CRAN Task View: Analysis of Spatial Dataの英語での説明文をGoogle翻訳を使用させていただき機械的に翻訳したものを掲載した。

Maintainer: Roger Bivand
Contact: Roger.Bivand at nhh.no
Version: 2016-11-27

Base Rは、読み取りのために使用することができる多数の機能、ビジュアルに、空間データを分析することを含む。このビューの焦点は、観測は地理的な位置を識別することができ、場所を注意して記録されている場合、これらの位置に関する追加情報を検索することができるここで、”地理的”の空間データ上にある。基本R関数が寄与したパッケージによって補完されて、そのうちのいくつかはCRANにあり、その他はまだ開発中である。1つのアクティブな場所は、そのproject treeの「空間データと統計」のプロジェクトを一覧表示するR-Forgeです。R-空間パッケージの情報は、特にspは、可視化のギャラリーを含め、R-Forge rspatialプロジェクトのwebsiteに掲載されます。sp の積極的な開発は、Github の上で継続しています。

貢献したパッケージには、二つの広い分野に取り組む。R内外に空間データを移動し、Rに空間データを分析する。

R-SIG-Geoメーリングリストに助けを得て、データにアクセスし、それを分析することの両方に関する質問を議論するために開始するには良い場所です。メーリングリストは、関連科目に関する情報を検索するのに適した場所です。コースの詳細については、this blog の「イベント」タブで見ることができます。

貢献チュートリアルと紹介の数があります。最近のものは、ロビン・ラブレイスとジェームズチェシャーによるIntroduction to visualising spatial data in Rです。

このビューのパッケージは、大きく以下のトピックに構造化することができる。あなたには、いくつかのパッケージがリストにないと思われる場合、私に知らせてください。

  • 空間データ用のクラス:
    • 空間データのインポートと使用してパッケージの多くは、それを可視化するためのデータと機能を格納するオブジェクトを含める必要がありましたので、イニシアチブは、空間データの共有クラスやプロット関数を構築するために進行中である。
    • spパッケージはR Newsでノートで説明されている。
    • sf という新しいパッケージがCRAN上にあり、Rのシンプルな機能を提供するGitHub 上で積極的に開発されています。このパッケージの開発はRコンソーシアムによってサポートされています。
    • ベクトルデータのシンプルな機能へのアクセスを提供し、最新のsp の部分の実装です。
    • 他の多くのパッケージはrgdalmaptoolsを含め、これらのクラスに依存するようになりました。
    • rgeosパッケージには、GEOSを使用してspオブジェクトのための機能をトポロジにインターフェースを提供します。
    • stplanr は、Rでルーティング分析をするために使用することができ、spigraph で定義されたオブジェクトに基づいて、「SpatialLinesネットワーク」クラスを提供します。
    • 別のネットワークパッケージがshp2graph です。
    • cleangeo は、トポロジエラーとジオメトリ有効性の問題の報告と処理を容易にし、空間オブジェクトを検査するのに使用しても良いかもしれません。 それは空間データ処理を行う際に問題を抱えている可能性を排除(少なくとも低減する)し、すべてのジオメトリの問題を修正するジオメトリクリーナーを提供することを要求します。
    • rasterパッケージは、分析しようとする大規模なオブジェクトを許可し、ラスターとベクターデータの両方に利用できる分析ツールを拡張し、大規模なラスタへのアクセスを仮想化し、空間データクラスの主な拡張機能です。
    • rasterVisで使用される、それはまた、強化された視覚化と相互作用を提供することができます。
    • spatial.toolsパッケージはラスタで使用するための並列処理エンジンを含むrasterパッケージのコア機能を強化するためのものな空間関数が含まれています。
    • micromapパッケージには、ggplot2使用してリンクmicromapsを提供しています。
    • recmap パッケージは、例えば集団について反映した四角形のサイズで長方形の統計地図を提供します。
    • statebins は、アメリカへの単純なビニングアプローチを提供します。
    • spacetimeパッケージには、時空間データのためのspで定義された共有クラス(Spatio-Temporal Data in Rを参照してください)を拡張します。
    • Grid2Polygonsは、クラスSpatialGridDataFrameからSpatialPolygonsDataFrameに空間オブジェクトに変換します。これらの問題のいくつかの代替的なアプローチは、PBSmappingパッケージに実装されています。
    • PBSmodellingは、モデリングのサポートを提供します。
    • また、GEOmapは地質学者のニーズを満たすように指示マッピング機能を提供し、geomapdataパッケージを使用します。
  • 空間データの処理:
    • パッケージの数は、spクラスを使用して書かれています。
    • rasterパッケージは多くはR他にGISを使用せずに空間データを用いて行われることを可能にする多くのGIS方法を紹介する。これは、地理的なグリッド上の距離とルートの計算を提供するgdistanceによって補完することができる。
    • geosphereは、地理的座標空間データに対して行われるべき距離と面積の計算を可能にする。
    • dggridR パッケージは、すべてのビンが同じ面積を持つという問題を克服するために、六角形、三角形、およびダイヤモンドを使用して、個別のグローバルグリッドを扱うためのDGGRIDへのインタフェースを提供します。
    • spsurveyパッケージには、サンプリング機能を提供しています。
    • tripパッケージには、動物の追跡のための空間データのアクセスと操作を可能にするために、spクラスを拡張します。
    • hdecoパッケージには、カテゴリマップ比較のためにエントロピーの階層分解を提供しています。
    • GeoXpパッケージは、インタラクティブなグラフィカル探索空間データ分析を可能にする。
    • spcosaは、コンパクトな地理的地層からの空間のカバレッジサンプリングとランダムサンプリングを提供しています。
    • magclass は、対応する関数とメソッド(変換、基本的な計算と基本的なデータ操作)と一緒に時空間データを扱う増加した相互運用性のためのデータクラスを提供しています。 クラスは、それ用にビルドされるツールの発展と相互運用性を促進するために、空間的、時間的および他の次元が区別されます。 その他の機能は、データと内部整合性検査の名前ベースのアドレス指定です(例えば、計算に右データ順序のチェック)。
    • パッケージ(UScensus2000cdpUScensus2000tract)のUScensus2000スイートは2000年の米国国勢調査のデータを使用すると、より便利になります。重要なデータセットは、ゲリーの「フランスの道徳統計」は、多変量と空間分析の統合に貢献して設計されたデータやマップと例を提供しGuerryパッケージで利用できるようになっています。
    • marmapパッケージは、ダウンロードしてプロットし、Rに海底地形や地形データを操作するために設計されています。
    • marmapは、NOAAが主催するETOPO1の海底地形と地形データベースに問い合わせASCII形式の簡単な緯度経度深さのデータを使用し、(PLOS紙を参照してください)出版品質海底地形図を作成するために研究で使用可能な、高度なプロットツールを利用することができます。
    • 近代国家の境界は国の名前やコードによって参照される表形式のデータを結合し、マップするための関数と一緒にrworldmapで2解像度で提供されています。
    • Chloroplethバブルマップはサポートされており、ユーザーに動作するように一般的な機能は、(A New R package for Mapping Global Dataを参照)マップを供給されている。
    • より高解像度の国境は、リンクされたパッケージrworldxtraから入手できます。
    • 歴史的な国の境界(1946から2012)は、(Mapping and Measuring Country Shapesを参照)は、距離行列を計算するための機能と一緒にcshapesパッケージから取得することができる。
    • 付属のJSS paperlandsatパッケージはリモートセンシングデータの補正ツールを探索し、開発するためのツールを提供しています。
    • taRifxは実用性と利便性の関数の集合、およびいくつかの興味深い空間関数である。
    • gdalUtils パッケージには、地理空間データ抽象ライブラリ(GDAL)ユーティリティのラッパーを提供します。
    • rOpenSciblog entry では、GeoJSONとWKTデータを読み込むためのGeoJSONを中心としたアプローチが説明されています。
    • GeoJSONは、rgeos によるWKTとrgdal を使用して書込みおよび読取りが可能です。
    • エントリは、他の間でgeojsongeojsoniogeoaxe 、およびlawn が一覧表示されます。
    • rgbif パッケージは、GBIF(Global Biodiversity Information Facility)データにアクセスするために使用されます。
    • geoaxe は、「地理空間」オブジェクトを部分に分割することができます。
    • lawn パッケージは、「地理空間」分析のための「Turfjs」のクライアントです。
  • 読み取りと空間データの書き込み – rgdal
    • マップは、ベクトルベースまたはラスターベースのかもしれません。
    • rgdalパッケージはGDALでサポートされているラスタ形式とOGRでサポートされているベクトル形式へのバインディングを提供します。これは、サポートされている形式のラスタファイルを書き込むための機能が含まれています。パッケージには、ベクトルオブジェクトのためのPROJ.4投影をサポートします(this siteは投影の検索可能なオンラインPROJ.4表現を提供)を提供します。
    • spオブジェクトのアフィンと相似変換はvec2dtransfパッケージの機能を使用して作製することができる。
    • rgdalのWindowsとMac OSX CRANバイナリが可能なデータソースドライバのサブセットが含まれる;他の人が必要な場合は、他の変換ユーティリティを使用するか、必要なドライバをGDALのバージョンに対して、ソースからインストールしてください。
    • rgeosパッケージには、読書とよく知られているテキスト(WKT)のジオメトリを記述するための機能を提供し、wkbパッケージが読んで、よく知られたバイナリー(WKB)のジオメトリを記述するための機能を提供します。
  • 空間データの読み込みと書き込み 他のパッケージ:
    • CRAN上のベクトルデータにアクセスするための他のパッケージがいくつかあります。
    • mapdatamapproj付き)mapsは、Sのような地理的なデータベースの同じ種類へのアクセスを提供します。
    • RArcInfoはArcInfo v.7バイナリファイルと*.e00ファイルを読み取ることを可能にし、maptoolsshapefilesは、ArcGIS/ArcViewのシェープファイルの読み書きする。
    • NetCDFファイルに対して、ncdf4 またはRNetCDF を使用することができる。
    • maptoolsパッケージには、WinBUGS、モンドリアン、およびスタータにおけるTMAPコマンドによって読み込まれるマップの多角形のファイルを記述するためのヘルパー関数が用意されています。
    • また、mapsのデータベースおよびSPクラスに加えて、PBSmappingspatstatとspクラス間のインタフェース機能を提供します。GSHHS海岸線データベースへのインターフェースもあります。
    • 可視化のため、RColorBrewerパッケージで提供されているカラーパレットは、非常に有用であり、Rで提供される修飾またはcolorRampPalette機能を使用して拡張することができる。
    • classIntパッケージには、テーマ別の地図作成のためのクラス間隔を選択するための機能を提供します。
    • tmapパッケージには、必要に応じて文法グラフィックスの構文を使用して、テーマ・マッピングのための現代的な基礎を提供します。これは、カスタム・グリッド・グラフィックス・プラットフォームを持っているので、それはggplot2で使用するジオメトリを強化する必要性がなくなります。
    • mapview のパッケージは、通常、Webマッピングベースに、インタラクティブに空間オブジェクトを表示する方法を提供します。
    • quickmapr パッケージは、「sp」および「ラスタ」オブジェクトを視覚化するための簡単な方法を提供し、パンニング、識別し、空間オブジェクトの標識、基本的なズームを可能にし、データが地理座標であることを必要としません。
    • cartography パッケージには、比例シンボル、choropleth、類型、フローや不連続などの様々なカートグラフィック表現を可能にします。
    • mapmisc パッケージには、地図投影のサポートにより、Rに見栄えの良いマップを生成するためのツールの最小限の軽量セットです。
    • gmtパッケージはGMTマップ作りのソフトウェアとRとの間の単純なインタフェースを提供します。
    • geonameswww.geonames.orgサービスへのインタフェースです。ユーザーが他のディスプレイの後ろのマップ背景を配置したい場合には、Googleマップ(TM)をアクセスするためのRgoogleMapsパッケージが有用である可能性がある。
    • ggmapはGoogleマップとOpenStreetMapの持つ空間的な可視化のために使用することができる。
    • ggsn は、そのようなマップのNorth ArrowとScaleを提供します。
    • plotGoogleMapsパッケージには、WebブラウザでGoogleマップの空間と時空間オブジェクトの視覚化のための方法を提供する。
    • plotKMLは、Google Earthでの空間と時空間オブジェクトの視覚化のための方法を提供するパッケージです。
    • 更なる選択肢は、異なるソースからベクトルデータファイルとオンラインマップタイルを結合するための基本的なウェブ・マッピング機能を提供するleafletRある。
    • OpenStreetMapは地図のラスタ画像を開くためのアクセス権を与え、osmarは、異なるソースからのOpenStreetMapのデータにアクセスするための共通のR方式でデータを操作するために、既存のRパッケージによって提供される利用可能なインフラストラクチャにデータを変換するためのインフラストラクチャを提供します。
    • rpostgis パッケージは、 「RPostgreSQL」パッケージにRを 「PostGIS」対応データベースとインターフェースするための追加機能と、一般的な 「PostgreSQL」クエリーに対する便利なラッパーを提供します。
    • postGIStools パッケージは、PostgreSQLからジオメトリと ‘hstore’データ型を標準Rオブジェクトに変換する機能と、Rデータフレーム(空間データフレームを含む)のPostgreSQLへのインポートを簡素化する機能を提供します。
    • 主要なオープンソースGIS、GRASSのバージョン6.*との統合は、データを交換するためrgdalを使用して、CRANパッケージspgrass6で提供されています。
    • GRASS7*の場合は、rgrass7を使用します。
    • RPyGeoは、ArcGIS GeoProcessorへのPythonのアクセスのラッパーであり、RSAGAはSAGAコマンドの似たシェルベースのラッパーです。
    • RQGIS パッケージは、RとQGISとの間のインタフェースを確立します。すなわち、ユーザは、RコンソールからQGIS機能にアクセスすることができます。 これは、QGIS Python APIをコマンドライン経由で使用することで実現します。 別のR / QGISインテグレーションのthis thread にも注意してください。
  • 点パターン分析:
    • spatialパッケージは、baseRに同梱され、推奨パッケージであり、その著者、教授リプリーによるアラビアチャノキの実装を含む、いくつかのコア機能が含まれています。
    • また、spatstatは、関心領域(単数または複数)を画定する自由を可能にし、マークされたプロセスおよび空間的共変量に拡張を行う。その強みは、モデルフィッティングとシミュレーションであり、それが便利なhomepageを持っています。これは、点間の相互作用を不均一な点過程のモデルを適合することを可能にする唯一のパッケージです。
    • spatgraphsパッケージには、空間点パターン分析で使用されるグラフ、グラフの可視化、グラフベースの要約を提供します。
    • splancsパッケージは、点データは、関心のある多角形領域内で分析することができ、および2Dカーネル密度を含む多くの方法を包含する。
    • smacpod パッケージは、ケースコントロール点データを解析するためのさまざまな統計的方法を提供します。 近い使用方法は、Waller and Gotway(2004)の公衆衛生データの応用空間統計の第6章の方法に準じる。
    • ecespaはECESPA/AEETの空間生態に関する本の中で使用される空間点パターン分析のためのラッパー、機能やデータを提供します。
    • ash中のグリッド上ビニングポイントの機能も重要である可能性がある。
    • adsパッケージは、リプリーのK関数から導出した一次および二次マルチスケール分析を実行する。
    • aspaceパッケージには、空間点パターンからcentrographic statistcsと計算幾何学的構造を推定するための関数の集まりである。
    • spatialkernelは、エッジ補正されたカーネル密度推定および多変量空間点過程データのバイナリカーネル回帰推定を提供する。
    • DSpatは、距離データをサンプリングするための空間的なモデリングのための機能が含まれており、spatialsegregationはマルチタイプの空間点パターンの分離策を提供します。
    • GriegSmithは2次元空間データ上のグリーグ・スミスメソッドを使用しています。
    • dbmssパッケージには、古典的なもの(リプリーズKなど)と空間経済学者によって使用される、より最近のもの(DurantonとOvermanのKd、MarconとPuechのM)など、距離の空間的な統計関数のフルセットの簡単な計算を可能にする。これは、コアの計算のためにspatstatに依存している。
    • latticeDensityはバリーと不規則な境界や穴のある2次元の地域でのポイント・プロセスを占めるマッキンタイア、格子ベースの密度推定量を計算する関数が含まれています。
  • 地球統計学:
    • geoRgeoRglmは、モデルベースの地球統計学のための機能が含まれていながら、gstatはパッケージには、また、大規模データセットのために、単変量および多変量地球統計学のためのさまざまな機能を提供しています。
    • バリオグラム診断はvardiagを用いて実施することができる。
    • gstatを使用して自動化された補間はautomapで提供されています。
    • パッケージのこのファミリーは、スパースガウス過程のクリギングを投影実装し、自動化補間psgpのための手続きをintamapによって補完されている。
    • 機能が同じような幅広いfieldsパッケージ内に発見される。
    • spatialパッケージは、ベースRに同梱され、いくつかのコア機能が含まれている。
    • spBayesパッケージには、MCMCでガウス単変量および多変量モデルに適合します。
    • rampsは、さまざまなベイズ地球統計モデリングパッケージである。
    • geosptパッケージは、予測と相互検証を含むいくつかの地球統計とラジアル基底関数が含まれています。しかも地球統計モデリングに基づいて、最適な空間サンプリングネットワークの設計のための関数が含まれています。
    • geostatsp パッケージには、RasterおよびSpatialPointsオブジェクトを使用した地理統計モデリング機能が用意されています。 非ガウスモデルはINLAを使用してフィットし、ガウス統計モデルは最尤推定を使用します。
    • RandomFieldsパッケージは、確率場のシミュレーションと解析のための機能を提供し、バリオグラムモデルの説明はgeoRgstatはこのパッケージの間で渡すことができます。
    • SpatialExtremesは、RandomFieldsを使用してモデル化した空間の極端のためのいくつかのアプローチが提案されている。
    • また、CompRandFldconstrainedKriginggeosptは地理統計モデリングの代替アプローチを提供する。
    • spTimerパッケージは、[1]ベイズガウス過程(GP)モデル、[2]ベイジアン自己回帰(AR)モデル、[3]ARモデルに基づくベイズガウス予測プロセス(GPP)を用いた大量の時空間データを時間的に予測し、空間的に予測し、フィットすることができる。
    • rtopパッケージには、行政単位からの流出量に関するデータやデータなどの不規則な空間をサポートするデータの地理統計補間のための機能が用意されています。
    • georobパッケージには、堅牢で、ガウス制限付き最尤による空間的に相関エラーが発生し、クロス検証のためとログデータを変換したクリギング予測の公平な逆変換のためのユーティリティ関数と一緒に、堅牢かつ慣習ポイントとブロッククリギング予測を計算するためのフィッティング線形モデルのための機能を提供します。
    • SpatialToolsパッケージは、クリギングに重点を置いており、予測とシミュレーションのための機能を提供します。
    • これは、超過領域および等高線の信頼領域を構築するためのツールを提供するExceedanceTools によって拡張されています。
    • gear パッケージは、一般的な地理統計学的手法をクリーンで直接的かつ効率的に実装しており、SpatialTools の準再起動と言われています。
    • sgeostatパッケージも用意されています。
    • 同じ一般的な局所領域内は、スプライン補間のためのakimaパッケージと三角測量のためのdeldirtripackのパッケージがあります。
    • MBAのパッケージには、マルチレベルBスプラインで散乱データ補間を提供します。
    • また、tgpパッケージとspatialCovarianceに部分的に構築するregressパッケージ、長方形のデータに対して空間共分散行列の計算をサポートしているspatialCovarianceパッケージがある。
    • Stemパッケージは、時空間パラメトリックブートストラップを使用してパラメータの標準誤差の推定、EMアルゴリズムを用いて時空間モデルのパラメータの推定を提供する。
    • FieldSimは別のランダムフィールドシミュレーションパッケージです。
    • SSNは、インストリーム距離に基づいてモデルを含むストリーム・ネットワーク上のデータのための地球統計モデリングである。モデルは、移動平均の構造を使用して作成されます。共変量を含めた空間線形モデルは、MLまたはREMLとフィットすることができます。マッピングや他のグラフィカル関数が含まれています。
    • ipdw は、逆パスの距離の重み付けを経由して補間ジオリファレンスポイントデータの機能を提供します。 ランドスケープの中にバリアの沿岸海洋用途に有用は、ユークリッド距離で補間を排除です。
    • RSurveyは、空間的に分散されたデータのための処理プログラムとして使用され、誤り訂正及びデータの視覚化が可能であることもできる。
  • 疾患マッピングおよび面積データ分析:
    • DClusterは病気の空間クラスターの検出のためのパッケージです。建物の隣接リストと空間的重み、モランのIのような面積のデータのための空間的自己相関のためのテスト、およびこのようなSARやCARなどのフィッティング空間回帰モデルのための機能のための基本的な機能を提供するspdepパッケージに依存、拡張します。これらのモデルは、空間依存性は、既知の重みによって記述することができると仮定する。
    • SpatialEpiパッケージには、ベイジアンクラスタ検出を含むクラスタの検出と病気のマッピング機能の実装を提供し、地層をサポートしています。
    • smerc パッケージは、クラスタ検出に焦点を当て、データ領域データの分析のための統計的方法を提供します。
    • diseasemapping パッケージは、人口とケースデータ、標準化発生率の計算、およびINLAを使用してBYMモデルを当てはめるフォーマットを提供しています。
    • ポリゴンオブジェクトの地域化は、AMOEBAによって提供されます。Getis-Ordローカル統計量を使用して空間クラスタを算出する機能。これは、マップ上に不規則なクラスター(ecotopes)を検索し、spdepでのスケーターによる。
    • segOasisR パッケージには、空間的な分離を測定するための機能を提供します。
    • OasisR はインデックスをテストするためにモンテカルロシミュレーションを含みます。
    • spgwrパッケージには、可能な非定常性を探索するための地理的加重回帰法の実装が含まれています。
    • gwrrパッケージには、地理的に加重回帰(GWR)の機種に適合し、GWRモデルで共線性を診断し、修復するためのツールを持っています。また、地理的に重み付きリッジ回帰(GWRR)と地理的に重み付けされたlasso(GWL)のモデルに適合します。
    • GWmodelパッケージには、地理的に重み付けされたモデルを計算するための関数が含まれています。
    • lctools パッケージは、キー空間統計を計算するためのユーザーフレンドリーなツールを習得し、実際のデータに空間分析の簡単なだけでなく、高度な方法を適用する簡単な研究者や教育者を提供しています。これらを含める:ローカルピアソンおよび地理的加重ピアソン相関係数、空間的不平等対策(ジニ、空間ジニ、LQ、焦点LQ)、空間的自己相関(グローバルとローカルモーランI)いくつかの地理的加重回帰技術および他の空間分析ツール(他の地理的加重統計)。 このパッケージは、主にモンテカルロシミュレーションに基づいて計算各統計の重要性を測定するための機能が含まれています。
    • sparrパッケージには、相対的なリスクへの別のアプローチを提供します。
    • CARBayesパッケージには、ベイズ階層的な空間面積単位モデルを実装しています。このようなモデルでは、空間的相関が条件付き自己回帰(CAR)事前分布が割り当てられたランダムな効果のセットによってモデル化される。含まれるモデルの例はBYMモデルだけでなく、最近開発された局所的な空間平滑化モデルである。
    • glmmBUGSパッケージには、WinBUGSへの空間的なモデルを渡す便利な方法です。
    • spaMMパッケージには、空間的にランダムな効果のための基本的なモデルとしてMatern相関関数を使用して、空間的なGLMMsに適合します。
    • PReMiuMパッケージは、ディリクレ過程ベイジアンクラスタリングモデルであるプロファイル回帰のためのものです。残差内の任意の空間的相関を考慮するために固定効果(すなわち、特定の非クラスタ、パラメータのグローバルである)に含めることができる空間CAR用語を提供する。
    • spacom パッケージは、空間的に重み付けされたコンテクストデータを構築して利用するためのツールを提供し、さらに、結果的に空間的に重み付けされたコンテクストデータを、マルチレベルモデリングの目的のために個人レベルのプレディクタおよび結果変数と組み合わせることを可能にします。
    • geospacomパッケージは、形状ファイルから距離行列をgneratesと空間的に重み付けされたマルチレベルの分析結果を示している。
    • 空間生存分析は、spatsurv (パラメトリック比例ハザード空間生存モデル用ベイズ推定)とspBayesSurv (ベイジアンモデリングと空間相関生存データの分析)パッケージによって提供されています。
    • spselect パッケージは、回帰モデルの共変量の空間スケールを選択するための前方階段回帰、増分前方階段回帰、最小角度回帰(LARS)、およびラッソモデルに基づくモデリング関数を提供します。
  • 空間回帰:
    • 空間回帰の機能の選択が可能なサポートに依存します。データ点支持することを特徴とし、空間処理が連続している場合は、地球統計学的方法を用いて、又はnlmeパッケージに機能することができる。
    • 支持体は面積であり、空間的なプロセスは、連続として扱われていない場合、spdepパッケージで提供される機能を使用することができる。このパッケージには、空間計量経済学の機能を提供すると見られ、そして、上記のように、建物の隣接リストと空間的重み、モランのIのような面積のデータのための空間的自己相関のためのテスト、およびフィッティング空間回帰モデルの機能のための基本的な機能を提供することができます。このようなラグランジュ乗数テストなど当てはめ線形モデルのためのローカル・モランのIおよび診断ツール、などの空間関連の地元指標のフルレンジを提供します。最尤法を使用して取り付けることができる空間回帰モデルは、空間ラグモデル、空間的誤差モデル、および空間ダービンモデルを含む。最尤フィットのための空間二段階最小二乗法とモーメント推定器の一般的な方法は、代替であるが、より大きなデータセットの場合、スパースマトリックス技術が、使用され得る。
    • GMMを使用する場合、sphetは、自己相関と不均一の両方を収容するために使用することができる。空間的なカウント回帰をspatcountsすることで、カスタムMCMCを使用して提供される。
    • McSpatialは、局所的に加重回帰、セミパラメトリック条件付きパラメトリック回帰、フーリエ変換と3次スプライン関数、GMMと線形化された空間ロジットおよびプロビット、K-密度関数と反事実、ノンパラメトリック分位回帰と条件付き密度関数、分位回帰のマシャド・マタ分解、空間ARモデル、リピート販売モデル、および条件付きパラメトリックロジットとプロビットのための機能を提供します。
    • splmパッケージには、最尤とGMによって空間パネルデータをフィッティングするためのメソッドが用意されています。
    • 2つの小型パッケージのS2slsspanel は、splm の機能のほとんどなしに別の実装を提供します。
    • HSAR パッケージには、ベイズマルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)のアルゴリズムに基づいて階層的空間自己回帰モデル(HSAR)を提供します。
    • spatialprobitは空間自己回帰、プロビットモデル(SARへのプロビットモデル)の可能性のベイズ推定を行う。
    • ProbitSpatial パッケージは、大きなデータセットにフィッティング二項空間プロビットモデルのための方法を提供します。空間的自己回帰(SAR)と空間誤差(SEM)プロビットモデルが含まれています。
  • 生態学的分析:
    • 生態学や環境データを分析するための多くのパッケージがあります。それらは、環境科学の探索やユークリッドのメソッドのade4、動物による生息地の選択を分析するためのパッケージ(adehabitatHRadehabitatHSadehabitatLT、およびadehabitatMA)のadehabitatファミリ、時空系列の調節、分解および分析のためのpastecs、地域社会や植生生態学者のための調整方法や他の有用な機能のためのvegan、他の貢献のパッケージで他の多くの機能が含まれています。一つは、このようなtripが提供するクラスに基づくtripEstimationです。
    • ncfは最近、CRANに入り、空間的なノンパラメトリック共分散機能の範囲を提供しています。
    • rangeMapperは、種の範囲(エクステント・オブ・発生)マップ、生物多様性の容易な生成のために、主にツール(種も豊富)、または生活史形質マップを操作するためのパッケージです。
    • siplabパッケージには、空間的に明示的な個々のベースの植生モデルを実験するためのプラットフォームです。
    • ModelMapは、基礎となるGISデータを使用してモデルを作成するために他のパッケージに基づいています。
    • SpatialPosition は、空間位置モデルを計算します。:スチュワートポテンシャル、ライリーの集水域、ハフの集水域。
    • Watersheds パッケージは、流域の集約と空間排水ネットワーク分析のための方法を提供します。
    • CRANパッケージではない-Rcitrusは-植物病害の発生率の空間分析のためである。
    • Genelandパッケージには、データセット内の個体数を推定し、その空間的な組織化を描写するために、両方の地理的および遺伝情報を利用するためにfieldsRandomFieldsを使用しています。
    • ngspatialパッケージには、空間データ、特に非ガウス面積のデータを分析するためのツールを提供します。これは、ヒューズとハラン(2013)のスパース空間一般化線形混合モデルとCarageaとカイザー(2009)の中心にautologisticモデルをサポートします。
    • Environmetricsタスクビューは、関連する関数とパッケージのより完全な調査が含まれています。
R言語 CRAN Task View:空間データの分析

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