked
Full masked genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau6)
Bos taurus(UCSCバージョンbosTau6)の完全マスクゲノム配列
299. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4
Full genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal4)
Gallus gallus(UCSCバージョンgalGal4)の全ゲノム配列
300. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked
Full masked genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC version rn5)
Rattus norvegicus(UCSCバージョンrn5)のフルマスクゲノム配列
301. BSgenome.Tgondii.ToxoDB.7.0
Toxoplasma gondii ME49 (ToxoDB-7.0)
トキソプラズマゴンディME49(ToxoDB-7.0)
302. drosophila2cdf
drosophila2cdf
drosophila2cdf
303. genomewidesnp5Crlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
304. h20kcod.db
Codelink UniSet Human 20k I Bioarray annotation data (chip h20kcod)
Codelink UniSet Human 20k Iバイオアレイアノテーションデータ(チップh20kcod)
305. hgu95e.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95e)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95e)
306. hgug4845a.db
agilent AMADID 026652 annotation data (chip hgug4845a)
agilent AMADID 026652アノテーションデータ(チップhgug4845a)
307. hta20probeset.db
Affymetrix hta20 annotation data (chip hta20probeset)
Affymetrix hta20アノテーションデータ(チップhta20プローブセット)
308. hthgu133b.db
Affymetrix HT Human Genome U133 Array Plate Set annotation data (chip hthgu133b)
Affymetrix HTヒトゲノムU133アレイプレートセットアノテーションデータ(チップhthgu133b)
309. hugene20stprobeset.db
Affymetrix hugene20 annotation data (chip hugene20stprobeset)
Affymetrix hugene20アノテーションデータ(チップhugene20stprobeset)
310. MmAgilentDesign026655.db
Agilent Chips that use Agilent design number 026655 annotation data (chip MmAgilentDesign026655)
Agilentの設計番号026655の注釈データを使用するAgilentチップ(チップMmAgilentDesign026655)
311. pd.clariom.s.rat
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Rat
Affymetrix Clariom_S_Ratのプラットフォーム設計情報
312. pd.hg.focus
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-Focus
メーカー名HG-Focusのプラットフォーム設計情報
313. pd.mirna.1.0
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name miRNA-1_0
製造元の名前のためのプラットフォーム設計情報miRNA-1_0
314. pd.moe430a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MOE430A
メーカー名MOE430Aのプラットフォームデザイン情報
315. pd.rhesus
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Rhesus
メーカー名Rhesusのプラットフォーム設計情報
316. ag.db
Affymetrix Arabidopsis Genome Array annotation data (chip ag)
Affymetrix Arabidopsisゲノムアレイアノテーションデータ(チップag)
317. AHMeSHDbs
MeSHDbs for AnnotationHub
MeSHDbs(アノテーションハブ用
318. AHPathbankDbs
Metabolites and proteins linked to PathBank pathways (for AnnotationHub)
PathBankパスウェイにリンクした代謝物・タンパク質(AnnotationHub用
319. barley1probe
Probe sequence data for microarrays of type barley1
オオムギ1型のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
320. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg17)
ホモサピエンスの全ゲノム配列(UCSCバージョンhg17)
321. canine.db
Affymetrix canine annotation data (chip canine)
Affymetrix犬の注釈データ(チップ犬)
322. clariomsrattranscriptcluster.db
Affymetrix clariomsrat annotation data (chip clariomsrattranscriptcluster)
Affymetrix clariomsratアノテーションデータ(chip clariomsrattranscriptcluster)
323. drosgenome1cdf
drosgenome1cdf
drosgenome1cdf
324. hgu133bprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu133b
タイプhgu133bのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
325. hgu95d.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95d)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95d)
326. hu35ksuba.db
Affymetrix Human Genome HU35K Set annotation data (chip hu35ksuba)
Affymetrix Human Genome HU35Kアノテーションデータを設定(チップhu35ksuba)
327. hu35ksubbcdf
hu35ksubbcdf
hu35ksubbcdf
328. hu35ksubd.db
Affymetrix Human Genome HU35K Set annotation data (chip hu35ksubd)
Affymetrix Human Genome HU35Kアノテーションデータを設定(チップhu35ksubd)
329. mgu74cv2.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74cv2)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74cv2)
330. mgug4122a.db
Agilent “Mouse Genome, Whole” annotation data (chip mgug4122a)
アジレントの「Mouse Genome、Whole」アノテーションデータ(チップmgug4122a)
331. mirna20cdf
mirna20cdf
mirna20cdf
332. moe430acdf
moe430acdf
moe430acdf
333. moe430aprobe
Probe sequence data for microarrays of type moe430a
moe430aタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
334. moe430b.db
Affymetrix Mouse Expression Set 430 annotation data (chip moe430b)
Affymetrix Mouse Expression Set 430アノテーションデータ(チップmoe430b)
335. mouse4302probe
Probe sequence data for microarrays of type mouse4302
タイプmouse4302のマイクロアレイのプローブシーケンスデータ
336. pd.mg.u74b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74B
メーカー名に対するプラットフォーム設計情報MG_U74B
337. pd.mg.u74bv2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74Bv2
メーカー名に対するプラットフォーム設計情報MG_U74Bv2
338. pd.mirna.3.0
Platform Design Info for Affymetrix miRNA-3_0
Affymetrix miRNA-3_0のプラットフォーム設計情報
339. pd.mu11ksubb
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Mu11KsubB
メーカー名Mu11KsubBのプラットフォーム設計情報
340. pd.rice
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Rice
メーカー名Riceのプラットフォーム設計情報
341. pd.zebgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix ZebGene-1_1-st
Affymetrix ZebGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
342. pedbarrayv10.db
FHCRC Nelson Lab pedbarrayv10 Annotation Data (pedbarrayv10)
FHCRC Nelson Lab pedbarrayv10アノテーションデータ(pedbarrayv10)
343. plasmodiumanophelescdf
plasmodiumanophelescdf
Plasmodiumanophelescdf
344. porcineprobe
Probe sequence data for microarrays of type porcine
ブタ型マイクロアレイのプローブ配列データ
345. rat2302probe
Probe sequence data for microarrays of type rat2302
rat2302型のマイクロアレイのプローブ配列データ
346. rgu34c.db
Affymetrix Rat Genome U34 Set annotation data (chip rgu34c)
Affymetrix Rat Genome U34アノテーションデータを設定する(チップrgu34c)
347. rgug4131a.db
Agilent “Rat Genome, Whole” annotation data (chip rgug4131a)
Agilentの「ラットゲノム、全」アノテーションデータ(チップrgug4131a)
348. rnu34.db
Affymetrix Rat Neurobiology U34 Array annotation data (chip rnu34)
Affymetrix Rat Neurobiology U34アレイ注釈データ(チップrnu34)
349. u133x3pcdf
u133x3pcdf
u133x3pcdf
350. zebrafishcdf
zebrafishcdf
ゼブラフィッシュcdf
351. agcdf
agcdf
agcdf
352. AHEnsDbs
EnsDbs for AnnotationHub
AnnotationHubのEnsDbs
353. alternativeSplicingEvents.hg38
Alternative splicing event annotation for Human (hg38)
Human(hg38)のオルタナティブスプライシングイベントアノテーション
354. BSgenome.Athaliana.TAIR.04232008
Full genome sequences for Arabidopsis thaliana (TAIR version from April 23, 2008)
シロイヌナズナの全ゲノム配列(2008年4月23日からのTAIR版)
355. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal5
Full genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal5)
Gallus gallus(UCSCバージョンgalGal5)の全ゲノム配列
356. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2
Full masked genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac2)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac2)の完全マスクゲノム配列
357. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3
Full masked genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac3)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac3)の完全マスクゲノム配列
358. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39
Full genome sequences for Mus musculus (UCSC genome mm39, based on GRCm39)
Mus musculusの全ゲノム配列 (UCSC genome mm39, GRCm39に基づく)
359. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro5
Full genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro5)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro5)の全ゲノム配列
360. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4
Full genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC version rn4)
Rattus norvegicus(UCSCバージョンrn4)の全ゲノム配列
361. bsubtilisprobe
Probe sequence data for microarrays of type bsubtilis
枯草菌タイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
362. canine2.db
Affymetrix canine2 annotation data (chip canine2)
Affymetrix canine2アノテーションデータ(チップcanine2)
363. canine2probe
Probe sequence data for microarrays of type canine2
イヌ2型のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
364. clariomsmousehttranscriptcluster.db
Affymetrix clariomsmouseht annotation data (chip clariomsmousehttranscriptcluster)
Affymetrix clariomsmousehtアノテーションデータ(チップclariomsmousehttranscriptcluster)
365. ecoli2.db
Affymetrix E. coli Genome 2.0 Array annotation data (chip ecoli2)
Affymetrix E. coli Genome 2.0アレイアノテーションデータ(チップecoli 2)
366. hgu133atagcdf
hgu133atagcdf
hgu133atagcdf
367. hgu95c.db
Affymetrix Human Genome U95 Set annotation data (chip hgu95c)
Affymetrix Human Genome U95アノテーションデータを設定(チップhgu95c)
368. hgu95cprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95c
タイプhgu95cのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
369. hgu95eprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95e
タイプhgu95eのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
370. hthgu133aprobe
Probe sequence data for microarrays of type hthgu133a
hthgu133a型のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
371. htmg430pmcdf
htmg430pmcdf
htmg430pmcdf
372. hugene.1.0.st.v1frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type hugene.1.0.st.v1frmavecs
frmaがhugene.1.0.st.v1frmavecs型のマイクロアレイに使用するベクトル
373. human370v1cCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
374. hwgcod.db
Codelink Human Whole Genome Bioarray (~55 000 human genes) annotation data (chip hwgcod)
Codelinkヒト全ゲノムバイオアレイ(〜55 000ヒト遺伝子)注釈データ(チップhwgcod)
375. illuminaHumanWGDASLv3.db
Illumina HumanHT12WGDASLv3 annotation data (chip illuminaHumanWGDASLv3)
Illumina HumanHT12WGDASLv3アノテーションデータ(チップilluminaHumanWGDASLv3)
376. MafDb.TOPMed.freeze5.hg19
Minor allele frequency data from TOPMed for hg19
hg19用のTOPMedからのマイナーアレル頻度データ
377. moex10sttranscriptcluster.db
Affymetrix moex10 annotation data (chip moex10sttranscriptcluster)
Affymetrix moex10アノテーションデータ(チップmoex10sttranscriptcluster)
378. mogene20stprobeset.db
Affymetrix mogene20 annotation data (chip mogene20stprobeset)
Affymetrix mogene 20アノテーションデータ(チップmogene 20 stprobeset)
379. mu19ksuba.db
Affymetrix Murine Genome 19k Set annotation data (chip mu19ksuba)
Affymetrix Murine Genome 19kアノテーションデータを設定(チップmu19ksuba)
380. pd.e.coli.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name E_coli_2
メーカー名E_coli_2のプラットフォーム設計情報
381. pd.hu6800
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Hu6800
メーカー名Hu6800のプラットフォーム設計情報
382. pd.mouse430a.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Mouse430A_2
メーカー名Mouse430A_2のプラットフォーム設計情報
383. porcine.db
Affymetrix porcine annotation data (chip porcine)
Affymetrixブタアノテーションデータ(チップブタ)
384. rae230acdf
rae230acdf
rae230acdf
385. rae230b.db
Affymetrix Rat Expression Set 230 annotation data (chip rae230b)
Affymetrix Rat Expression Set 230アノテーションデータ(チップrae230b)
386. rgu34aprobe
Probe sequence data for microarrays of type rgu34a
タイプrgu34aのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
387. ygs98cdf
ygs98cdf
ygs98cdf
388. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3
Full genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau3)
Bos taurusの全ゲノム配列(UCSCバージョンbosTau3)
389. BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2
Full genome sequences for Canis lupus familiaris (UCSC version canFam2)
Canis lupus familiaris(UCSCバージョンcanFam2)の全ゲノム配列
390. BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked
Full masked genome sequences for Canis lupus familiaris (UCSC version canFam2)
Canis lupus familiaris(UCSCバージョンcanFam2)の完全マスクゲノム配列
391. BSgenome.Cjacchus.UCSC.calJac3
Full genome sequences for Callithrix jacchus (UCSC version calJac3)
Callithrix jacchus(UCSCバージョンcalJac3)の全ゲノム配列
392. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked
Full masked genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg17)
ホモサピエンスの完全マスクゲノム配列(UCSCバージョンhg17)
393. BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked
Full masked genome sequences for Mus musculus (UCSC version mm8)
Mus musculusのフルマスクゲノム配列(UCSCバージョンmm8)
394. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3
Full genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro3)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro3)の全ゲノム配列
395. canineprobe
Probe sequence data for microarrays of type canine
イヌ型マイクロアレイ用のプローブ配列データ
396. ecoli2probe
Probe sequence data for microarrays of type ecoli2
タイプecoli2のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
397. fitCons.UCSC.hg19
UCSC fitCons fitness consequences scores for hg19
hg19のUCSC fitConsフィットネス結果スコア
398. hs25kresogen.db
RNG_MRC Human Pangenomic 25k Set annotation data (chip hs25kresogen)
RNG_MRC Human Pangenomic 25kアノテーションデータを設定(チップhs25kresogen)
399. Hs6UG171.db
A package containing metadata for Hs6UG171 arrays
Hs6UG171配列のメタデータを含むパッケージ
400. hthgu133pluspmprobe
Probe sequence data for microarrays of type hthgu133pluspm
hthgu133pluspmタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
401. htratfocuscdf
htratfocuscdf
htratfocuscdf
402. hu35ksubc.db
Affymetrix Human Genome HU35K Set annotation data (chip hu35ksubc)
Affymetrix Human Genome HU35Kアノテーションデータを設定(チップhu35ksubc)
403. hugene11stprobeset.db
Affymetrix hugene11 annotation data (chip hugene11stprobeset)
Affymetrix hugene11アノテーションデータ(チップhugene11stprobeset)
404. illuminaHumanv2BeadID.db
Illumina HumanWGv2 annotation data (chip illuminaHumanv2BeadID)
Illumina HumanWGv2アノテーションデータ(チップilluminaHumanv2BeadID)
405. mgu74aprobe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74a
タイプmgu74aのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
406. mm24kresogen.db
RNG_MRC Mouse Pangenomic 24k Set annotation data (chip mm24kresogen)
RNG_MRCマウスPangenomic 24kアノテーションデータを設定(チップmm24kresogen)
407. mogene21stprobeset.db
Affymetrix mogene21 annotation data (chip mogene21stprobeset)
Affymetrix mogene 21アノテーションデータ(チップmogene 21 stprobeset)
408. mouse.db0
Base Level Annotation databases for mouse
マウス用基本レベル注釈データベース
409. mouse4302frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type mouse4302
タイプmouse4302のマイクロアレイにfrmaが使用するベクトル
410. mta10transcriptcluster.db
Affymetrix mta10 annotation data (chip mta10transcriptcluster)
Affymetrix mta10アノテーションデータ(チップmta10transcriptcluster)
411. mu6500subdcdf
mu6500subdcdf
mu6500subdcdf
412. mwgcod.db
Codelink Mouse Whole Genome Bioarray (~36 000 mouse gene targets) annotation data (chip mwgcod)
Codelink Mouse Whole Genomeバイオアレイ(〜36 000マウス遺伝子ターゲット)注釈データ(チップmwgcod)
413. pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter
Platform Design Info for NimbleGen 2006-07-18_hg18_refseq_promoter
NimbleGen 2006-07-18_hg18_refseq_promoterのプラットフォームデザイン情報
414. pd.bovine
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Bovine
メーカー名Bovineのプラットフォーム設計情報
415. pd.charm.hg18.example
Platform Design Info for NimbleGen charm_hg18_example
NimbleGenのプラットフォーム設計情報charm_hg18_example
416. pd.clariom.s.mouse.ht
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Mouse_HT
Affymetrix Clariom_S_Mouse_HTのプラットフォーム設計情報
417. pd.clariom.s.rat.ht
Platform Design Info for Affymetrix Clariom_S_Rat_HT
Affymetrix Clariom_S_Rat_HTのプラットフォーム設計情報
418. pd.hg.u133a.tag
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG-U133A_tag
メーカー名HG-U133A_tagのプラットフォームデザイン情報
419. pd.mirna.3.1
Platform Design Info for Affymetrix miRNA-3_1
Affymetrix miRNA-3_1のプラットフォーム設計情報
420. pd.porcine
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Porcine
メーカー名Porcineのプラットフォーム設計情報
421. pd.ragene.2.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RaGene-2_0-st
Affymetrix RaGene-2_0-stのプラットフォーム設計情報
422. pd.rg.u34b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RG_U34B
メーカー名RG_U34Bのプラットフォーム設計情報
423. pd.wheat
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name wheat
メーカー名の小麦のプラットフォーム設計情報
424. pd.yeast.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Yeast_2
メーカー名Yeast_2のプラットフォーム設計情報
425. pedbarrayv9.db
FHCRC Nelson Lab pedbarrayv9 Annotation Data (pedbarrayv9)
FHCRC Nelson Lab pedbarrayv9アノテーションデータ(pedbarrayv9)
426. phastCons7way.UCSC.hg38
UCSC phastCons conservation scores for hg38
hg38のUCSC phastCons保存スコア
427. ragene10sttranscriptcluster.db
Affymetrix ragene10 annotation data (chip ragene10sttranscriptcluster)
Affymetrix ragene 10アノテーションデータ(チップragene 10sttranscriptcluster)
428. ragene20sttranscriptcluster.db
Affymetrix ragene20 annotation data (chip ragene20sttranscriptcluster)
Affymetrix ragene20アノテーションデータ(チップragene20sttranscriptcluster)
429. rgu34b.db
Affymetrix Rat Genome U34 Set annotation data (chip rgu34b)
Affymetrix Rat Genome U34アノテーションデータを設定する(チップrgu34b)
430. ri16cod.db
Codelink Rat Inflammation 16 Bioarray annotation data (chip ri16cod)
Codelink Rat Inflammation 16バイオアレイアノテーションデータ(チップri16cod)
431. riceprobe
Probe sequence data for microarrays of type rice
米型マイクロアレイのためのプローブ配列データ
432. soybeanprobe
Probe sequence data for microarrays of type soybean
ダイズ型マイクロアレイのためのプローブ配列データ
433. targetscan.Mm.eg.db
TargetScan miRNA target predictions for mouse
マウスのTargetScan miRNAターゲット予測
434. tomatoprobe
Probe sequence data for microarrays of type tomato
トマト型マイクロアレイのプローブ配列データ
435. TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
436. TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac10.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
437. yeast2probe
Probe sequence data for microarrays of type yeast2
酵母2型のマイクロアレイのプローブ配列データ
438. agprobe
Probe sequence data for microarrays of type ag
タイプagのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
439. AHPubMedDbs
SQLites, tibbles, and data.tables for AnnotationHub
SQLites, tibbles, data.tables for AnnotationHub
440. alternativeSplicingEvents.hg19
Alternative splicing event annotation for Human (hg19)
Human(hg19)のオルタナティブスプライシングイベントアノテーション
441. BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2
Full genome sequences for Apis mellifera (UCSC version apiMel2)
Apis mellifera(UCSCバージョンapiMel2)の全ゲノム配列
442. BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked
Full masked genome sequences for Apis mellifera (UCSC version apiMel2)
Apis mellifera(UCSCバージョンapiMel2)の完全マスクゲノム配列
443. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3.masked
Full masked genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau3)
Bos taurus(UCSCバージョンbosTau3)の完全マスクゲノム配列
444. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4.masked
Full masked genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau4)
Bos taurus(UCSCバージョンbosTau4)の完全マスクゲノム配列
445. BSgenome.Celegans.UCSC.ce6
Full genome sequences for Caenorhabditis elegans (UCSC version ce6)
Caenorhabditis elegans(UCSCバージョンce6)の全ゲノム配列
446. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2.masked
Full masked genome sequences for Drosophila melanogaster (UCSC version dm2)
キイロショウジョウバエ(UCSCバージョンdm2)の完全マスクゲノム配列
447. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5.masked
Full masked genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer5)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer5)のフルマスクゲノム配列
448. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2.masked
Full masked genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac2)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac2)の完全マスクゲノム配列
449. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3.masked
Full masked genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac3)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac3)の完全マスクゲノム配列
450. BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3
Full genome sequences for Sus scrofa (UCSC version susScr3)
Sus scrofaの全ゲノム配列(UCSCバージョンsusScr3)
451. BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked
Full masked genome sequences for Sus scrofa (UCSC version susScr3)
Sus scrofa(UCSCバージョンsusScr3)の完全マスクゲノム配列
452. clariomsrathttranscriptcluster.db
Affymetrix clariomsratht annotation data (chip clariomsrathttranscriptcluster)
Affymetrix clariomsrathtアノテーションデータ(chip clariomsrathttranscriptcluster)
453. ecoli2cdf
ecoli2cdf
ecoli2cdf
454. EpiTxDb.Mm.mm10
Annotation package for EpiTxDb objects
EpiTxDb オブジェクトのアノテーションパッケージ
455. FDb.FANTOM4.promoters.hg19
Annotation package for FANTOM4 promoters identified from THP-1 cells
THP-1細胞から同定されたFANTOM4プロモーターのアノテーションパッケージ
456. GGHumanMethCancerPanelv1.db
Illumina Golden Gate Human Methylation Cancer Panel Version 1 annotation data (chip GGHumanMethCancerPanelv1)
Illumina Golden Gateヒトメチル化がんパネルバージョン1注釈データ(チップGGHumanMethCancerPanelv1)
457. hcg110.db
Affymetrix Human Cancer G110 Array annotation data (chip hcg110)
Affymetrix Human Cancer G110アレイアノテーションデータ(チップhcg110)
458. hgu133a2frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type hgu133a2
frmaがhgu133a2型のマイクロアレイに使用するベクトル
459. hgu133atagprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu133atag
タイプhgu133atagのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
460. hgu95dprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95d
タイプhgu95dのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
461. hgubeta7.db
Unknown annotation data (chip hgubeta7)
未知の注釈データ(チップhgubeta7)
462. hgug4101a.db
Agilent Human 2 cDNA Microarry Kit annotation data (chip hgug4101a)
Agilent Human 2 cDNAマイクロアレイキットのアノテーションデータ(チップhgug4101a)
463. hgug4111a.db
Agilent Human 1B annotation data (chip hgug4111a)
Agilent Human 1Bアノテーションデータ(チップhgug4111a)
464. hguqiagenv3.db
Qiagen Qiagen V3.0 oligo set annotation data (chip hguqiagenv3)
Qiagen Qiagen V3.0オリゴセット注釈データ(チップhguqiagenv3)
465. hi16cod.db
Codelink Human Inflammation 16 Bioarray annotation data (chip hi16cod)
Codelink Human Inflammation 16バイオアレイアノテーションデータ(チップhi16cod)
466. hthgu133afrmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type hthgu133a
frmaがhthgu133a型のマイクロアレイに使用するベクトル
467. hthgu133bprobe
Probe sequence data for microarrays of type hthgu133b
タイプhthgu133bのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
468. htmg430bprobe
Probe sequence data for microarrays of type htmg430b
タイプhtmg430bのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
469. hu35ksubcprobe
Probe sequence data for microarrays of type hu35ksubc
タイプhu35ksubcのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
470. hu35ksubdcdf
hu35ksubdcdf
hu35ksubdcdf
471. hu6800probe
Probe sequence data for microarrays of type hu6800
タイプhu6800のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
472. huex10stprobeset.db
Affymetrix huex10 annotation data (chip huex10stprobeset)
Affymetrix huex10アノテーションデータ(チップhuex10stprobeset)
473. hugene21stprobeset.db
Affymetrix hugene21 annotation data (chip hugene21stprobeset)
Affymetrix hugene21アノテーションデータ(チップhugene21stprobeset)
474. human610quadv1bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
475. HuO22.db
FHCRC Genomics Shared Resource HuO22 Annotation Data (HuO22)
FHCRCゲノミクス共有リソースHuO22アノテーションデータ(HuO22)
476. LAPOINTE.db
A package containing metadata for LAPOINTE arrays
LAPOINTE配列のメタデータを含むパッケージ
477. maizecdf
maizecdf
maizecdf
478. mgu74cv2cdf
mgu74cv2cdf
mgu74cv2cdf
479. mguatlas5k.db
Clontech BD Atlas Long Oligos Mouse 5K annotation data (chip mguatlas5k)
クロンテックBDアトラスロングオリゴマウス5K注釈データ(チップmguatlas5k)
480. mgug4104a.db
Agilent annotation data (chip mgug4104a)
アジレントのアノテーションデータ(チップmgug4104a)
481. MoExExonProbesetLocation
Probe sequence data for microarrays of type MoEx
MoExタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
482. mouse430a2probe
Probe sequence data for microarrays of type mouse430a2
タイプmouse430a2のマイクロアレイのプローブシーケンスデータ
483. mta10probeset.db
Affymetrix mta10 annotation data (chip mta10probeset)
Affymetrix mta10アノテーションデータ(チップmta10プローブセット)
484. mu11ksuba.db
Affymetrix Murine 11K Set annotation data (chip mu11ksuba)
Affymetrix Murine 11Kセットアノテーションデータ(チップmu11ksuba)
485. mu11ksubb.db
Affymetrix Murine 11K Set annotation data (chip mu11ksubb)
Affymetrix Murine 11Kセットアノテーションデータ(チップmu11ksubb)
486. Mu15v1.db
FHCRC Genomics Shared Resource Mu15v1 Annotation Data (Mu15v1)
FHCRCゲノミクス共有リソースMu15v1アノテーションデータ(Mu15v1)
487. mu19ksubc.db
Affymetrix Murine Genome 19k Set annotation data (chip mu19ksubc)
Affymetrix Murine Genome 19kアノテーションデータを設定(チップmu19ksubc)
488. Mu22v3.db
FHCRC Genomics Shared Resource Mu22v3 Annotation Data (Mu22v3)
FHCRC Genomics共有リソースMu22v3アノテーションデータ(Mu22v3)
489. mu6500subacdf
mu6500subacdf
mu6500subacdf
490. mu6500subccdf
mu6500subccdf
mu6500subccdf
491. Norway981.db
Norway981 http://genome-www5.stanford.edu/ Annotation Data (Norway981)
Norway981 http://genome-www5.stanford.edu/注釈データ(Norway981)
492. nugohs1a520180.db
Affymetrix nugohs1a520180 annotation data (chip nugohs1a520180)
Affymetrix nugohs1a520180アノテーションデータ(チップnugohs1a520180)
493. pd.ag
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name AG
メーカー名AGのプラットフォーム設計情報
494. pd.bsubtilis
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Bsubtilis
製造元名Bsubtilisのプラットフォーム設計情報
495. pd.ecoli.asv2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Ecoli_ASv2
メーカー名Ecoli_ASv2のプラットフォーム設計情報
496. pd.hc.g110
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HC_G110
製造元名HC_G110用プラットフォーム設計情報
497. pd.ht.mg.430a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HT_MG-430A
メーカー名HT_MG-430Aのプラットフォームデザイン情報
498. pd.medicago
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Medicago
メーカー名Medicagoのプラットフォーム設計情報
499. pd.mg.u74a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74A
製造元名MG_U74Aに関するプラットフォーム設計情報
500. pd.mg.u74av2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74Av2
メーカー名に対するプラットフォーム設計情報MG_U74Av2
501. pd.mg.u74cv2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74Cv2
メーカー名に対するプラットフォーム設計情報MG_U74Cv2
502. pd.mirna.2.0
Platform Design Info for Affymetrix miRNA-2_0
Affymetrix miRNA-2_0のプラットフォーム設計情報
503. pd.moe430b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MOE430B
メーカー名MOE430Bのプラットフォーム設計情報
504. pd.mogene.1.1.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix MoGene-1_1-st-v1
Affymetrix MoGene-1_1-st-v1のプラットフォーム設計情報
505. pd.nugo.mm1a520177
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name NuGO_Mm1a520177
メーカー名NuGO_Mm1a520177のプラットフォーム設計情報
506. pd.ovigene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix OviGene-1_1-st
Affymetrix OviGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
507. pd.porgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix PorGene-1_0-st
Affymetrix PorGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
508. pd.rae230b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RAE230B
メーカー名RAE230Bのプラットフォーム設計情報
509. pd.raex.1.0.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix RaEx-1_0-st-v1
Affymetrix RaEx-1_0-st-v1のプラットフォーム設計情報
510. pd.rta.1.0
Platform Design Info for Affymetrix RTA-1_0
Affymetrix RTA-1_0のプラットフォーム設計情報
511. pd.s.aureus
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name S_aureus
メーカー名S_aureusのプラットフォーム設計情報
512. pd.soybean
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Soybean
メーカー名大豆のプラットフォーム設計情報
513. pd.vitis.vinifera
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Vitis_Vinifera
製造元の名前のプラットフォーム設計情報Vitis_Vinifera
514. pd.xenopus.laevis
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Xenopus_laevis
メーカー名Xenopus_laevis用のプラットフォーム設計情報
515. pd.yg.s98
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name YG_S98
製造元の名前のプラットフォーム設計情報YG_S98
516. poplarprobe
Probe sequence data for microarrays of type poplar
ポプラ型マイクロアレイ用のプローブ配列データ
517. porcinecdf
porcinecdf
porcinecdf
518. rae230bcdf
rae230bcdf
rae230bcdf
519. rat2302frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type rat2302rnentrezg
rat2302rnentrezg型のマイクロアレイにfrmaが使用するベクトル
520. rhesusprobe
Probe sequence data for microarrays of type rhesus
アカゲザル型マイクロアレイ用のプローブ配列データ
521. rnu34cdf
rnu34cdf
rnu34cdf
522. rta10probeset.db
Affymetrix rta10 annotation data (chip rta10probeset)
Affymetrix rta10アノテーションデータ(チップrta10プローブセット)
523. saureusprobe
Probe sequence data for microarrays of type saureus
タイプsaureusのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
524. soybeancdf
soybeancdf
soybeancdf
525. TxDb.Ggallus.UCSC.galGal6.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
526. TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac8.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
527. wheatcdf
wheatcdf
wheatcdf
528. xlaevis.db
Affymetrix Xenopus laevis annotation data (chip xlaevis)
Affymetrix Xenopus laevisアノテーションデータ(チップxlaevis)
529. xtropicalisprobe
Probe sequence data for microarrays of type xtropicalis
xtropicalis型のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
530. AHCytoBands
CytoBands for AnnotationHub
AnnotationHub用のCytoBands
531. anopheles.db0
Base Level Annotation databases for anopheles
ハマダラカの基本レベル注釈データベース
532. bovinecdf
bovinecdf
bovinecdf
533. BSgenome.Alyrata.JGI.v1
Arabidopsis lyrata full genome (JGI version V1.0)
シロイヌナズナ全ゲノム(JGI version V1.0)
534. BSgenome.Carietinum.NCBI.v1
Cicer arietinum (Chickpea) full genome (NCBI version ASM33114v1)
Cicer arietinum(ヒヨコマメ)フルゲノム(NCBI版ASM33114v1)
535. BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked
Full masked genome sequences for Canis lupus familiaris (UCSC version canFam3)
Canis lupus familiaris(UCSCバージョンcanFam3)の完全マスクゲノム配列
536. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked
Full masked genome sequences for Drosophila melanogaster (UCSC version dm3)
キイロショウジョウバエ(UCSCバージョンdm3)の完全マスクゲノム配列
537. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5
Full genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer5)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer5)の全ゲノム配列
538. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6
Full genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer6)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer6)の全ゲノム配列
539. BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1
Full genome sequences for Gasterosteus aculeatus (UCSC version gasAcu1)
Gasterosteus aculeatus(UCSCバージョンgasAcu1)の全ゲノム配列
540. BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked
Full masked genome sequences for Gasterosteus aculeatus (UCSC version gasAcu1)
Gasterosteus aculeatus(UCSCバージョンgasAcu1)の完全マスクゲノム配列
541. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked
Full masked genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal3)
Gallus gallus(UCSCバージョンgalGal3)の完全マスクゲノム配列
542. BSgenome.Mdomestica.UCSC.monDom5
Full genome sequences for Monodelphis domestica (UCSC version monDom5)
Monodelphis domestica(UCSCバージョンmonDom5)の全ゲノム配列
543. BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac8
Full genome sequences for Macaca mulatta (UCSC version rheMac8)
Macaca mulatta(UCSCバージョンrheMac8)の全ゲノム配列
544. BSgenome.Ppaniscus.UCSC.panPan1
Full genome sequences for Pan paniscus (UCSC version panPan1)
Pan paniscus(UCSC版panPan1)の全ゲノム配列
545. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro6
Full genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro6)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro6)の全ゲノム配列
546. BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut2
Full genome sequences for Taeniopygia guttata (UCSC version taeGut2)
Taeniopygia guttata(UCSCバージョンtaeGut2)の全ゲノム配列
547. canine2cdf
canine2cdf
canine2cdf
548. caninecdf
caninecdf
caninecdf
549. citruscdf
citruscdf
citruscdf
550. ecoliK12.db0
Base Level Annotation databases for E coli K12 Strain
大腸菌K12株の塩基レベル注釈データベース
551. hcg110probe
Probe sequence data for microarrays of type hcg110
タイプhcg110のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
552. hgu219probe
Probe sequence data for microarrays of type hgu219
タイプhgu219のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
553. hgu95aprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95a
タイプhgu95aのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
554. hgu95bprobe
Probe sequence data for microarrays of type hgu95b
タイプhgu95bのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
555. hgu95dcdf
hgu95dcdf
hgu95dcdf
556. hgu95ecdf
hgu95ecdf
hgu95ecdf
557. hthgu133bcdf
hthgu133bcdf
hthgu133bcdf
558. hu35ksubaprobe
Probe sequence data for microarrays of type hu35ksuba
タイプhu35ksubaのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
559. hu35ksubccdf
hu35ksubccdf
hu35ksubccdf
560. hu35ksubdprobe
Probe sequence data for microarrays of type hu35ksubd
hu35ksubd型のマイクロアレイのプローブ配列データ
561. hu6800subacdf
hu6800subacdf
hu6800subacdf
562. JazaeriMetaData.db
A data package containing annotation data for JazaeriMetaData
JazaeriMetaDataの注釈データを含むデータパッケージ
563. lumiMouseIDMapping
Illumina Identifier mapping for Mouse
マウスのIllumina Identifierマッピング
564. MafDb.1Kgenomes.phase1.GRCh38
Minor allele frequency data from 1000 Genomes Phase 1 for GRCh38
GRCh38の1000ゲノムフェーズ1からのマイナーアレル頻度データ
565. MafDb.gnomADex.r2.1.GRCh38
Minor allele frequency data from gnomAD exomes release 2.1 for GRCh38
gnomADエキソームからのマイナー対立遺伝子頻度データはGRCh38のためにリリース2.1である
566. mgu74b.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74b)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74b)
567. mgu74bv2.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74bv2)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74bv2)
568. mgu74c.db
Affymetrix Murine Genome U74v2 annotation data (chip mgu74c)
Affymetrix Murine Genome U74v2アノテーションデータ(チップmgu74c)
569. moe430bprobe
Probe sequence data for microarrays of type moe430b
moe430bタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
570. mu19ksubb.db
Affymetrix Murine Genome 19k Set annotation data (chip mu19ksubb)
Affymetrix Murine Genome 19kアノテーションデータを設定(チップmu19ksubb)
571. nugomm1a520177.db
Affymetrix nugomm1a520177 annotation data (chip nugomm1a520177)
Affymetrix nugomm1a520177アノテーションデータ(チップnugomm1a520177)
572. pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter
Platform Design Info for NimbleGen 2006-10-31_rn34_refseq_promoter
NimbleGen 2006-10-31_rn34_refseq_promoterのプラットフォームデザイン情報
573. pd.barley1
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Barley1
メーカー名Barley1のプラットフォーム設計情報
574. pd.chigene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix ChiGene-1_1-st
Affymetrix ChiGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
575. pd.cotton
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Cotton
メーカー名コットンのプラットフォーム設計情報
576. pd.drosophila.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Drosophila_2
メーカー名Drosophila_2のプラットフォーム設計情報
577. pd.fingene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix FinGene-1_0-st
Affymetrix FinGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
578. pd.fingene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix FinGene-1_1-st
Affymetrix FinGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
579. pd.guigene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix GuiGene-1_1-st
Affymetrix GuiGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
580. pd.maize
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Maize
メーカー名トウモロコシのプラットフォーム設計情報
581. pd.mg.u74c
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name MG_U74C
メーカー名に対するプラットフォーム設計情報MG_U74C
582. pd.poplar
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Poplar
メーカー名ポプラのプラットフォーム設計情報
583. pd.sugar.cane
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Sugar_Cane
メーカー名Sugar_Caneのプラットフォーム設計情報
584. pd.x.tropicalis
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name X_tropicalis
メーカー名X_tropicalisのプラットフォーム設計情報
585. POCRCannotation.db
A package containing metadata for POCRC arrays
POCRC配列のメタデータを含むパッケージ
586. r10kcod.db
Codelink UniSet Rat I Bioarray (~10 000 rat gene targets) annotation data (chip r10kcod)
Codelink UniSet Rat Iバイオアレイ(〜10000ラット遺伝子ターゲット)アノテーションデータ(チップr10kcod)
587. ragene21stprobeset.db
Affymetrix ragene21 annotation data (chip ragene21stprobeset)
Affymetrix ragene21アノテーションデータ(チップragene21stprobeset)
588. rgu34ccdf
rgu34ccdf
rgu34ccdf
589. rgu34cprobe
Probe sequence data for microarrays of type rgu34c
タイプrgu34cのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
590. rgug4105a.db
Agilent annotation data (chip rgug4105a)
アジレントのアノテーションデータ(チップrgug4105a)
591. rhesuscdf
rhesuscdf
アカゲザル
592. rnu34probe
Probe sequence data for microarrays of type rnu34
タイプrnu34のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
593. Roberts2005Annotation.db
Roberts2005Annotation Annotation Data (Roberts2005Annotation)
Roberts2005Annotationアノテーションデータ(Roberts2005Annotation)
594. rta10transcriptcluster.db
Affymetrix rta10 annotation data (chip rta10transcriptcluster)
Affymetrix rta10アノテーションデータ(チップrta10transcriptcluster)
595. rtu34.db
Affymetrix Rat Toxicology U34 Array annotation data (chip rtu34)
Affymetrix Rat Toxicology U34アレイ注釈データ(チップrtu34)
596. SHDZ.db
SHDZ http://genome-www5.stanford.edu/ Annotation Data (SHDZ)
SHDZ http://genome-www5.stanford.edu/アノテーションデータ(SHDZ)
597. test3cdf
test3cdf
test3cdf
598. tomatocdf
tomatocdf
tomatocdf
599. TxDb.Btaurus.UCSC.bosTau8.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
600. TxDb.Sscrofa.UCSC.susScr3.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
601. wheatprobe
Probe sequence data for microarrays of type wheat
コムギタイプのマイクロアレイのためのプローブ配列データ
602. AHLRBaseDbs
LRBaseDbs for AnnotationHub
LRBaseDbs(アノテーションハブ用
603. barley1cdf
barley1cdf
barley1cdf
604. bovine.db0
Base Level Annotation databases for bovine
ウシ用基本レベル注釈データベース
605. BSgenome.Amellifera.BeeBase.assembly4
Full genome sequences for Apis mellifera (BeeBase assembly4)
Apis mellifera(BeeBase assembly4)の全ゲノム配列
606. BSgenome.Aofficinalis.NCBI.V1
Asparagus officinalis (Garden asparagus) full genome (NCBI version Aspof.V1)
アスパラガスオフィシナリス(Garden asparagus)フルゲノム(NCBI版Aspof.V1)
607. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4
Full genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau4)
Bos taurusの全ゲノム配列(UCSCバージョンbosTau4)
608. BSgenome.Creinhardtii.JGI.v5.6
Full genome sequences for Chlamydomonas reinhardtii (v5.6)
Chlamydomonas reinhardtii (v5.6)の全ゲノム配列
609. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked
Full masked genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer7)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer7)のフルマスクゲノム配列
610. BSgenome.Mfuro.UCSC.musFur1
Full genome sequences for Mustela putorius furo (UCSC version musFur1)
Mustela putorius furo(UCSCバージョンmusFur1)の全ゲノム配列
611. BSgenome.Ppaniscus.UCSC.panPan2
Full genome sequences for Pan paniscus (UCSC version panPan2)
Pan paniscus(UCSC版panPan2)の全ゲノム配列
612. BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1
Full masked genome sequences for Taeniopygia guttata (UCSC version taeGut1)
Taeniopygia guttata(UCSCバージョンtaeGut1)の全ゲノム配列
613. BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked
Full masked genome sequences for Taeniopygia guttata (UCSC version taeGut1)
Taeniopygia guttata(UCSCバージョンtaeGut1)の完全マスクゲノム配列
614. BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP12Xv2
Full reference nuclear genome sequences for Vitis vinifera subsp. vinifera PN40024 (IGGP version 12Xv2)
Vitis vinifera亜種の全参照核ゲノム配列。ビニフェラPN40024(IGGPバージョン12Xv2)
615. bsubtiliscdf
bsubtiliscdf
bsubtiliscdf
616. celegansprobe
Probe sequence data for microarrays of type celegans
セレガン型マイクロアレイのプローブ配列データ
617. cottonprobe
Probe sequence data for microarrays of type cotton
タイプ綿のマイクロアレイのためのプローブ配列データ
618. drosgenome1probe
Probe sequence data for microarrays of type drosgenome1
drosgenome1型マイクロアレイのプローブ配列データ
619. ecoliasv2cdf
ecoliasv2cdf
ecoliasv2cdf
620. ecoliasv2probe
Probe sequence data for microarrays of type ecoliasv2
タイプecoliasv2のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
621. FDb.UCSC.snp137common.hg19
UCSC common SNPs track for dbSNP build 137
UCSC共通SNPがdbSNPビルド137を追跡
622. gp53cdf
gp53cdf
gp53cdf
623. h10kcod.db
Codelink UniSet Human I Bioarray (~10 000 human genes) annotation data (chip h10kcod)
Codelink UniSet Human Iバイオアレイ(〜10,000遺伝子)アノテーションデータ(チップh10kcod)
624. hcg110cdf
hcg110cdf
hcg110cdf
625. hguatlas13k.db
Clontech BD Atlas Long Oligos Human 13K annotation data (chip hguatlas13k)
Clontech BD Atlas Long Oligos Human 13Kアノテーションデータ(チップhguatlas13k)
626. hivprtplus2cdf
hivprtplus2cdf
hivprtplus2cdf
627. htmg430bcdf
htmg430bcdf
htmg430bcdf
628. htrat230pmcdf
htrat230pmcdf
htrat230pmcdf
629. hu6800subccdf
hu6800subccdf
hu6800subccdf
630. m20kcod.db
Codelink UniSet Mouse 20k I Bioarray annotation data (chip m20kcod)
Codelink UniSet Mouse 20k Iバイオアレイアノテーションデータ(チップm20kcod)
631. MafDb.TOPMed.freeze5.hg38
Minor allele frequency data from TOPMed for hg38
hg38のTOPMedからのマイナーアレル頻度データ
632. mgu74bv2cdf
mgu74bv2cdf
mgu74bv2cdf
633. mgu74cprobe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74c
タイプmgu74cのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
634. mgu74cv2probe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74cv2
タイプmgu74cv2のマイクロアレイのプローブ配列データ
635. mgug4120a.db
Agilent annotation data (chip mgug4120a)
アジレントのアノテーションデータ(チップmgug4120a)
636. mgug4121a.db
Agilent Mouse annotation data (chip mgug4121a)
Agilentマウスアノテーションデータ(チップmgug4121a)
637. mirna10probe
Probe sequence data for microarrays of type mirna10
タイプmirna10のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
638. moex10stprobeset.db
Affymetrix moex10 annotation data (chip moex10stprobeset)
Affymetrix moex10アノテーションデータ(チップmoex10stprobeset)
639. mogene11stprobeset.db
Affymetrix mogene11 annotation data (chip mogene11stprobeset)
Affymetrix mogene 11アノテーションデータ(チップmogene 11 stprobeset)
640. mogene11sttranscriptcluster.db
Affymetrix mogene11 annotation data (chip mogene11sttranscriptcluster)
Affymetrix mogene 11アノテーションデータ(チップmogene 11 sttranscriptcluster)
641. mouse430a2frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type mouse430a2
タイプmouse430a2のマイクロアレイにfrmaが使用するベクトル
642. mpedbarray.db
FHCRC Nelson Lab mpedbarray Annotation Data (mpedbarray)
FHCRC Nelson Labのmpedbarrayアノテーションデータ(mpedbarray)
643. mu19ksubbcdf
mu19ksubbcdf
mu19ksubbcdf
644. mu19ksubccdf
mu19ksubccdf
mu19ksubccdf
645. mu6500subbcdf
mu6500subbcdf
mu6500subbcdf
646. nugohs1a520180probe
Probe sequence data for microarrays of type nugohs1a520180
nugohs1a520180型のマイクロアレイのプローブ配列データ
647. pd.aragene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix AraGene-1_0-st
Affymetrix AraGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
648. pd.canine.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Canine_2
メーカー名Canine_2用のプラットフォーム設計情報
649. pd.chicken
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Chicken
メーカー名Chickenのプラットフォーム設計情報
650. pd.chigene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix ChiGene-1_0-st
Affymetrix ChiGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
651. pd.chogene.2.1.st
Platform Design Info for Affymetrix CHOGene-2_1-st
Affymetrix CHOGene-2_1-stのプラットフォーム設計情報
652. pd.citrus
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Citrus
製造元の名称Citrusに関するプラットフォーム設計情報
653. pd.cytogenetics.array
Platform Design Info for Affymetrix Cytogenetics_Array
Affymetrix Cytogenetics_Arrayのプラットフォーム設計情報
654. pd.hg.u95b
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95B
メーカー名HG_U95Bのプラットフォーム設計情報
655. pd.hg.u95c
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95C
製造元の名称HG_U95C用プラットフォームデザイン情報
656. pd.hg.u95d
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95D
製造元名HG_U95Dのプラットフォーム設計情報
657. pd.hg.u95e
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name HG_U95E
製造元名HG_U95E用プラットフォームデザイン情報
658. pd.mu11ksuba
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Mu11KsubA
メーカー名Mu11KsubAのプラットフォームデザイン情報
659. pd.porgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix PorGene-1_1-st
Affymetrix PorGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
660. pd.rabgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RabGene-1_1-st
Affymetrix RabGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
661. pd.ragene.1.0.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix RaGene-1_0-st-v1
Affymetrix RaGene-1_0-st-v1のプラットフォーム設計情報
662. pd.ragene.2.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RaGene-2_1-st
Affymetrix RaGene-2_1-stのプラットフォーム設計情報
663. pd.rg.u34a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RG_U34A
メーカー名RG_U34A用プラットフォームデザイン情報
664. pd.rn.u34
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RN_U34
製造元の名前のプラットフォーム設計情報RN_U34
665. pd.tomato
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Tomato
メーカー名Tomatoのプラットフォーム設計情報
666. pd.x.laevis.2
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name X_laevis_2
メーカー名X_laevis_2のプラットフォーム設計情報
667. pd.zebrafish
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Zebrafish
メーカー名Zebrafish用のプラットフォーム設計情報
668. rae230bprobe
Probe sequence data for microarrays of type rae230b
タイプrae230bのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
669. ragene11stprobeset.db
Affymetrix ragene11 annotation data (chip ragene11stprobeset)
Affymetrix ragene11アノテーションデータ(チップragene11stprobeset)
670. rgu34bcdf
rgu34bcdf
rgu34bcdf
671. rgu34bprobe
Probe sequence data for microarrays of type rgu34b
タイプrgu34bのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
672. rtu34cdf
rtu34cdf
rtu34cdf
673. rtu34probe
Probe sequence data for microarrays of type rtu34
rtu34タイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
674. saureuscdf
saureuscdf
saureuscdf
675. sugarcaneprobe
Probe sequence data for microarrays of type sugarcane
サトウキビタイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
676. TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart25
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
677. TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro5.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
678. u133x3pprobe
Probe sequence data for microarrays of type u133x3p
タイプu133x3pのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
679. xlaevis2cdf
xlaevis2cdf
xlaevis2cdf
680. ye6100subdcdf
ye6100subdcdf
ye6100subdcdf
681. zebrafishprobe
Probe sequence data for microarrays of type zebrafish
ゼブラフィッシュ型マイクロアレイのプローブ配列データ
682. bovineprobe
Probe sequence data for microarrays of type bovine
ウシ型マイクロアレイのプローブ配列データ
683. BSgenome.Amellifera.NCBI.AmelHAv3.1
Full genome sequences for Apis mellifera (Amel_HAv3.1)
Apis mellifera (Amel_HAv3.1)の全ゲノム配列
684. BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6.masked
Full masked genome sequences for Danio rerio (UCSC version danRer6)
Danio rerio(UCSCバージョンdanRer6)の完全マスクゲノム配列
685. BSgenome.Dvirilis.Ensembl.dvircaf1
Full genome sequences for Drosophila virilis (assembly dvir_caf1)
ショウジョウバエ ビリリス(集合体 dvir_caf1)の全ゲノム配列
686. BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked
Full masked genome sequences for Gallus gallus (UCSC version galGal4)
Gallus gallus(UCSCバージョンgalGal4)の完全マスクゲノム配列
687. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2
Full genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro2)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro2)の全ゲノム配列
688. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2.masked
Full masked genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro2)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro2)のための完全マスクゲノム配列
689. chickencdf
chickencdf
chickencdf
690. chimp.db0
Base Level Annotation databases for chimp
チンパンジー用ベースレベルアノテーションデータベース
691. ecoliprobe
Probe sequence data for microarrays of type ecoli
タイプecoliのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
692. EnsDb.Rnorvegicus.v75
Ensembl based annotation package
Ensemblベースのアノテーションパッケージ
693. EpiTxDb.Sc.sacCer3
Annotation package for EpiTxDb objects
EpiTxDb オブジェクトのアノテーションパッケージ
694. FDb.UCSC.snp135common.hg19
UCSC common SNPs track for dbSNP build 135
UCSC共通SNPがdbSNPビルド135を追跡
695. fly.db0
Base Level Annotation databases for fly
fly用のBase Level Annotationデータベース
696. geneplast.data
Input data for the geneplast package via AnnotationHub
アノテーションハブを介したgeneplastパッケージの入力データ
697. gwascatData
A text file in cloud with March 30 2021 snapshot of EBI/EMBL GWAS catalog
EBI/EMBL GWASカタログの2021年3月30日のスナップショットをクラウド上のテキストファイルにしたもの
698. hapmap370k
Example Illumina 370k HapMap Data
Illumina 370k HapMapデータの例
699. hgu95bcdf
hgu95bcdf
hgu95bcdf
700. hgu95ccdf
hgu95ccdf
hgu95ccdf
701. hguDKFZ31.db
Unknown annotation data (chip hguDKFZ31)
未知の注釈データ(チップhguDKFZ31)
702. hpAnnot
Anotation package for Hipathia package
Hipathiaパッケージのアノテーションパッケージ
703. Hspec
Hspec
Hspec
704. htmg430aprobe
Probe sequence data for microarrays of type htmg430a
タイプhtmg430aのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
705. htmg430pm.db
Affymetrix Affymetrix HT_MG-430_PM Array annotation data (chip htmg430pm)
Affymetrix アフィメトリックス HT_MG-430_PMアレイのアノテーションデータ(チップ htmg430pm)
706. htrat230pmprobe
Probe sequence data for microarrays of type htrat230pm
タイプhtrat230pmのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
707. htratfocusprobe
Probe sequence data for microarrays of type htratfocus
タイプhtratfocusのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
708. hu35ksubacdf
hu35ksubacdf
hu35ksubacdf
709. huex.1.0.st.v2frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type huex.1.0.st.v2
frmaがhuex.1.0.st.v2型のマイクロアレイに使用するベクトル
710. indac.db
INDAC FlyChip_long_oligonucleotide_002 (FL002) annotation data (chip indac)
INDAC FlyChip_long_oligonucleotide_002(FL002)アノテーションデータ(チップインダック)
711. lumiRatAll.db
Illumina Rat Illumina expression annotation data (chip lumiRatAll)
Illumina Rat Illumina表現アノテーションデータ(チップlumiRatAll)
712. lumiRatIDMapping
Illumina Identifier mapping for Rat
ラットのイルミナ識別子マッピング
713. MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.GRCh38
Minor allele frequency data from ExAC release 1.0 subset of nonTCGA exomes for GRCh38
GRCh38に対するExACリリース1.0サブセットの非TCGAエキソームのマイナーアレル頻度データ
714. medicagocdf
medicagocdf
medicagocdf
715. medicagoprobe
Probe sequence data for microarrays of type medicago
タイプmedicagoのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
716. mgu74bcdf
mgu74bcdf
mgu74bcdf
717. mgu74bprobe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74b
タイプmgu74bのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
718. mgu74bv2probe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74bv2
タイプmgu74bv2のマイクロアレイのプローブ配列データ
719. mi16cod.db
Codelink Mouse Inflammation 16 Bioarray annotation data (chip mi16cod)
Codelink Mouse Inflammation 16バイオアレイアノテーションデータ(チップmi16cod)
720. mirna102xgaincdf
mirna102xgaincdf
mirna102xgaincdf
721. mu11ksubaprobe
Probe sequence data for microarrays of type mu11ksuba
mu11ksubaタイプのマイクロアレイのプローブシーケンスデータ
722. mu11ksubbprobe
Probe sequence data for microarrays of type mu11ksubb
mu11ksubbタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
723. mu19ksubacdf
mu19ksubacdf
mu19ksubacdf
724. nugohs1a520180cdf
nugohs1a520180cdf
nugohs1a520180cdf
725. nugomm1a520177cdf
nugomm1a520177cdf
nugomm1a520177cdf
726. OperonHumanV3.db
FHCRC Nelson Lab OperonHumanV3 Annotation Data (OperonHumanV3)
FHCRC Nelson Lab OperonHumanV3アノテーションデータ(OperonHumanV3)
727. Orthology.eg.db
Orthology mapping package
オルソロジー・マッピング・パッケージ
728. pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter
Platform Design Info for NimbleGen 2006-07-18_mm8_refseq_promoter
NimbleGen 2006-07-18_mm8_refseq_promoterのプラットフォームデザイン情報
729. pd.aragene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix AraGene-1_1-st
Affymetrix AraGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
730. pd.bovgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix BovGene-1_0-st
Affymetrix BovGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
731. pd.bovgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix BovGene-1_1-st
Affymetrix BovGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
732. pd.cangene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix CanGene-1_1-st
Affymetrix CanGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
733. pd.celegans
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Celegans
メーカー名Celegansのプラットフォーム設計情報
734. pd.cyngene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix CynGene-1_0-st
Affymetrix CynGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
735. pd.cyrgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix CyRGene-1_0-st
Affymetrix CyRGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
736. pd.drogene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix DroGene-1_1-st
Affymetrix DroGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
737. pd.ecoli
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Ecoli
メーカー名Ecoliのプラットフォーム設計情報
738. pd.elegene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix EleGene-1_0-st
Affymetrix EleGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
739. pd.equgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix EquGene-1_0-st
Affymetrix EquGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
740. pd.feinberg.hg18.me.hx1
Platform Design Info for NimbleGen feinberg_hg18_me_hx1
NimbleGen feinberg_hg18_me_hx1のプラットフォーム設計情報
741. pd.feinberg.mm8.me.hx1
Platform Design Info for NimbleGen feinberg_mm8_me_hx1
NimbleGen feinberg_mm8_me_hx1のプラットフォーム設計情報
742. pd.felgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix FelGene-1_1-st
Affymetrix FelGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
743. pd.margene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix MarGene-1_1-st
Affymetrix MarGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
744. pd.medgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix MedGene-1_0-st
Affymetrix MedGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
745. pd.nugo.hs1a520180
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name NuGO_Hs1a520180
メーカー名NuGO_Hs1a520180のプラットフォーム設計情報
746. pd.ovigene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix OviGene-1_0-st
Affymetrix OviGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
747. pd.pae.g1a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Pae_G1a
メーカー名Pae_G1aのプラットフォーム設計情報
748. pd.plasmodium.anopheles
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Plasmodium_Anopheles
メーカー名Plasmodium_Anophelesのプラットフォーム設計情報
749. pd.rabgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RabGene-1_0-st
Affymetrix RabGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
750. pd.rae230a
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RAE230A
メーカー名RAE230Aのプラットフォーム設計情報
751. pd.ragene.1.1.st.v1
Platform Design Info for Affymetrix RaGene-1_1-st-v1
Affymetrix RaGene-1_1-st-v1のプラットフォーム設計情報
752. pd.rcngene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RCnGene-1_0-st
Affymetrix RCnGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
753. pd.rg.u34c
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name RG_U34C
メーカー名RG_U34Cのプラットフォーム設計情報
754. pd.rjpgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RJpGene-1_0-st
Affymetrix RJpGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
755. pd.rusgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RUSGene-1_0-st
Affymetrix RUSGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
756. pd.rusgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RUSGene-1_1-st
Affymetrix RUSGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
757. pd.soygene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix SoyGene-1_1-st
Affymetrix SoyGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
758. pd.zebgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix ZebGene-1_0-st
Affymetrix ZebGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
759. pig.db0
Base Level Annotation databases for pig
ブタのためのベースレベルアノテーションデータベース
760. ragene10stprobeset.db
Affymetrix ragene10 annotation data (chip ragene10stprobeset)
Affymetrix ragene10アノテーションデータ(チップragene10stprobeset)
761. ragene10stv1cdf
ragene10stv1cdf
ragene10stv1cdf
762. ragene10stv1probe
Probe sequence data for microarrays of type ragene10stv1
タイプragene10stv1のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
763. ragene20stprobeset.db
Affymetrix ragene20 annotation data (chip ragene20stprobeset)
Affymetrix ragene20アノテーションデータ(チップragene20stprobeset)
764. rattoxfxcdf
rattoxfxcdf
rattoxfxcdf
765. rgug4130a.db
Agilent Rat annotation data (chip rgug4130a)
Agilentラットアノテーションデータ(チップrgug4130a)
766. RmiR.hsa
Various databases of microRNA Targets
マイクロRNAターゲットの様々なデータベース
767. rwgcod.db
Codelink Rat Whole Genome Bioarray (~34 000 rat gene targets) annotation data (chip rwgcod)
Codelink Rat Whole Genomeバイオアレイ(〜34 000ラット遺伝子ターゲット)アノテーションデータ(チップrwgcod)
768. sugarcanecdf
sugarcanecdf
サトウキビ
769. test1cdf
test1cdf
test1cdf
770. test2cdf
test2cdf
test2cdf
771. test3probe
Probe sequence data for microarrays of type test3
タイプtest3のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
772. TxDb.Hsapiens.BioMart.igis
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
773. vitisviniferacdf
vitisviniferacdf
vitisviniferacdf
774. vitisviniferaprobe
Probe sequence data for microarrays of type vitisvinifera
vitisvinifera型のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
775. xenopus.db0
Base Level Annotation databases for xenopus
アフリカツメガエルのためのベースレベルアノテーションデータベース
776. xlaevis2probe
Probe sequence data for microarrays of type xlaevis2
xlaevis2型のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
777. ye6100subacdf
ye6100subacdf
ye6100subacdf
778. ye6100subbcdf
ye6100subbcdf
ye6100subbcdf
779. ye6100subccdf
ye6100subccdf
ye6100subccdf
780. ygs98probe
Probe sequence data for microarrays of type ygs98
タイプygs98のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
781. AHWikipathwaysDbs
Metabolites linked to WikiPathways pathways (for AnnotationHub)
WikiPathwaysのパスウェイにリンクされた代謝物(AnnotationHub用
782. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.minor
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg38, based on GRCh38.p12) with injected minor alleles (dbSNP151)
Homo sapiens (UCSC version hg38, based on GRCh38.p12) の完全なゲノム配列と注入されたマイナーアレル (dbSNP151)
783. BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked
Full masked genome sequences for Pan troglodytes (UCSC version panTro3)
Pan troglodytes(UCSCバージョンpanTro3)の完全マスクゲノム配列
784. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked
Full masked genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC version rn4)
Rattus norvegicus(UCSCバージョンrn4)のフルマスクゲノム配列
785. BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP12Xv0
Full reference nuclear genome sequences for Vitis vinifera subsp. vinifera PN40024 (IGGP version 12Xv0)
Vitis vinifera亜種の全参照核ゲノム配列。ビニフェラPN40024(IGGPバージョン12Xv0)
786. BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP8X
Full reference nuclear genome sequences for Vitis vinifera subsp. vinifera PN40024 (IGGP version 8X)
Vitis vinifera亜種の全参照核ゲノム配列。ビニフェラPN40024(IGGPバージョン8X)
787. canine.db0
Base Level Annotation databases for canine
犬用基本レベル注釈データベース
788. chicken.db0
Base Level Annotation databases for chicken
ニワトリの基本レベル注釈データベース
789. ecoliSakai.db0
Base Level Annotation databases for E coli Sakai Strain
大腸菌酒井株の塩基レベル注釈データベース
790. hspeccdf
hspeccdf
hspeccdf
791. htmg430pmprobe
Probe sequence data for microarrays of type htmg430pm
タイプhtmg430pmのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
792. hu35ksubbprobe
Probe sequence data for microarrays of type hu35ksubb
hu35ksubbタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
793. hu6800subdcdf
hu6800subdcdf
hu6800subdcdf
794. HuExExonProbesetLocation
Probe sequence data for microarrays of type HuEx
HuExタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
795. human1mduov3bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
796. humanomni25quadv1bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
797. humanomni5quadv1bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
798. m10kcod.db
Codelink UniSet Mouse I Bioarray (~10 000 mouse gene targets) annotation data (chip m10kcod)
Codelink UniSet Mouse Iバイオアレイ(〜10000個のマウス遺伝子ターゲット)アノテーションデータ(チップm10kcod)
799. MafDb.ExAC.r1.0.GRCh38
Minor allele frequency data from ExAC release 1.0 for GRCh38
GRCh38のExACリリース1.0からのマイナーアレル頻度データ
800. MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.hs37d5
Minor allele frequency data from ExAC release 1.0 subset of nonTCGA exomes for hs37d5
Exsリリース1.0サブセットのhs37d5のnonTCGAエキソームのマイナーアレル頻度データ
801. MafH5.gnomAD.v3.1.1.GRCh38
Minor allele frequency data from gnomAD version 3.1.1 for GRCh38
gnomAD version 3.1.1によるGRCh38のマイナーアレル頻度データ
802. maizeprobe
Probe sequence data for microarrays of type maize
トウモロコシタイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
803. mgu74acdf
mgu74acdf
mgu74acdf
804. mgu74av2probe
Probe sequence data for microarrays of type mgu74av2
タイプmgu74av2のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
805. moe430bcdf
moe430bcdf
moe430bcdf
806. mogene10stv1probe
Probe sequence data for microarrays of type mogene10stv1
mogene10stv1型のマイクロアレイのプローブ配列データ
807. mouseCHRLOC
A data package containing annotation data for mouseCHRLOC
mouseCHRLOCの注釈データを含むデータパッケージ
808. nugomm1a520177probe
Probe sequence data for microarrays of type nugomm1a520177
nugomm1a520177タイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
809. paeg1aprobe
Probe sequence data for microarrays of type paeg1a
タイプpaeg1aのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
810. pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1
Platform Design Info for NimbleGen 081229_hg18_promoter_medip_hx1
NimbleGen 081229_hg18_promoter_medip_hx1のプラットフォームデザイン情報
811. pd.cangene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix CanGene-1_0-st
Affymetrix CanGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
812. pd.canine
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name Canine
製造元の名前犬用のプラットフォーム設計情報
813. pd.chogene.2.0.st
Platform Design Info for Affymetrix CHOGene-2_0-st
Affymetrix CHOGene-2_0-stのプラットフォーム設計情報
814. pd.cyngene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix CynGene-1_1-st
Affymetrix CynGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
815. pd.cyrgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix CyRGene-1_1-st
Affymetrix CyRGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
816. pd.drogene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix DroGene-1_0-st
Affymetrix DroGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
817. pd.drosgenome1
Platform Design Info for The Manufacturer’s Name DrosGenome1
メーカー名DrosGenome1のプラットフォーム設計情報
818. pd.elegene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix EleGene-1_1-st
Affymetrix EleGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
819. pd.felgene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix FelGene-1_0-st
Affymetrix FelGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
820. pd.guigene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix GuiGene-1_0-st
Affymetrix GuiGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
821. pd.margene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix MarGene-1_0-st
Affymetrix MarGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
822. pd.medgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix MedGene-1_1-st
Affymetrix MedGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
823. pd.rhegene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix RheGene-1_0-st
Affymetrix RheGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
824. pd.rhegene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RheGene-1_1-st
Affymetrix RheGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
825. pd.rjpgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RJpGene-1_1-st
Affymetrix RJpGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
826. pd.soygene.1.0.st
Platform Design Info for Affymetrix SoyGene-1_0-st
Affymetrix SoyGene-1_0-stのプラットフォーム設計情報
827. phastCons30way.UCSC.hg38
phastCons30way.UCSC.hg38 AnnotationHub Resource Metadata
phastCons30way.UCSC.hg38 AnnotationHub リソースメタデータ
828. plasmodiumanophelesprobe
Probe sequence data for microarrays of type plasmodiumanopheles
型プラスモディウムアノフェルのマイクロアレイのためのプローブ配列データ
829. raex10stprobeset.db
Affymetrix raex10 annotation data (chip raex10stprobeset)
Affymetrix raex10アノテーションデータ(チップraex10stprobeset)
830. ragene11sttranscriptcluster.db
Affymetrix ragene11 annotation data (chip ragene11sttranscriptcluster)
Affymetrix ragene11アノテーションデータ(チップragene11sttranscriptcluster)
831. ragene21sttranscriptcluster.db
Affymetrix ragene21 annotation data (chip ragene21sttranscriptcluster)
Affymetrix ragene21アノテーションデータ(チップragene21sttranscriptcluster)
832. ratCHRLOC
A data package containing annotation data for ratCHRLOC
ratCHRLOCのアノテーションデータを含むデータパッケージ
833. rhesus.db0
Base Level Annotation databases for rhesus
アカゲザルのための基本レベル注釈データベース
834. TxDb.Ggallus.UCSC.galGal4.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
835. TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac3.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
836. TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro4.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
837. TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.sgdGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
838. worm.db0
Base Level Annotation databases for worm
ワームのためのベースレベルアノテーションデータベース
839. xenopuslaevisprobe
Probe sequence data for microarrays of type xenopuslaevis
xenopuslaevis型のマイクロアレイ用のプローブ配列データ
840. XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38
Extra SNP locations for Homo sapiens (dbSNP Build 141)
ホモサピエンスのための追加のSNPの場所(dbSNP Build 141)
841. yeast.db0
Base Level Annotation databases for yeast
酵母の基底レベルアノテーションデータベース
842. chickenprobe
Probe sequence data for microarrays of type chicken
ニワトリタイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
843. citrusprobe
Probe sequence data for microarrays of type citrus
柑橘類タイプのマイクロアレイ用のプローブ配列データ
844. cottoncdf
cottoncdf
cottoncdf
845. cyp450cdf
cyp450cdf
cyp450cdf
846. hthgu133pluspm.db
Affymetrix Affymetrix HT_HG-U133_Plus_PM Array annotation data (chip hthgu133pluspm)
Affymetrix アフィメトリックス HT_HG-U133_Plus_PM アレイのアノテーションデータ (チップ hthgu133pluspm)
847. htmg430acdf
htmg430acdf
htmg430acdf
848. hu6800subbcdf
hu6800subbcdf
hu6800subbcdf
849. HuExExonProbesetLocationHg18
Exon-level probeset chromosome location for microarrays of type HuEx
HuEx型マイクロアレイのためのエクソンレベルプローブセット染色体位置
850. HuExExonProbesetLocationHg19
Exon-level probeset chromosome location for microarrays of type HuEx
HuEx型マイクロアレイのためのエクソンレベルプローブセット染色体位置
851. malaria.db0
Base Level Annotation databases for malaria
マラリアのためのベースレベルアノテーションデータベース
852. mgu74ccdf
mgu74ccdf
mgu74ccdf
853. mu11ksubacdf
mu11ksubacdf
mu11ksubacdf
854. mu11ksubbcdf
mu11ksubbcdf
mu11ksubbcdf
855. paeg1acdf
paeg1acdf
paeg1acdf
856. PartheenMetaData.db
PartheenMetaData http://swegene.onk.lu.se Annotation Data (PartheenMetaData)
PartheenMetaData http://swegene.onk.lu.seアノテーションデータ(PartheenMetaData)
857. pd.equgene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix EquGene-1_1-st
Affymetrix EquGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
858. pd.rcngene.1.1.st
Platform Design Info for Affymetrix RCnGene-1_1-st
Affymetrix RCnGene-1_1-stのプラットフォーム設計情報
859. poplarcdf
poplarcdf
poplarcdf
860. raex10sttranscriptcluster.db
Affymetrix raex10 annotation data (chip raex10sttranscriptcluster)
Affymetrix raex10アノテーションデータ(チップraex10sttranscriptcluster)
861. RaExExonProbesetLocation
Probe sequence data for microarrays of type RaEx
RaExタイプのマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
862. rat.db0
Base Level Annotation databases for rat
ラットの基礎レベル注釈データベース
863. rattoxfxprobe
Probe sequence data for microarrays of type rattoxfx
rattoxfxタイプのマイクロアレイのプローブ配列データ
864. rGenomeTracksData
Demonstration Data from rGenomeTracks Package
rGenomeTracksパッケージのデモデータ
865. rguatlas4k.db
Clontech BD Atlas Long Oligos Rat 4K annotation data (chip rguatlas4k)
クロンテックBDアトラスロングオリゴラット4K注釈データ(チップrguatlas4k)
866. TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro6.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
867. TxDb.Rnorvegicus.BioMart.igis
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクト用の注釈パッケージ
868. TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.ncbiRefSeq
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトのアノテーションパッケージ
869. xtropicaliscdf
xtropicaliscdf
xtropicaliscdf
870. zebrafish.db0
Base Level Annotation databases for zebrafish
ゼブラフィッシュのためのベースレベルアノテーションデータベース
871. human550v3bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
872. human650v3aCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
873. humancytosnp12v2p1hCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
874. BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major
Full genome sequences for Homo sapiens (UCSC version hg38, based on GRCh38.p12) with injected major alleles (dbSNP151)
Homo sapiens (UCSC version hg38, based on GRCh38.p12) の完全なゲノム配列と注入された主要対立遺伝子 (dbSNP151)
875. hthgu133plusa.db
Affymetrix Affymetrix HT_HG-U133_Plus_A Array annotation data (chip hthgu133plusa)
Affymetrix アフィメトリックス HT_HG-U133_Plus_A アレイのアノテーションデータ (チップ hthgu133plusa)
876. htmg430a.db
Affymetrix Affymetrix HT_MG-430A Array annotation data (chip htmg430a)
Affymetrix アフィメトリックス HT_MG-430Aアレイのアノテーションデータ(チップ htmg430a
877. htmg430b.db
Affymetrix Affymetrix HT_MG-430B Array annotation data (chip htmg430b)
Affymetrix アフィメトリックス HT_MG-430Bアレイのアノテーションデータ(チップ htmg430b)
878. htratfocus.db
Affymetrix Affymetrix HT_Rat-Focus Array annotation data (chip htratfocus)
Affymetrix Affymetrix HT_Rat-Focusアレイのアノテーションデータ(チップ htratfocus)
879. human1mv1cCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
880. human370quadv3cCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
881. human660quadv1aCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
882. humanomni1quadv1bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
883. TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart51
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
884. xenopuslaeviscdf
xenopuslaeviscdf
xenopuslaeviscdf
885. ygs98frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type ygs98
タイプygs98のマイクロアレイにfrmaが使用するベクトル
886. CTCF
Genomic coordinates of CTCF binding sites, with orientation
CTCF結合部位のゲノム座標とその方向性
887. excluderanges
Genomic coordinates of problematic genomic regions
問題のあるゲノム領域のゲノム座標
888. hthgu133plusb.db
Affymetrix Affymetrix HT_HG-U133_Plus_B Array annotation data (chip hthgu133plusb)
Affymetrix アフィメトリックス HT_HG-U133_Plus_B アレイのアノテーションデータ (チップ hthgu133plusb)
889. htrat230pm.db
Affymetrix Affymetrix HT_Rat230_PM Array annotation data (chip htrat230pm)
Affymetrix アフィメトリックス HT_Rat230_PMアレイのアノテーションデータ(チップ htrat230pm
890. humanomniexpress12v1bCrlmm
Metadata for fast genotyping with the ‘crlmm’ package
‘crlmm’パッケージを使った高速ジェノタイピングのためのメタデータ
891. mogene.1.0.st.v1frmavecs
Vectors used by frma for microarrays of type mogene.1.0.st.v1frmavecs
タイプmogene.1.0.st.v1frmavecsのマイクロアレイにfrmaが使用するベクトル
892. BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn7
Full genome sequences for Rattus norvegicus (UCSC genome rn7)
Rattus norvegicus (UCSC genome rn7) の全ゲノム配列
893. GeneSummary
RefSeq Gene Summaries
RefSeq遺伝子要約
894. scAnnotatR.models
Pretrained models for scAnnotatR package
scAnnotatRパッケージ用の事前学習済みモデル
895. synaptome.data
AnnotationData for Synaptome.DB package
Synaptome.DBパッケージのAnnotationData
896. synaptome.db
Synamptosome Proteome Database
Synamptosomeプロテオームデータベース
897. TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn7.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
898. ontoProcData
A data package for ontoProc
ontoProc用データパッケージ
899. TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam4.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
900. TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam5.refGene
Annotation package for TxDb object(s)
TxDbオブジェクトの注釈パッケージ
901. BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked
Full masked genome sequences for Bos taurus (UCSC version bosTau9)
Bos taurusのフルマスクドゲノム配列(UCSC版bosTau9)
902. BSgenome.Mfascicularis.NCBI.6.0
Full genome sequences for Macaca fascicularis (Macaca_fascicularis_6.0)
マカカ・ファシキュラリスの全ゲノム配列 (Macaca_fascicularis_6.0)
903. JASPAR2022
Data package for JASPAR database (version 2022)
JASPARデータベース(バージョン2022)用データパッケージ
904. UCSCRepeatMasker
UCSC RepeatMasker AnnotationHub resource metadata
UCSC RepeatMasker AnnotationHub リソースメタデータ
905. BSgenome.Cjacchus.UCSC.calJac4
Full genome sequences for Callithrix jacchus (UCSC version calJac4)
Callithrix jacchusの全ゲノム配列 (UCSC版calJac4)
906. BSgenome.CneoformansVarGrubiiKN99.NCBI.ASM221672v1
Full Genome Sequence for Cryptococcus neoformans var. grubii KN99 (ASM221672v1)
Cryptococcus neoformans var. grubii KN99 (ASM221672v1)の全ゲノム塩基配列
907. BSgenome.Hsapiens.NCBI.T2T.CHM13v2.0
T2T-CHM13v2.0 assembly (Homo sapiens) wrapped in a BSgenome object
T2T-CHM13v2.0 アセンブリ(Homo sapiens)をBSgenomeオブジェクトでラッピングしたもの。
908. MafH5.gnomAD.v3.1.2.GRCh38
Minor allele frequency data from gnomAD version 3.1.2 for GRCh38
gnomAD version 3.1.2 for GRCh38から得られたマイナーアレル頻度データ
1. ALL
A data package
データパッケージ
2. HSMMSingleCell
Single-cell RNA-Seq for differentiating human skeletal muscle myoblasts (HSMM)
ヒト骨格筋筋芽細胞(HSMM)を区別するための単一細胞RNA-Seq
3. TCGAbiolinksGUI.data
Data for the TCGAbiolinksGUI package
TCGAbiolinksGUIパッケージのデータ
4. airway
RangedSummarizedExperiment for RNA-Seq in airway smooth muscle cells, by Himes et al PLoS One 2014
気道平滑筋細胞におけるRNA-SeqのRangedSummarizedExperiment、Himes et alによるPLoS One 2014
5. geneLenDataBase
Lengths of mRNA transcripts for a number of genomes
いくつかのゲノムのmRNA転写産物の長さ
6. celldex
Reference Index for Cell Types
セルタイプの参照インデックス
7. scRNAseq
A Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
公共のシングルセルRNAシーケンスデータセットのコレクション
8. pasilla
Data package with per-exon and per-gene read counts of RNA-seq samples of Pasilla knock-down by Brooks et al., Genome Research 2011.
Brooksら、Genome Research 2011によるPasillaノックダウンのRNA配列サンプルのエクソン単位および遺伝子単位の読み取りカウントを含むデータパッケージ。
9. tximportData
tximportData
tximportData
10. ChAMPdata
Data Packages for ChAMP package
ChAMPパッケージ用データパッケージ
11. Illumina450ProbeVariants.db
Annotation Package combining variant data from 1000 Genomes Project for Illumina HumanMethylation450 Bead Chip probes
イルミナのための1000のゲノムプロジェクトからの変形データを結合している注釈パッケージヒトメチル化450ビーズチッププローブ
12. bladderbatch
Bladder gene expression data illustrating batch effects
バッチ効果を説明する膀胱遺伝子発現データ
13. GSVAdata
Data employed in the vignette of the GSVA package
GSVAパッケージのビネットで採用されているデータ
14. msdata
Various Mass Spectrometry raw data example files
各種質量分析生データサンプルファイル
15. bcellViper
Human B-cell transcriptional interactome and normal human B-cell expression data
ヒトB細胞転写インタラクトームと正常ヒトB細胞発現データ
16. sesameData
Supporting Data for SeSAMe Package
SeSAMeパッケージのサポートデータ
17. TENxPBMCData
PBMC data from 10X Genomics
10X GenomicsのPBMCデータ
18. dorothea
Collection Of Human And Mouse TF Regulons
ヒトおよびマウスTFレギュロンのコレクション
19. minfiData
Example data for the Illumina Methylation 450k array
Illumina Methylation 450kアレイのデータ例
20. gageData
Auxillary data for gage package
ゲージパッケージの補助データ
21. RTCGA.clinical
Clinical datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectの臨床データセット
22. fission
RangedSummarizedExperiment for time course RNA-Seq of fission yeast in response to stress, by Leong et al., Nat Commun 2014.
ストレスに応じた分裂酵母の経時的RNA-Seqの範囲拡大実験、Leong et al。、Nat Commun 2014による。
23. affydata
Affymetrix Data for Demonstration Purpose
デモ目的のAffymetrixデータ
24. systemPipeRdata
systemPipeRdata: NGS workflow templates and sample data
systemPipeRdata:NGSワークフローテンプレートとサンプルデータ
25. faahKO
Saghatelian et al. (2004) FAAH knockout LC/MS data
サガテリアン他(2004)FAAHノックアウトLC / MSデータ
26. parathyroidSE
RangedSummarizedExperiment for RNA-Seq of primary cultures of parathyroid tumors by Haglund et al., J Clin Endocrinol Metab 2012.
Haglundら、J Clin Endocrinol Metab 2012による、副甲状腺腫瘍の初代培養物のRNA-SeqについてのRangedSummarizedExperiment。
27. curatedMetagenomicData
Curated Metagenomic Data of the Human Microbiome
ヒトミクロバイオームの管理メタゲノムデータ
28. CLL
A Package for CLL Gene Expression Data
CLL遺伝子発現データのためのパッケージ
29. DMRcatedata
Data Package for DMRcate package
DMRcateパッケージ用データパッケージ
30. FlowSorted.Blood.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted blood cell populations
選別された血球集団に関するIllumina HumanMethilationデータ
31. golubEsets
exprSets for golub leukemia data
ゴルブ白血病データのexprSet
32. RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
Aligned reads from RNAseq experiment: Transcription profiling by high throughput sequencing of HNRNPC knockdown and control HeLa cells
RNAseq実験からの整列リード:HNRNPCノックダウンおよび対照HeLa細胞のハイスループットシークエンシングによる転写プロファイリング
33. ELMER.data
Data for the ELMER package
ELMERパッケージのデータ
34. pasillaBamSubset
Subset of BAM files from “Pasilla” experiment
「Pasilla」実験からのBAMファイルのサブセット
35. curatedTCGAData
Curated Data From The Cancer Genome Atlas (TCGA) as MultiAssayExperiment Objects
MultiAssayExperimentオブジェクトとしての癌ゲノムアトラス(TCGA)からのキュレーションデータ
36. pRolocdata
Data accompanying the pRoloc package
pRolocパッケージに付随するデータ
37. KEGGdzPathwaysGEO
KEGG Disease Datasets from GEO
GEOのKEGG病データセット
38. EGSEAdata
Gene set collections for the EGSEA package
EGSEAパッケージの遺伝子セットコレクション
39. RTCGA.mRNA
mRNA datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのmRNAデータセット
40. RnBeads.hg19
RnBeads.hg19
RnBeads.hg19
41. RforProteomics
Companion package to the ‘Using R and Bioconductor for proteomics data analysis’ publication
「プロテオミクスデータ分析のためのRおよびバイオコンダクターの使用」出版物へのコンパニオンパッケージ
42. RTCGA.rnaseq
Rna-seq datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのRna-seqデータセット
43. FlowSorted.Blood.EPIC
Illumina EPIC data on immunomagnetic sorted peripheral adult blood cells
免疫磁気選別末梢成人血液細胞に関するIllumina EPICデータ
44. HDCytoData
Collection of high-dimensional cytometry benchmark datasets in Bioconductor object formats
Bioconductorオブジェクトフォーマットでの高次元サイトメトリーベンチマークデータセットの収集
45. RnBeads.hg38
RnBeads.hg38
RnBeads.hg38
46. zebrafishRNASeq
Zebrafish RNA-Seq Experimental Data from Ferreira et al. (2014)
FerreiraらからのゼブラフィッシュRNA-Seq実験データ。 (2014年)
47. depmap
Cancer Dependency Map Data Package
がん依存マップデータパッケージ
48. msigdb
An ExperimentHub Package for the Molecular Signatures Database (MSigDB)
Molecular Signatures Database (MSigDB)のExperimentHubパッケージ
49. leukemiasEset
Leukemia’s microarray gene expression data (expressionSet).
白血病のマイクロアレイ遺伝子発現データ(expressionSet)。
50. macrophage
Human macrophage immune response
ヒトマクロファージ免疫応答
51. MouseGastrulationData
Single-Cell Transcriptomics Data across Mouse Gastrulation and Early Organogenesis
マウスの原腸形成と初期器官形成における単一細胞のトランスクリプトミクスデータ
52. RnBeads.mm10
RnBeads.mm10
RnBeads.mm10
53. TCGAWorkflowData
Data for TCGA Workflow
TCGAワークフローのデータ
54. tweeDEseqCountData
RNA-seq count data employed in the vignette of the tweeDEseq package
tweeDEseqパッケージのビネットで採用されているRNA-seqカウントデータ
55. JASPAR2016
Data package for JASPAR 2016
JASPAR 2016用データパッケージ
56. Hiiragi2013
Cell-to-cell expression variability followed by signal reinforcement progressively segregates early mouse lineages
細胞間発現変動とそれに続くシグナル強化は初期マウス系統を漸進的に分離する
57. breastCancerVDX
Gene expression datasets published by Wang et al. [2005] and Minn et al. [2007] (VDX).
Wangらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2005]およびMinn et al。 [2007](VDX)。
58. spatialLIBD
LIBD Visium spatial transcriptomics human pilot data inspector
LIBD Visium 空間トランスクリプトノミクスヒトパイロットデータインスペクター
59. humanStemCell
Human Stem Cells time course experiment
ヒト幹細胞タイムコース実験
60. QDNAseq.hg19
QDNAseq bin annotation for hg19
hg19のQDNAseq binアノテーション
61. DropletTestFiles
Test Files for Single-Cell Droplet Utilities
シングルセル液滴ユーティリティ用テストファイル
62. flowWorkspaceData
A data package containing two flowJo, one diva xml workspace and the associated fcs files as well as three GatingSets for testing the flowWorkspace, openCyto and CytoML packages.
flowWorkspace、openCytoおよびCytoMLパッケージをテストするための2つのflowJo、1つのdiva xmlワークスペース、および関連するfcsファイル、ならびに3つのGatingSetを含むデータパッケージ。
63. RnBeads.mm9
RnBeads.mm9
RnBeads.mm9
64. DLBCL
Diffuse large B-cell lymphoma expression data
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫の発現データ
65. RnaSeqSampleSizeData
RnaSeqSampleSizeData
RnaSeqSampleSizeData
66. chipenrich.data
Companion package to chipenrich
chipenrichのコンパニオンパッケージ
67. RTCGA.miRNASeq
miRNASeq datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのmiRNASeqデータセット
68. RTCGA.mutations
Mutations datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectの突然変異データセット
69. SpikeInSubset
Part of Affymetrix’s Spike-In Experiment Data
Affymetrixのスパイクイン実験データの一部
70. estrogen
Microarray dataset that can be used as example for 2×2 factorial designs
2×2の要因計画の例として使用できるマイクロアレイデータセット
71. h5vcData
Example data for the h5vc package
h5vcパッケージのデータ例
72. ewceData
The ewceData package provides reference data required for ewce
ewceData パッケージは、ewce に必要なリファレンスデータを提供します。
73. DAPARdata
Data accompanying the DAPAR and Prostar packages
DAPARおよびProstarパッケージに付随するデータ
74. MSMB
Data sets for the book ‘Modern Statistics for Biology’
本「生物学のための現代統計学」のためのデータセット
75. TENxBrainData
Data from the 10X 1.3 Million Brain Cell Study
10×130万の脳細胞研究からのデータ
76. muscData
Multi-sample multi-group scRNA-seq data
マルチサンプルマルチグループscRNA-seqデータ
77. breastCancerMAINZ
Gene expression dataset published by Schmidt et al. [2008] (MAINZ).
Schmidtらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2008](MAINZ)。
78. ccdata
Data for Combination Connectivity Mapping (ccmap) Package
組み合わせ接続マッピング(ccmap)パッケージのデータ
79. yeastExpData
Yeast Experimental Data
酵母実験データ
80. breastCancerNKI
Genexpression dataset published by van’t Veer et al. [2002] and van de Vijver et al. [2002] (NKI).
van’t Veerらによって発表された遺伝子発現データセット。 [2002]およびvan de Vijver et al。 [2002](NKI)。
81. mosaicsExample
Example data for the mosaics package, which implements MOSAiCS and MOSAiCS-HMM, a statistical framework to analyze one-sample or two-sample ChIP-seq data for transcription factor binding and histone modification
MOSAiCSおよびMOSAiCS-HMMを実装するモザイクパッケージのデータ例、転写因子結合およびヒストン修飾について1サンプルまたは2サンプルのChIP-seqデータを分析するための統計的フレームワーク
82. AneuFinderData
WGSCS Data for Demonstration Purposes
デモンストレーション目的のWGSCSデータ
83. chromstaRData
ChIP-seq data for Demonstration Purposes
デモンストレーション目的のChIP-seqデータ
84. ALLMLL
A subset of arrays from a large acute lymphoblastic leukemia (ALL) study
大急性リンパ芽球性白血病(ALL)研究からのアレイのサブセット
85. microbiomeDataSets
Experiment Hub based microbiome datasets
Experiment Hubベースのマイクロバイオームデータセット
86. FIs
Human Functional Interactions (FIs) for splineTimeR package
splineTimeRパッケージの人間機能的相互作用(FI)
87. CopyhelpeR
Helper files for CopywriteR
CopywriteRのためのヘルパーファイル
88. ReactomeGSA.data
Companion data package for the ReactomeGSA package
ReactomeGSAパッケージのコンパニオンデータパッケージ
89. RegParallel
Standard regression functions in R enabled for parallel processing over large data-frames
大きなデータフレームでの並列処理を可能にするRの標準回帰関数
90. SBGNview.data
Demo gene expression datasets for SBGNview package
SBGNviewパッケージの遺伝子発現データセットのデモ
91. AffymetrixDataTestFiles
Affymetrix data files (CEL, CDF, CHP, EXP, PGF, PSI) for testing
テスト用Affymetrixデータファイル(CEL、CDF、CHP、EXP、PGF、PSI)
92. MOFAdata
Data package for Multi-Omics Factor Analysis (MOFA)
マルチオミクス因子分析(MOFA)用データパッケージ
93. curatedOvarianData
Clinically Annotated Data for the Ovarian Cancer Transcriptome
卵巣癌トランスクリプトームの臨床的注釈付きデータ
94. gcspikelite
Spike-in data for GC/MS data and methods within flagme
GC / MSデータのスパイクインデータとflagme内のメソッド
95. HCAData
Accessing The Datasets Of The Human Cell Atlas in R/Bioconductor
R / Bioconductorでのヒト細胞アトラスのデータセットへのアクセス
96. stemHypoxia
Differentiation of Human Embryonic Stem Cells under Hypoxia gene expression dataset by Prado-Lopez et al. (2010)
Prado-Lopez等による低酸素遺伝子発現データセットの下でのヒト胚性幹細胞の分化。 (2010年)
97. yeastCC
Spellman et al. (1998) and Pramila/Breeden (2006) yeast cell cycle microarray data
スペルマン等。 (1998)およびPramila / Breeden(2006)酵母細胞周期マイクロアレイデータ
98. aracne.networks
ARACNe-inferred gene networks from TCGA tumor datasets
TCGA腫瘍データセットからのARACNe推定遺伝子ネットワーク
99. COPDSexualDimorphism.data
Data to support sexually dimorphic and COPD differential analysis for gene expression and methylation.
遺伝子発現およびメチル化についての性的二型およびCOPD示差分析を裏付けるデータ。
100. FlowSorted.CordBloodCombined.450k
Illumina 450k/EPIC data on FACS and MACS umbilical blood cells
FACSおよびMACS臍帯血細胞に関するIllumina 450k / EPICデータ
101. COHCAPanno
Annotations for City of Hope CpG Island Analysis Pipeline
希望都市CpGアイランド分析パイプラインのアノテーション
102. mCSEAdata
Data package for mCSEA package
mCSEAパッケージ用データパッケージ
103. COSMIC.67
COSMIC.67
コスミック67
104. KOdata
LINCS Knock-Out Data Package
LINCSノックアウトデータパッケージ
105. minfiDataEPIC
Example data for the Illumina Methylation EPIC array
Illumina Methylation EPICアレイのデータ例
106. simpIntLists
The package contains BioGRID interactions for various organisms in a simple format
このパッケージには、さまざまな生物に対するBioGRIDインタラクションが単純な形式で含まれています
107. RNAmodR.Data
Example data for the RNAmodR package
RNAmodRパッケージのデータ例
108. seqCNA.annot
Annotation for the copy number analysis of deep sequencing cancer data with seqCNA
seqCNAを用いたディープシーケンシング癌データのコピー数分析のための注釈
109. signatureSearchData
Datasets for signatureSearch package
signatureSearchパッケージのデータセット
110. cMap2data
Connectivity Map (version 2) Data
接続マップ(バージョン2)データ
111. DrugVsDiseasedata
Drug versus Disease Data
薬物対疾病データ
112. breakpointRdata
Strand-seq data for demonstration purposes
デモンストレーション用のストランドシーケンスデータ
113. rcellminerData
rcellminerData: Molecular Profiles and Drug Response for the NCI-60 Cell Lines
rcellminerData:NCI-60細胞株の分子プロファイルと薬物応答
114. bsseqData
Example whole genome bisulfite data for the bsseq package
bsseqパッケージの全ゲノム亜硫酸水素塩データの例
115. HMP16SData
16S rRNA Sequencing Data from the Human Microbiome Project
Human Microbiome Projectの16S rRNAシーケンスデータ
116. IlluminaDataTestFiles
Illumina microarray files (IDAT) for testing
テスト用のIlluminaマイクロアレイファイル(IDAT)
117. PREDAsampledata
expression and copy number data on clear cell renal carcinoma samples
明細胞腎癌サンプルの発現とコピー数のデータ
118. pwrEWAS.data
pwrEWAS.data: Reference data accompanying pwrEWAS
pwrEWAS.data:pwrEWASに付随する参照データ
119. QDNAseq.mm10
Bin annotation mm10
ビンアノテーションmm10
120. seq2pathway.data
data set for R package seq2pathway
Rパッケージseq2pathwayのデータセット
121. TBX20BamSubset
Subset of BAM files from the “TBX20” experiment
「TBX20」実験からのBAMファイルのサブセット
122. breastCancerUPP
Gene expression dataset published by Miller et al. [2005] (UPP).
Millerらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2005](UPP)。
123. genomationData
Experimental data for showing functionalities of the genomation package
genomationパッケージの機能を示すための実験データ
124. KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO
Disease Datasets from GEO
GEOの疾病データセット
125. SomaticCancerAlterations
Somatic Cancer Alterations
体細胞がんの変化
126. yeastRNASeq
Yeast RNA-Seq Experimental Data from Lee et al. 2008
Leeらの酵母RNA-Seq実験データ。 2008年
127. ARRmData
Example dataset for normalization of Illumina 450k Methylation data
Illumina 450kメチル化データの正規化のためのサンプルデータセット
128. breastCancerTRANSBIG
Gene expression dataset published by Desmedt et al. [2007] (TRANSBIG).
Desmedtらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2007](TRANSBIG)
129. ChIC.data
ChIC package data
ChICパッケージデータ
130. RTCGA.CNV
CNV (Copy-number variation) datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのCNV(コピー数変動)データセット
131. RUVnormalizeData
Gender data for the RUVnormalize package
RUVnormalizeパッケージの性別データ
132. synapterdata
Data accompanying the synapter package
シナプスパッケージに付随するデータ
133. WES.1KG.WUGSC
Whole Exome Sequencing (WES) of chromosome 22 401st to 500th exon from the 1000 Genomes (1KG) Project by the Washington University Genome Sequencing Center (WUGSC).
ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンター(WUGSC)による1000ゲノム(1KG)プロジェクトからの22番染色体の401番目から500番目のエキソンの全エキソーム配列決定(WES)。
134. beadarrayExampleData
Example data for the beadarray package
beadarrayパッケージのデータ例
135. fibroEset
exprSet for Karaman et al. (2003) fibroblasts data
KaramanらのexprSet。 (2003)線維芽細胞データ
136. GWASdata
Data used in the examples and vignettes of the GWASTools package
GWASToolsパッケージの例とビネットで使用されているデータ
137. ITALICSData
ITALICSData
ITALICSData
138. leeBamViews
leeBamViews — multiple yeast RNAseq samples excerpted from Lee 2009
leeBamViews – Lee 2009から抜粋した複数の酵母RNAseqサンプル
139. LungCancerACvsSCCGEO
A lung cancer dataset that can be used with maPredictDSC package for developing outcome prediction models from Affymetrix CEL files.
Affymetrix CELファイルからの転帰予測モデルを開発するためにmaPredictDSCパッケージと共に使用できる肺癌データセット。
140. biscuiteerData
Data Package for Biscuiteer
Biscuiteerのデータパッケージ
141. breastCancerUNT
Gene expression dataset published by Sotiriou et al. [2007] (UNT).
Sotiriouらによって公表された遺伝子発現データセット。 [2007](UNT)。
142. CCl4
Carbon Tetrachloride (CCl4) treated hepatocytes
四塩化炭素(CCl 4)処理肝細胞
143. pcxnData
Correlation coefficients and p values between pre-defined pathway/gene sets
定義済み経路/遺伝子セット間の相関係数とp値
144. RTCGA.methylation
Methylation datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas Projectのメチル化データセット
145. SNAGEEdata
SNAGEE data
SNAGEEデータ
146. DuoClustering2018
Data, Clustering Results and Visualization Functions From Duò et al (2018)
Duòet al(2018)のデータ、クラスタリング結果および可視化関数
147. miRcompData
Data used in the miRcomp package
miRcompパッケージで使用されるデータ
148. RGMQLlib
RGMQLlib, java libraries to run GMQL scala API
RGMQLlib、GMQL scala APIを実行するためのJavaライブラリ
149. RITANdata
This package contains the annotation and network data sets
このパッケージはアノテーションとネットワークデータセットを含みます
150. SingleCellMultiModal
Integrating Multi-modal Single Cell Experiment datasets
マルチモーダル単細胞実験データセットの統合
151. FlowSorted.CordBlood.450k
Illumina 450k data on sorted cord blood cells
分類された臍帯血細胞に関するIllumina 450kデータ
152. msPurityData
Fragmentation spectral libraries and data to test the msPurity package
msPurityパッケージをテストするためのフラグメンテーションスペクトルライブラリとデータ
153. NanoporeRNASeq
Nanopore RNA-Seq Example data
ナノポアRNA-Seq例データ
154. optimalFlowData
optimalFlowData
最適フローデータ
155. PasillaTranscriptExpr
Data package with transcript expression obtained with kallisto from pasilla knock-down RNA-Seq data from Brooks et al.
BrooksらからのpasillaノックダウンRNA-Seqデータからのカリストを用いて得られた転写物発現を有するデータパッケージ。
156. RTCGA.RPPA
RPPA datasets from The Cancer Genome Atlas Project
The Cancer Genome Atlas ProjectのRPPAデータセット
157. STexampleData
Collection of spatially resolved transcriptomics datasets in SpatialExperiment Bioconductor format
SpatialExperiment Bioconductorフォーマットの空間的に分解されたトランスクリプトームデータセットのコレクション
158. brgedata
Exposures, Gene Expression and Methylation data for ilustration purpouses
小話パープルハウスの曝露、遺伝子発現およびメチル化データ
159. JASPAR2014
Data package for JASPAR
JASPAR用データパッケージ
160. methylclockData
Data for methylclock package
Methylclockパッケージ用データ
161. ChIPXpressData
ChIPXpress Pre-built Databases
ChIPXpressの構築済みデータベース
162. grndata
Synthetic Expression Data for Gene Regulatory Network Inference
遺伝子調節ネットワーク推論のための合成発現データ
163. ppiData
A package that contains the bait to prey directed graphs for protein-protein interactions.
タンパク質 – タンパク質相互作用に関する有向グラフを餌にするための餌を含むパッケージ。
164. yeastNagalakshmi
Yeast genome RNA sequencing data based on Nagalakshmi et. al.
Nagalakshmiらに基づく酵母ゲノムRNA配列決定データ。 al。
165. adductData
Data from untargeted MS of modifications to Cys34 of serum albumin
血清アルブミンのCys34に対する修飾の非標的MSからのデータ
166. OMICsPCAdata
Supporting data for package OMICsPCA
パッケージOMICsPCAの補助データ
167. TENxVisiumData
Visium spatial gene expression data by 10X Genomics
10X Genomics社のVisium空間遺伝子発現データ
168. GeuvadisTranscriptExpr
Data package with transcript expression and bi-allelic genotypes from the GEUVADIS project
GEUVADISプロジェクトからの転写産物発現および二対立遺伝子型を含むデータパッケージ
169. lungExpression
ExpressionSets for Parmigiani et al., 2004 Clinical Cancer Research paper
Parmigiani et al。、2004臨床癌研究論文のための発現セット
170. NGScopyData
Subset of BAM files of human tumor and pooled normal sequencing data (Zhao et al. 2014) for the NGScopy package
NGScopyパッケージ用のヒト腫瘍のBAMファイルのサブセットおよびプールされた正常な配列決定データ(Zhao et al。2014)
171. BloodCancerMultiOmics2017
“Drug-perturbation-based stratification of blood cancer” by Dietrich S, Oles M, Lu J et al. – experimental data and complete analysis
「薬物摂動に基づく血液癌の層別化」、Dietrich S、Oles M、Lu J et al。 – 実験データと完全な解析
172. chipseqDBData
Data for the chipseqDB Workflow
chipseqDBワークフローのデータ
173. derfinderData
Processed BigWigs from BrainSpan for examples
例としてBrainSpanのProcessed BigWigs
174. GSE62944
GEO accession data GSE62944 as a SummarizedExperiment
要約実験としてのGEO登録データGSE62944
175. QUBICdata
Data employed in the vignette of the QUBIC package
QUBICパッケージのビネットで採用されているデータ
176. RTCGA.PANCAN12
PanCan 12 from Genome Cancer Browser
ゲノムがんブラウザからPanCan 12
177. Affyhgu133Plus2Expr
Affyhgu133Plus2Expr (GPL570) Expression Data Package
Affyhgu133Plus2Expr(GPL570)発現データパッケージ
178. Fletcher2013a
Gene expression data from breast cancer cells under FGFR2 signalling perturbation
FGFR2シグナリング摂動下の乳癌細胞からの遺伝子発現データ
179. FlowSorted.DLPFC.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted frontal cortex cell populations
分類された前頭皮質細胞集団に関するイルミナのヒトメチル化データ
180. M3DExampleData
M3Drop Example Data
M3Dropサンプルデータ
181. tartare
Raw ground spectra recorded on Thermo Fisher Scientific mass spectrometers
Thermo Fisher Scientific質量分析計で記録された生の地上スペクトル
182. antiProfilesData
Normal colon and cancer preprocessed affy data for antiProfile building.
通常の結腸癌および癌は抗プロファイル構築のための前処理されたアフィニティーデータです。
183. RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
RcisTarget motif databases for human (hg19) – Subset of 4.6k motifs
ヒト用RcisTargetモチーフデータベース(hg19) – 4.6kモチーフのサブセット
184. Fletcher2013b
Master regulators of FGFR2 signalling and breast cancer risk
FGFR2シグナル伝達と乳がんリスクの主な調節因子
185. maqcExpression4plex
Sample Expression Data – MAQC / HG18 – NimbleGen
サンプル発現データ – MAQC / HG18 – NimbleGen
186. OnassisJavaLibs
OnassisJavaLibs, java libraries to run conceptmapper and semantic similarity
OnassisJavaLibs、conceptmapperとセマンティックの類似性を実行するためのJavaライブラリ
187. SCATEData
Data for SCATE (Single-cell ATAC-seq Signal Extraction and Enhancement)
SCATE (Single-cell ATAC-seq Signal Extraction and Enhancement)のデータ
188. hapmapsnp6
Sample data – Hapmap SNP 6.0 Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap SNP 6.0 Affymetrix
189. lumiBarnes
Barnes Benchmark Illumina Tissues Titration Data
Barnes Benchmark Illuminaが滴定データを組織化
190. TCGAMethylation450k
The Cancer Genome Atlas Illumina 450k methylation example data
Cancer Genome Atlas Illumina 450kメチル化データの例
191. alpineData
Data for the alpine package vignette
アルパインパッケージビネットのデータ
192. HelloRangesData
Data for the HelloRanges tutorial vignette
HelloRangesチュートリアルビネットのデータ
193. MEDIPSData
Example data for MEDIPS and QSEA packages
MEDIPSおよびQSEAパッケージのデータ例
194. metaMSdata
Example CDF data for the metaMS package
metaMSパッケージのCDFデータの例
195. mtbls2
MetaboLights MTBLS2: Comparative LC/MS-based profiling of silver nitrate-treated Arabidopsis thaliana leaves of wild-type and cyp79B2 cyp79B3 double knockout plants. Böttcher et al. (2004)
MetaboLights MTBLS2野生型およびcyp79B2 cyp79B3二重ノックアウト植物の硝酸銀処理Arabidopsis thaliana葉のLC / MSに基づく比較プロファイリングベッチャー等。 (2004年)
196. BeadArrayUseCases
Analysing Illumina BeadArray expression data using Bioconductor
Bioconductorを使用したIllumina BeadArray発現データの分析
197. cancerdata
Development and validation of diagnostic tests from high-dimensional molecular data: Datasets
高次元分子データからの診断テストの開発と検証:データセット
198. emtdata
An ExperimentHub Package for data sets with an Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT)
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT)を伴うデータセットのためのExperimentHubパッケージ
199. msd16s
Healthy and moderate to severe diarrhea 16S expression data
健康で中等度から重度の下痢16S発現データ
200. Affyhgu133aExpr
Affymetrix Human hgu133a Array (GPL96) Expression Data Package
Affymetrix Human hgu133a Array(GPL96)発現データパッケージ
201. Affymoe4302Expr
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array (GPL1261) Expression Data Package
Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array(GPL1261)発現データパッケージ
202. CardinalWorkflows
Datasets and workflows for the Cardinal mass spectrometry imaging package
Cardinal質量分析イメージングパッケージのデータセットとワークフロー
203. hapmap100kxba
Sample data – Hapmap 100K XBA Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 100K XBA Affymetrix
204. MetaGxBreast
Transcriptomic Breast Cancer Datasets
トランスクリプトーム乳がんデータセット
205. minionSummaryData
Summarised MinION sequencing data published by Ashton et al. 2015
Ashtonらによって公表された要約されたMinION配列決定データ。 2015年
206. PWMEnrich.Hsapiens.background
H. sapiens background for PWMEnrich
PWMEnrichのH. sapiens背景
207. timecoursedata
A data package for timecourse RNA-seq and microarray gene expression data sets
タイムコースRNA-seqおよびマイクロアレイ遺伝子発現データセットのためのデータパッケージ
208. ASICSdata
Example of 1D NMR spectra data for ASICS package
ASICSパッケージの1次元NMRスペクトルデータの例
209. CluMSIDdata
Data for the CluMSID package
CluMSIDパッケージのデータ
210. curatedBladderData
Bladder Cancer Gene Expression Analysis
膀胱癌遺伝子発現解析
211. DExMAdata
Data package for DExMA package
DExMAパッケージのデータパッケージ
212. diffloopdata
Example ChIA-PET Datasets for the diffloop Package
diffloopパッケージ用のChIA-PETデータセットの例
213. ecoliLeucine
Experimental data with Affymetrix E. coli chips
Affymetrix E. coliチップによる実験データ
214. FANTOM3and4CAGE
CAGE data from FANTOM3 and FANTOM4 projects
FANTOM3とFANTOM4プロジェクトからのケージデータ
215. HMP2Data
16s rRNA sequencing data from the Human Microbiome Project 2
Human Microbiome Project 2の16秒rRNAシーケンスデータ
216. PCHiCdata
Promoter Capture Hi-C data
プロモーターキャプチャーHi-Cデータ
217. TENxBUSData
Single cell dataset from 10x in BUS format
BUS形式の10xの単一セルデータセット
218. WGSmapp
Mappability tracks of Whole-genome Sequencing from the ENCODE Project
ENCODEプロジェクトの全ゲノムシークエンシングのマッピングトラック
219. colonCA
exprSet for Alon et al. (1999) colon cancer data
AlonらのexprSet。 (1999)大腸がんデータ
220. HarmanData
Data for the Harman package
Harmanパッケージのデータ
221. HiCDataHumanIMR90
Human IMR90 Fibroblast HiC data from Dixon et al. 2012
DixonらからのヒトIMR90線維芽細胞HiCデータ。 2012年
222. tissueTreg
TWGBS and RNA-seq data from tissue T regulatory cells from mice
マウスの組織T制御細胞からのTWGBSおよびRNA配列データ
223. Affyhgu133A2Expr
Affymetrix Human Genome U133A 2.0 Array (GPL571) Expression Data Package
Affymetrix Human Genome U133A 2.0アレイ(GPL571)発現データパッケージ
224. biotmleData
Example experimental microarray data set for the “biotmle” R package
「biotmle」Rパッケージ用の実験用マイクロアレイデータセットの例
225. ConnectivityMap
Functional connections between drugs, genes and diseases as revealed by common gene-expression changes
一般的な遺伝子発現変化によって明らかにされた薬物、遺伝子および疾患間の機能的関連
226. curatedBreastData
Curated breast cancer gene expression data with survival and treatment information
生存および治療情報を含むキュレーション乳がん遺伝子発現データ
227. lydata
Example Dataset for crossmeta Package
crossmetaパッケージのデータセット例
228. SpikeIn
Affymetrix Spike-In Experiment Data
Affymetrixスパイクイン実験データ
229. TabulaMurisData
10x And SmartSeq2 Data From The Tabula Muris Consortium
Tabula Murisコンソーシアムの10倍およびSmartSeq 2データ
230. affycompData
affycomp data
affycompデータ
231. AmpAffyExample
Example of Amplified Data
増幅データの例
232. bodymapRat
Experimental dataset from the rat BodyMap project
ラットBodyMapプロジェクトからの実験データセット
233. FlowSorted.CordBloodNorway.450k
Illumina HumanMethylation data on sorted cord blood cell populations
選別された臍帯血細胞集団のIllumina Humanメチル化データ
234. MetaGxOvarian
Transcriptomic Ovarian Cancer Datasets
トランスクリプトーム卵巣癌データセット
235. MethylAidData
MethylAid-summarized data for 2800 Illumina 450k array samples and 2620 EPIC array samples
2800 Illumina 450kアレイサンプルおよび2620 EPICアレイサンプルのメチルエイド要約データ
236. nanotubes
Mouse nanotube CAGE data
マウスナノチューブCAGEデータ
237. RMassBankData
Test dataset for RMassBank
RMassBank用テストデータセット
238. shinyMethylData
Example dataset of input data for shinyMethyl
shinyMethylの入力データのサンプルデータセット
239. celarefData
Processed scRNA data for celaref Vignette – cell labelling by reference
celaref Vignetteのために処理されたscRNAデータ – 参照による細胞標識
240. curatedCRCData
Colorectal Cancer Gene Expression Analysis
大腸癌遺伝子発現解析
241. hapmapsnp5
Sample data – Hapmap SNP 5.0 Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap SNP 5.0 Affymetrix
242. LungCancerLines
Reads from Two Lung Cancer Cell Lines
2つの肺がん細胞株から読み取る
243. PepsNMRData
Datasets for the PepsNMR package
PepsNMRパッケージ用のデータセット
244. PWMEnrich.Dmelanogaster.background
D. melanogaster background for PWMEnrich
D. melanogasterのPWMEnrich背景
245. PWMEnrich.Mmusculus.background
M. musculus background for PWMEnrich
PWMEnrichのM. musculus背景
246. RNASeqRData
RNASeqRData: sample data for RNASeqR software package demonstration
RNASeqRData:RNASeqRソフトウェアパッケージのデモ用サンプルデータ
247. AssessORFData
Data and Files for the AssessORF Package
AssessORFパッケージのデータとファイル
248. blimaTestingData
Data for testing of the package blima.
パッケージblimaのテストのためのデータ。
249. CellMapperData
Pre-processed data for use with the CellMapper package
CellMapperパッケージで使用するための前処理済みデータ
250. diggitdata
Example data for the diggit package
diggitパッケージのデータ例
251. PtH2O2lipids
P. tricornutum HPLC-ESI-MS Lipid Data from van Creveld et al. (2015)
P. (2015年)
252. seqc
RNA-seq data generated from SEQC (MAQC-III) study
SEQC(MAQC-III)試験から得られたRNA-seqデータ
253. clustifyrdatahub
External data sets for clustifyr in ExperimentHub
ExperimentHubにあるclustifyrの外部データセット
254. CopyNeutralIMA
Copy Neutral Illumina Methylation Arrays
中性イルミナメチル化アレイのコピー
255. DREAM4
Synthetic Expression Data for Gene Regulatory Network Inference from the 2009 DREAM4 challenge
2009年のDREAM4チャレンジからの遺伝子調節ネットワーク推論のための合成発現データ
256. flowPloidyData
Example Flow Cytometry Data
フローサイトメトリーデータの例
257. frmaExampleData
Frma Example Data
医薬品サンプルデータ
258. GenomicDistributionsData
Reference data for GenomicDistributions package
GenomicDistributionsパッケージのリファレンスデータ
259. GSE13015
GEO accession data GSE13015_GPL6106 as a SummarizedExperiment
GEO accession data GSE13015_GPL6106 as a SummarizedExperiment
260. HarmonizedTCGAData
Processed Harmonized TCGA Data of Five Selected Cancer Types
選択された5つの癌の種類に関する処理済みの調和TCGAデータ
261. HD2013SGI
Mapping genetic interactions in human cancer cells with RNAi and multiparametric phenotyping
RNAiとマルチパラメトリック表現型を用いたヒト癌細胞における遺伝的相互作用のマッピング
262. MetaGxPancreas
Transcriptomic Pancreatic Cancer Datasets
トランスクリプトーム膵臓癌データセット
263. PathNetData
Experimental data for the PathNet package
PathNetパッケージの実験データ
264. pepDat
Peptide microarray data package
ペプチドマイクロアレイデータパッケージ
265. ProData
SELDI-TOF data of Breast cancer samples
乳がんサンプルのSELDI-TOFデータ
266. TMExplorer
A Collection of Tumour Microenvironment Single-cell RNA Sequencing Datasets and Correspodnding Metadata
腫瘍微小環境単細胞RNAシークエンシングデータセットと対応するメタデータのコレクション
267. ChIPexoQualExample
Example data for the ChIPexoQual package, which implements a quality control pipeline for ChIP-exo data
ChIP-exoデータの品質管理パイプラインを実装するChIPexoQualパッケージのデータ例
268. dyebiasexamples
Example data for the dyebias package, which implements the GASSCO method.
GASSCO法を実行するdyebiasパッケージのデータ例。
269. etec16s
Individual-specific changes in the human gut microbiota after challenge with enterotoxigenic Escherichia coli and subsequent ciprofloxacin treatment
腸管毒素原性大腸菌による攻撃およびその後のシプロフロキサシン処理後のヒト腸内微生物叢の個体特異的変化
270. gatingMLData
Data and XML files for Gating-ML Test suite
Gating-MLテストスイートのデータとXMLファイル
271. HiCDataLymphoblast
Human lymphoblastoid HiC data from Lieberman-Aiden et al. 2009
Lieberman-Aidenらからのヒトリンパ芽細胞質HiCデータ。 2009年
272. HumanAffyData
GEO accession GSE64985 and ArrayExpress accession E-MTAB-62 as ExpressionSet objects
ExpressionSetオブジェクトとしてのGEO登録GSE64985およびArrayExpress登録E-MTAB-62
273. mAPKLData
Gene expression data for testing of the package mAPKL.
パッケージmAPKLのテスト用の遺伝子発現データ。
274. MouseThymusAgeing
Single-cell Transcriptomics Data of the Ageing Mouse Thymus
加齢マウス胸腺のシングルセル・トランスクリプトミクスデータ
275. restfulSEData
Example metadata for the “restfulSE” R package
「restfulSE」Rパッケージのメタデータの例
276. sampleClassifierData
Pre-processed data for use with the sampleClassifier package
sampleClassifierパッケージで使用するための前処理済みデータ
277. SCLCBam
Sequence data from chromosome 4 of a small-cell lung tumor
小細胞肺腫瘍の4番染色体からの配列データ
278. scpdata
Single-Cell Proteomics Data Package
シングルセルプロテオミクスデータパッケージ
279. TargetScoreData
TargetScoreData
TargetScoreData
280. tofsimsData
Import, process and analysis of ToF-SIMS imaging data
ToF-SIMSイメージングデータのインポート、処理、分析
281. benchmarkfdrData2019
Data and Benchmarking Results from Korthauer and Kimes et al. (2019)
Korthauer and Kimes et al。からのデータとベンチマーク結果(2019)
282. beta7
Rodriguez et al. (2004) Differential Gene Expression by Memory/Effector T Helper Cells Bearing the Gut-Homing Receptor Integrin alpha4 beta7.
ロドリゲス等。 (2004)腸ホーミング受容体インテグリンα4β7を有する記憶/エフェクターTヘルパー細胞による示差的遺伝子発現。
283. ChimpHumanBrainData
Chimp and human brain data package
チンパンジーと人間の脳のデータパッケージ
284. harbChIP
Experimental Data Package: harbChIP
実験データパッケージ:harbChIP
285. healthyFlowData
Healthy dataset used by the flowMatch package
flowMatchパッケージで使用される健全なデータセット
286. HEEBOdata
HEEBO set and HEEBO controls.
HEEBOセットとHEEBOコントロール。
287. hgu133plus2CellScore
CellScore Standard Cell Types Expression Dataset [hgu133plus2]
CellScoreスタンダードセルタイプExpression Dataset [hgu133plus2]
288. IHWpaper
Reproduce figures in IHW paper
IHW紙に図を再現する
289. imcdatasets
Collection of publicly available imaging mass cytometry (IMC) datasets
公開されているイメージングマスサイトメトリー(IMC)データセットのコレクション
290. MAQCsubset
Experimental Data Package: MAQCsubset
実験データパッケージ:MAQCsubset
291. MIGSAdata
MIGSA vignette data
MIGSAビネットデータ
292. miRNATarget
gene target tabale of miRNA for human/mouse used for MiRaGE package
MiRaGEパッケージに使用されるヒト/マウス用のmiRNAの遺伝子標的一覧
293. MMAPPR2data
Sample Data for MMAPPR2
MMAPPR2のサンプルデータ
294. prebsdata
Data for ‘prebs’ package
‘prebs’パッケージのデータ
295. pumadata
Various data sets for use with the puma package
pumaパッケージで使用するためのさまざまなデータセット
296. rRDPData
Database for the Default RDP Classifier
デフォルトのRDP分類子用のデータベース
297. SNPhoodData
Additional and more complex example data for the SNPhood package
SNPhoodパッケージの追加のより複雑な例のデータ
298. stjudem
Microarray Data from Yeoh et al. in MACAT format
Yeohらからのマイクロアレイデータ。 MACATフォーマットで
299. TargetSearchData
Example GC-MS data for TargetSearch Package
TargetSearchパッケージのGC-MSデータの例
300. AshkenazimSonChr21
Annotated variants on the chromosome 21, human genome 19, Ashkenazim Trio son sample
染色体21、ヒトゲノム19、Ashkenazim Trio sonサンプル上の注釈付き変異体
301. ccTutorial
Data package for ChIP-chip tutorial
ChIPチップチュートリアルのデータパッケージ
302. cnvGSAdata
Data used in the vignette of the cnvGSA package
cnvGSAパッケージのビネットで使用されているデータ
303. CONFESSdata
Example dataset for CONFESS package
CONFESSパッケージ用のデータセットの例
304. curatedAdipoRNA
A Curated RNA-Seq Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1)
MDI誘導分化脂肪細胞(3T3-L1)のキュレーションRNA-Seqデータセット
305. DmelSGI
Experimental data and documented source code for the paper “A Map of Directional Genetic Interactions in a Metazoan Cell”
論文「後生動物細胞における指向性遺伝的相互作用の地図」の実験データと文書化されたソースコード
306. ffpeExampleData
Illumina DASL example microarray data
Illumina DASLサンプルマイクロアレイデータ
307. FieldEffectCrc
Tumor, tumor-adjacent normal, and healthy colorectal transcriptomes as SummarizedExperiment objects
SummarizedExperimentオブジェクトとしての腫瘍、腫瘍に隣接した正常な大腸直腸トランスクリプトーム、および健康な大腸直腸トランスクリプトーム
308. LiebermanAidenHiC2009
Selected data from the HiC paper of E. Lieberman-Aiden et al. in Science (2009)
E. Lieberman-AidenらのHiC論文から選択されたデータ。科学の中で(2009)
309. LRcellTypeMarkers
Marker gene information for LRcell R Bioconductor package
LRcell R Bioconductorパッケージのマーカー遺伝子情報
310. microRNAome
SummarizedExperiment for the microRNAome project
microRNAomeプロジェクトの要約実験
311. MMDiffBamSubset
Example ChIP-Seq data for the MMDiff package
MMDiffパッケージのChIP-Seqデータの例
312. mvoutData
affy and illumina raw data for assessing outlier detector performance
異常値検出器の性能を評価するためのAffyおよびIlluminaの生データ
313. plasFIA
FIA-HRMS plasma dataset
FIA-HRMSプラズマデータセット
314. ptairData
PTR-TOF-MS volatolomics raw datasets from exhaled air and cell culture headspace
呼気および細胞培養ヘッドスペースからのPTR-TOF-MS volatolomics生データセット
315. qPLEXdata
Data accompanying qPLEXanalyzer package
qPLEXanalyzerパッケージに付随するデータ
316. scTHI.data
The package contains examples of single cell data used in vignettes and examples of the scTHI package; data contain both tumor cells and immune cells from public dataset of glioma
このパッケージには、ビネットで使用された単細胞データの例とscTHIパッケージの例が含まれています;データには、グリオーマの公開データセットからの腫瘍細胞と免疫細胞の両方が含まれています
317. topdownrdata
Example Files for the topdownr R Package
topdownr Rパッケージのサンプルファイル
318. vulcandata
VirtUaL ChIP-Seq data Analysis using Networks, dummy dataset
ネットワークを用いたVirtUaL ChIP-Seqデータ解析、ダミーデータセット
319. BioImageDbs
Bio- and biomedical imaging dataset for machine learning and deep learning (for ExperimentHub)
機械学習や深層学習のためのバイオ・生物医学画像データセット(ExperimentHub用
320. CLLmethylation
Methylation data of primary CLL samples in PACE project
PACEプロジェクトにおける主要CLLサンプルのメチル化データ
321. easierData
easier internal data and exemplary dataset from IMvigor210CoreBiologies package
IMvigor210CoreBiologiesパッケージの内部データと例示データセットをより簡単にする
322. gpaExample
Example data for the GPA package (Genetic analysis incorporating Pleiotropy and Annotation)
GPAパッケージ(Pleiotropyとアノテーションを組み込んだ遺伝学的解析)のデータ例
323. GSBenchMark
Gene Set Benchmark
遺伝子セットベンチマーク
324. kidpack
DKFZ kidney package
DKFZ腎臓パッケージ
325. mammaPrintData
RGLists from the Glas and Buyse breast cancer studies
GlasとBuyseの乳がん研究のRGLists
326. mcsurvdata
Meta cohort survival data
メタコホート生存データ
327. MEEBOdata
MEEBO set and MEEBO controls.
MEEBOセットとMEEBOコントロール。
328. MSstatsBioData
Datasets of published biological studies with DDA or SRM experiments
DDAまたはSRM実験による公開された生物学的研究のデータセット
329. RNAinteractMAPK
Mapping of Signalling Networks through Synthetic Genetic Interaction Analysis by RNAi
RNAiによる合成遺伝的相互作用解析によるシグナリングネットワークのマッピング
330. SimBenchData
SimBenchData: a collection of 35 single-cell RNA-seq data covering a wide range of data characteristics
SimBenchData: 幅広いデータ特性を網羅した35個のシングルセルRNA-seqデータのコレクション
331. SNAData
Social Networks Analysis Data Examples
ソーシャルネットワーク分析データの例
332. spqnData
Data for the spqn package
spqn パッケージのデータ
333. TabulaMurisSenisData
Bulk and single-cell RNA-seq data from the Tabula Muris Senis project
Tabula Muris SenisプロジェクトのバルクおよびシングルセルのRNA-seqデータ
334. curatedAdipoChIP
A Curated ChIP-Seq Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1)
MDI誘導分化脂肪細胞(3T3-L1)のキュレーションされたChIP-Seqデータセット
335. davidTiling
Data and analysis scripts for David, Huber et al. yeast tiling array paper
David、Huber他のためのデータと分析スクリプト。イーストタイリングアレイ紙
336. DeSousa2013
Poor prognosis colon cancer is defined by a molecularly distinct subtype and precursor lesion
予後不良の大腸癌は分子的に異なるサブタイプおよび前駆病変によって定義される
337. EatonEtAlChIPseq
ChIP-seq data of ORC-binding sites in Yeast excerpted from Eaton et al. 2010
酵母のORC結合部位のChIP-seqデータは、Eatonらから引用。 2010年
338. msqc1
Sigma mix MSQC1 data
シグマミックスMSQC1データ
339. NestLink
NestLink an R data package to guide through Engineered Peptide Barcodes for In-Depth Analyzes of Binding Protein Ensembles
結合タンパク質アンサンブルの詳細な分析のための人工ペプチドバーコードをガイドするためのRデータパッケージのNestLink
340. oct4
Conditional knockdown of OCT4 in mouse ESCs
マウスESCにおけるOCT4の条件付きノックダウン
341. plotgardenerData
Datasets and test data files for the plotgardener package
plotgardenerパッケージのデータセットとテストデータファイル
342. prostateCancerCamcap
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
343. seventyGeneData
ExpressionSets from the van’t Veer and Van de Vijver breast cancer studies
van’t VeerとVan de Vijverの乳がん研究のExpressionSets
344. SingleMoleculeFootprintingData
Data supporting the SingleMoleculeFootprinting pkg
SingleMoleculeFootprinting pkgのサポートデータ
345. XhybCasneuf
EBI/PSB cross-hybridisation study package
EBI / PSBクロスハイブリダイゼーション研究パッケージ
346. bronchialIL13
time course experiment involving il13
il13を含む時間経過実験
347. dressCheck
data and software for checking Dressman JCO 25(5) 2007
Dressman JCO 25(5)2007をチェックするためのデータとソフトウェア
348. fabiaData
Data sets for FABIA (Factor Analysis for Bicluster Acquisition)
FABIA(バイクラスター取得のための因子分析)のデータセット
349. gaschYHS
ExpressionSet for response of yeast to heat shock and other environmental stresses
熱ショックおよび他の環境ストレスに対する酵母の応答のためのExpressionSet
350. GIGSEAdata
Gene set collections for the GIGSEA package
GIGSEAパッケージの遺伝子セットコレクション
351. ListerEtAlBSseq
BS-seq data of H1 and IMR90 cell line excerpted from Lister et al. 2009
H1細胞株およびIMR90細胞株のBS配列データは、Lister et al。 2009年
352. MACSdata
Test datasets for the MACSr package
MACSrパッケージのテストデータセット
353. MethylSeqData
Collection of Public DNA Methylation Sequencing Datasets
公的DNAメチル化塩基配列決定データセットの収集
354. NxtIRFdata
Data for NxtIRF
NxtIRFのデータ
355. PhyloProfileData
Data package for phylogenetic profile analysis using PhyloProfile tool
PhyloProfileツールを使用した系統プロファイル分析用のデータパッケージ
356. rheumaticConditionWOLLBOLD
Normalized gene expression dataset published by Wollbold et al. [2009] (WOLLBOLD).
Wollboldらによって公開された正規化遺伝子発現データセット。 [2009](WOLLBOLD)
357. RnBeads.rn5
RnBeads.rn5
RnBeads.rn5
358. SVM2CRMdata
An example dataset for use with the SVM2CRM package
SVM2CRMパッケージで使用するサンプルデータセット
359. TCGAcrcmRNA
TCGA CRC 450 mRNA dataset
TCGA CRC 450 mRNAデータセット
360. TimerQuant
Timer Quantification
タイマー定量化
361. tinesath1cdf
tinesath1cdf
tinesath1cdf
362. BeadSorted.Saliva.EPIC
Illumina EPIC data on BeadSorted adult saliva cells
ビーズソーティングされた成人唾液細胞のIllumina EPICデータ
363. CRCL18
CRC cell line dataset
CRC細胞株データセット
364. curatedAdipoArray
A Curated Microarrays Dataset of MDI-induced Differentiated Adipocytes (3T3-L1) Under Genetic and Pharmacological Perturbations
MDI誘導分化脂肪細胞(3T3-L1)の遺伝的および薬理学的摂動下でのキュレーションマイクロアレイデータセット
365. furrowSeg
Furrow Segmentation
溝セグメンテーション
366. HighlyReplicatedRNASeq
Collection of Bulk RNA-Seq Experiments With Many Replicates
多数のレプリケートを用いたバルクRNA-Seq実験集
367. HIVcDNAvantWout03
T cell line infections with HIV-1 LAI (BRU)
HIV-1 LAI(BRU)によるT細胞株感染
368. Iyer517
exprSets for Iyer, Eisen et all 1999 Science paper
Iyer、Eisen、その他1999年版全文
369. MAQCsubsetILM
MAQC data subset for the Illumina platform
Illuminaプラットフォーム用のMAQCデータサブセット
370. NCIgraphData
Data for the NCIgraph software package
NCIgraphソフトウェアパッケージのデータ
371. Neve2006
expression and CGH data on breast cancer cell lines
乳癌細胞株の発現とCGHデータ
372. pd.atdschip.tiling
Platform Design Info for Affymetrix Atdschip_tiling
Affymetrix Atdschip_tilingのプラットフォーム設計情報
373. preciseTADhub
Pre-trained random forest models obtained using preciseTAD
preciseTADを用いて事前に学習させたランダムフォレストモデル
374. prostateCancerGrasso
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
375. RRBSdata
An RRBS data set with 12 samples and 10,000 simulated DMRs
12個のサンプルと10,000個の模擬DMRを含むRRBSデータセット
376. Single.mTEC.Transcriptomes
Single Cell Transcriptome Data and Analysis of Mouse mTEC cells
マウスmTEC細胞の単細胞トランスクリプトームデータおよび分析
377. VariantToolsData
Data for the VariantTools tutorial
VariantToolsチュートリアルのデータ
378. DonaPLLP2013
Supplementary data package for Dona et al. (2013) containing example images and tables
Donaらのための補足データパッケージ。画像と表の例を含む(2013)
379. DvDdata
Drug versus Disease Data
薬物対疾病データ
380. hapmap100khind
Sample data – Hapmap 100K HIND Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 100K HIND Affymetrix
381. hapmap500knsp
Sample data – Hapmap 500K NSP Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 500K NSP Affymetrix
382. hapmap500ksty
Sample data – Hapmap 500K STY Affymetrix
サンプルデータ – Hapmap 500K STY Affymetrix
383. hgu133abarcodevecs
hgu133a data for barcode
バーコードのhgu133aデータ
384. hgu133plus2barcodevecs
hgu133plus2 data for barcode
バーコードのhgu133plus2データ
385. mouse4302barcodevecs
mouse4302 data for barcode
バーコードのmouse4302データ
386. MUGAExampleData
Example {M}ouse {U}niversal {G}enotyping {A}rray data for genome reconstruction and quantitative trait locus mapping.
ゲノムの再構築および量的形質遺伝子座マッピングのための{A}配列データ{A}配列解析{M}または{U}ユニバーサル{G}。
387. prostateCancerStockholm
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
388. prostateCancerTaylor
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
389. prostateCancerVarambally
Prostate Cancer Data
前立腺がんデータ
390. scanMiRData
miRNA Affinity models for the scanMiR package
scanMiRパッケージ用miRNAアフィニティモデル
391. serumStimulation
serumStimulation is a data package which is used by examples in package pcaGoPromoter
bloodStimulationは、パッケージpcaGoPromoterの例で使用されるデータパッケージです。
392. tinesath1probe
Probe sequence data for microarrays of type tinesath1
タイプtinesath1のマイクロアレイ用のプローブシーケンスデータ
393. hgu2beta7
A data package containing annotation data for hgu2beta7
hgu2beta7のアノテーションデータを含むデータパッケージ
394. ObMiTi
Ob/ob Mice Data on Normal and High Fat Diet
通常の食事と高脂肪食を摂取したOb/obマウスのデータ
395. SomatiCAData
An example cancer whole genome sequencing data for the SomatiCA package
SomatiCAパッケージのための癌全ゲノム配列決定データの例
396. TCGAcrcmiRNA
TCGA CRC 450 miRNA dataset
TCGA CRC 450 miRNAデータセット
397. yeastGSData
Yeast Gold Standard Data
酵母ゴールドスタンダードデータ
398. RLHub
An ExperimentHub package for accessing processed RLSuite data sets
RLSuiteで処理されたデータセットにアクセスするためのExperimentHubパッケージ
399. GSE103322
GEO accession data GSE103322 as a SingleCellExperiment
GEO accession data GSE103322 as a SingleCellExperiment
400. nullrangesData
ExperimentHub datasets for the nullranges package
nullrangesパッケージのExperimentHubデータセット
401. curatedTBData
Curation of existing 49 tuberculosis transcriptomic studies
既存の49結核トランスクリプトーム研究のキュレーション
402. GSE159526
Placental cell DNA methylation data from GEO accession GSE159526
GEOアクセッションGSE159526からの胎盤細胞のDNAメチル化データ
403. crisprScoreData
Pre-trained models for the crisprScore package
crisprScoreパッケージのための事前学習済みモデル
404. scATAC.Explorer
A Collection of Single-cell ATAC Sequencing Datasets and Corresponding Metadata
シングルセルATACシーケンシングデータセットと対応するメタデータのコレクション
405. spatialDmelxsim
Spatial allelic expression counts for fly cross embryo
ハエの交配胚の空間的対立遺伝子発現カウント
406. tuberculosis
Tuberculosis Gene Expression Data for Machine Learning
機械学習のための結核遺伝子発現データ
407. healthyControlsPresenceChecker
Dowloads A Gene Expression Dataset From GEO And Checks If It Contains Data Of Healthy Controls Or Not
GEOから遺伝子発現データセットをダウンロードし、健康なコントロールのデータが含まれているかどうかをチェックするツール
408. xcoredata
data package for xcore
xcore用データパッケージ
409. epimutacionsData
Data for epimutacions package
epimutacionsパッケージのデータ
410. VectraPolarisData
Vectra Polaris and Vectra 3 multiplex single-cell imaging data
Vectra PolarisおよびVectra 3マルチプレックスシングルセルイメージングデータ
909. SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38
SNP locations and alleles for Homo sapiens (dbSNP Human Build 155)
ホモサピエンス(dbSNP Human Build 155)のSNPの位置とアレル。