Ubuntu apt-getでRがアップデートできない場合の対処法

apt-getコマンドでRがアップデートできない理由はいくつか考えられる。ここでは、アップデートできない原因別に対処法をお伝えする。

接続できない

「apt-get update」コマンドを実行すると、Rのミラーサイトとの接続で止まる場合がある。

例えば、国内ミラーサイトのhttps://cran.ism.ac.jp/を使用している場合、一度このリンクをクリックしてほしい。ページが開かない場合は、一時的に使えないようになっている。

この場合の対処法は、主に2つある。

1つ目は、様子を見ることだ。ほとんどの場合、2～3日程度でミラーサイトが使えるようになるだろう。
2つ目は、ミラーサイトを変更することだ。ミラーサイトの変更は、UbuntuにRをインストールするための手順を参考にしてほしい。

GPGエラー

2015年10月21日現在、Ubuntuで「UbuntuにRをインストールするための手順」のような方法でRをインストールした場合に、「apt-get update」コマンドでRがアップデートされなくなっている。

まず、実際にapt-getコマンドを試してみると、次のようにGPGエラーとなって、アップデートできなかったことが通知される。

$ sudo apt-get update

W: GPG エラー: http://cran.ism.ac.jp trusty/ Release: 以下の署名が無効です: KEYEXPIRED 1445181253 KEYEXPIRED 1445181253 KEYEXPIRED 1445181253

そこで、keyを確認してみると、どうやら期限切れのようだということが分かる。

$ apt-key list

pub   2048R/E084DAB9 2010-10-19 [満了: 2015-10-18]
uid                  Michael Rutter 

原因が分かったので、対処法としてはkeyを新しく取り直せばよい。

$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv E084DAB9

gpg: 鍵E084DAB9をhkpからサーバーkeyserver.ubuntu.comに要求
gpg: 鍵E084DAB9:“Michael Rutter ”新しい署名を2個
gpg: 処理数の合計: 1
gpg:         新しい署名: 2

keyを追加してアップデートを実行する。これで、GPGエラーは出ないはずだ。

$ gpg --export --armor E084DAB9 | sudo apt-key add - && sudo apt-get update

最後に、keyを確認してみると、延長されていることが分かる。

$ apt-key list

pub   2048R/E084DAB9 2010-10-19 [満了: 2020-10-16]
uid                  Michael Rutter 
sub   2048R/1CFF3E8F 2010-10-19 [満了: 2020-10-16]