CRAN Task View: Analysis of Pharmacokinetic Dataの英語での説明文をGoogle翻訳を使用させていただき機械的に翻訳したものを掲載した。

Maintainer: Bill Denney
Contact: wdenney at humanpredictions.com
Version: 2017-04-04
URL: https://CRAN.R-project.org/view=Pharmacokinetics

薬物動態(PK)データの分析は、投薬計画を決定するための濃度時間曲線によって示されるように、投薬計画と薬物に対する身体の曝露との間の関係を定義することに関係します。 PKデータを分析するには、非コンパートメント分析(NCA)、モデリング(通常はコンパートメント分析を使用)、レポーティング(通常はNCA)の3つのカテゴリがCRAN内にあります。 NCAは、身体を通しての薬物の分布速度を最小限に仮定して、PKの記述方法として使用されます。 NCAは、典型的には、同じおよび連続した日に被験者あたり多くのサンプルを含む臨床研究における薬物のPKを記述するために使用されます。 NCAパッケージは次のとおりです。

  • ncappc
    • NCAメトリクスを使用して、母集団PKモデルに対して従来のNCAおよびシミュレーションベースの事後予測検査を実行します。 これは、モデルに適合したソースまたはシミュレートされたソースからのデータの要約を対象としています。
  • NonCompart
    • NCAの基本的な計算機能を提供します。
  • PK
    • 非コンパートメント理論を用いて薬物動態パラメータの推定を可能にする。 完全サンプリングと疎サンプリングの両方の設計が実装されています。 このパッケージには、仮説検定の方法と、優越性と等価性に関する信頼区間があります。
  • PKNCA
    • 標準的なNCAパラメータを計算し、観察された臨床データを取り込み、研究報告書と規制提出の準備が整った要約を提供するという目的で要約します。

PKデータのモデリングは、典型的には、薬物が静脈内(IV)または血管外(しばしば経口または皮下SC)用量のいずれかで体内に入ると想定する区画法を使用する。 下記のパッケージは、PKモデリングに特に関心のあるパッケージに限定され、PKデータに使用できるモデリングをサポートする(多くの)パッケージには使用できません。 PKモデリングとシミュレーションパッケージは次のとおりです。

  • cpk
    • ポイントオブケアにおける投与計画の設計と修正のための簡略化された臨床薬物動態学的機能を提供します。
  • dfpk
    • 第1相臨床試験での用量測定のためのPK測定を含む統計的方法を提供します。
  • mrgsolve
    • 医薬品開発で一般的に採用されている階層的、常微分方程式(ODE)ベースのモデルからのシミュレーションを容易にします。
  • nmw
    • NONMEMのアルゴリズムを理解するパッケージです。
  • PKgraph
    • NONMEM、Monolix、SAS、およびRを含む様々なモデルフィッティングソフトウェアからの集団薬物動態モデル診断のためのグラフィカルユーザーインターフェイスを提供します。
  • PKPDmodels
    • 一般的な薬物動態/薬力学モデルおよびその勾配を評価する機能を提供します。
  • scaRabee
    • 個人および人口レベルでの薬物動態学的薬力学モデルのシミュレーションおよび最適化のための枠組みを提供する。

結果のコミュニケーションは、実際に分析を完了することと同じくらい重要です。 多くのユーザーが現在rmarkdownとknitrを使用して一般的なレポートを作成していますが、PKデータを報告するために重要なパッケージの機能は次のとおりです。

  • ncar
    • rtfとpdf出力を生成するレポート作成者にNCAを提供します。
  • pkr
    • CDISCおよびレビューアのための他の薬物動態学的機能に準拠するNCAデータセットを生成します。
  • PKreport
    • ユーザーが格子やggplot2に基づいて図やグラフの生成、保存、検索、修正を行うアーカイブ指向の管理ツールを使用して、データやモデルを視覚化するための自動パイプラインを提供します。

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